鉴定人类供心保存过程中的细胞类型及MR表达
确定冷保存人类心脏中哪些细胞类型表达MR,以及MR表达与细胞功能状态的关系。
对冷保存(4°C)的人类供心(HTK保存)进行单细胞转录组测序,鉴定心肌细胞、成纤维细胞、内皮细胞等,并分析MR在心肌细胞亚群中的差异表达。
Mineralocorticoid receptor phase separation modulates cardiac preservation
证据层级包括体外蛋白相分离(turbidity、FRAP)、细胞实验、小鼠遗传模型(心肌细胞MR敲除及AAV回补)、离体心脏灌流、猪及人类供体心脏实验,并包含功能验证和机制验证。
小鼠离体心脏灌流模型(Langendorff) 小鼠异位心脏移植模型(颈动脉-颈静脉) 猪离体心脏灌流模型 人类供体心脏离体灌流模型
MR相分离依赖N端IDR区域,缺失IDR的MRΔIDR不能形成凝聚体且改善心脏功能 canrenone(50μM)添加到HTK保存液中抑制MR相分离并改善供心功能 心肌细胞特异性MR敲除(Myh6CreERT2;MRfl/fl)改善心脏保存质量 人类供心冷保存10小时与CTnI水平及代谢物变化相关
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定冷保存人类心脏中哪些细胞类型表达MR,以及MR表达与细胞功能状态的关系。
对冷保存(4°C)的人类供心(HTK保存)进行单细胞转录组测序,鉴定心肌细胞、成纤维细胞、内皮细胞等,并分析MR在心肌细胞亚群中的差异表达。
验证MR在心肌细胞中的功能缺失是否改善冷保存后的心脏功能。
使用他莫昔芬诱导心肌细胞特异性MR敲除小鼠(Myh6CreERT2;MRfl/fl),通过离体心脏灌流和异位心脏移植模型评估心脏收缩和舒张功能,并检测心肌损伤标志物。
确定MR在冷保存条件下是否发生液-液相分离,并识别其关键结构域。
通过PONDR预测MR无序区域,体外纯化GFP-MR蛋白进行浊度分析、液滴成像、融合和FRAP实验;细胞实验(NMCM、HEK293)确认核内凝聚体动态;构建缺失IDR的突变体验证其关键作用。
在心肌细胞中表达全长MR或缺失IDR的MR,以验证相分离是否介导心脏保存损伤。
使用AAV9向心肌细胞特异性MR敲除小鼠(Myh6CreERT2;MRfl/fl)递送全长MR、MRΔIDR或荧光素酶对照,经历冷保存后离体灌流评估心脏功能及损伤标志物。
测试MR拮抗剂canrenone(及其同类药物)是否能改善冷保存后的心脏功能。
将canrenone(50μM)添加到HTK保存液中,对小鼠、猪和人类供心进行不同时长冷保存,通过离体灌流或移植模型评估心脏功能、损伤标志物及代谢指标。
阐明canrenone抑制MR相分离后对基因组结合和代谢的影响。
对人类供心进行CUT&RUN测序分析MR结合位点,并进行代谢组学分析,比较HTK±canrenone处理后的变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 心脏保存 | HTK保存液 | -- | -- |
| 坎利酮 | -- | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胰蛋白酶-EDTA | -- | -- | |
| 胶原酶II | -- | -- | |
| 马血清 | -- | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 腺病毒包装 | Ad-GFP腺病毒 | -- | -- |
| Ad-GFP-MR腺病毒 | -- | -- | |
| 质粒构建 | pET30载体 | -- | -- |
| 蛋白表达 | 异丙基-β-D-硫代半乳糖苷 | -- | -- |
| 蛋白纯化 | Ni-NTA琼脂糖 | -- | -- |
| Amicon Ultra离心过滤器 | Sigma | -- | |
| 氯化钠 | -- | -- | |
| 二硫苏糖醇 | -- | -- | |
| 咪唑 | -- | -- | |
| 相分离检测 | 聚乙二醇8000 | -- | -- |
| 甘油 | -- | -- | |
| 浊度测量酶标仪 | Promega GloMax | -- | |
| 显微镜 | Nikon A1共聚焦显微镜 | Nikon | -- |
| BZ-X800显微镜 | Keyence | -- | |
| LSM 980显微镜 | Zeiss | -- | |
| 免疫荧光 | 抗NR3C2抗体 | Sigma | AV45599 |
| 抗8OHdG抗体 | Santa Cruz | sc393871 | |
| 抗HDAC1抗体 | CST | 34589 | |
| 抗Brd4抗体 | Abclonal | A20019 | |
| 抗MR抗体(CST) | CST | 58883S | |
| Alexa Fluor 488/647二抗 | -- | -- | |
| 抗淬灭封片剂 | Thermofisher Scientific | P36930 | |
| Western blot | PVDF膜 | -- | -- |
| α-微管蛋白抗体 | CST | 3873 | |
| Bcl2抗体 | CST | 3498 | |
| Cleaved Caspase 3抗体 | Abclonal | A2156 | |
| 磷酸化JNK抗体 | CST | 9251 | |
| 总JNK抗体 | CST | 9252 | |
| 磷酸化Erk1/2抗体 | CST | 4370 | |
| 总Erk1/2抗体 | CST | 4696 | |
| IRDye 680RD驴抗小鼠IgG | LI-COR | 926-68072 | |
| IRDye 800CW驴抗兔IgG | LI-COR | 926-32213 | |
| 过氧化物酶标记驴抗小鼠IgG | Jackson ImmunoResearch | 715-035-150 | |
| 过氧化物酶标记驴抗兔IgG | Jackson ImmunoResearch | 715-035-152 | |
| AAV包装 | AAV9质粒 | Addgene | 86558 |
| 他莫昔芬 | -- | -- | |
| 肝素 | -- | -- | |
| 离体灌流 | Langendorff装置 | ADInstruments | -- |
| Radnoti灌流装置 | ADInstruments | -- | |
| Krebs-Henseleit缓冲液 | -- | -- | |
| Miller电导导管 | -- | -- | |
| 试剂盒 | MILLIPLEX试剂盒 | Sigma-Aldrich | MCYTMAG, MCVD2MAG, HCVD1MAG |
| 渗透压测量 | Precision Systems Touch Micro-Osmette渗透压计 | Precision Systems | Model 6002 |
| 细胞转染 | Lipofectamine转染试剂 | -- | -- |
| 细胞培养 | 山梨醇 | -- | -- |
| 保存 | Perfadex保存液 | -- | -- |
| CUT&RUN | Epicypher CUT&RUN试剂盒 | Epicypher | 14-1048 |
| NEBNext Ultra II DNA文库制备试剂盒 | NEB | E7103 | |
| 测序 | NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- |
| 代谢组学 | Acuity超高效液相色谱系统 | Waters | -- |
| MaXis II四极杆飞行时间质谱仪 | Bruker | -- | |
| ACUITY UPLC HSS T3色谱柱 | Waters | -- | |
| ACUITY UPLC BEH Amide色谱柱 | Waters | -- | |
| 统计分析 | Prism 10.0统计软件 | GraphPad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型建立 | 心肌细胞特异性MR敲除小鼠(Myh6CreERT2;MRfl/fl)的构建及他莫昔芬诱导条件(剂量、时间)。 阅读提示:Methods: Murine ex-vivo heart perfusion |
| 冷保存条件 | HTK保存液成分、冷保存温度(4°C)、保存时间(小鼠16小时,猪4/10小时,人类10小时)。 阅读提示:Methods: Procurement and preparation; Murine ex-vivo heart perfusion; Porcine and human ex-vivo heart perfusion |
| 药物处理 | canrenone浓度(50μM)、是否加入HTK保存液、对照组设置(vehicle)。 阅读提示:Methods: Procurement and preparation; Results: Drug inhibition of MR improves donor heart function |
| 相分离检测 | 体外蛋白浓度(如16μM)、PEG8000浓度(10%)、FRAP参数(激光强度40%、采集时间60秒)。 阅读提示:Methods: Turbidity Measurements; In vitro droplet imaging and FRAP |
| 离体灌流功能评估 | 灌注液(Krebs-Henseleit缓冲液)、灌注时间(1小时)、左室舒张末压设定(~8mmHg)、测量参数(max dP/dt, min dP/dt)。 阅读提示:Methods: Murine ex-vivo heart perfusion; Porcine and human ex-vivo heart perfusion |
| 移植模型 | 供体心脏冷保存时间(16小时)、受体小鼠品系(C57BL/6J)、移植后测量时间(24小时)、血流动力学测量方法。 阅读提示:Methods: Murine heterotopic heart transplantation |
| 分子检测 | 抗体:MR(Sigma AV45599或CST 58883S)、8-OHdG(Santa Cruz sc393871)、HDAC1(CST 34589)、Brd4(Abclonal A20019);Western blot抗体:α-tubulin、Cleaved Caspase 3等。 阅读提示:Methods: Fluorescence immunohistochemistry; Western blotting |