建立原代睾丸体细胞培养
从冷冻保存的患者睾丸组织中获得可扩增的体细胞。
解冻冷冻组织,酶解消化,接种培养,扩增传代。
Human iPSCs derived from cryopreserved testicular somatic cells enable germline regeneration in childhood cancer survivors
研究包含体外细胞模型(hiPSCs及hPGCLCs)和患者来源样本,并有功能验证(三胚层分化、hPGCLC特化)和机制验证(转录组分析),证据层级独立多样。
原代睾丸体细胞 人诱导多能干细胞(hiPSC)系NFKI001和NFKI002 人类原始生殖细胞样细胞(hPGCLCs)
患者年龄及治疗史(6.3岁和6.2岁,CED分别为4814 mg/m2和16000 mg/m2) 重编程方法:非基因组整合mRNA(StemMACS™ iPSC mRNA Reprogramming Kit) hPGCLC特化条件:两种方案(PreME和HENSM),特定细胞密度和细胞因子浓度 样本量:每个条件两次重复(RNA-seq) 核型分析:正常男性核型(46,XY)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从冷冻保存的患者睾丸组织中获得可扩增的体细胞。
解冻冷冻组织,酶解消化,接种培养,扩增传代。
使用非基因组整合方法将体细胞重编程为多能干细胞。
使用StemMACS™ mRNA Reprogramming Kit进行mRNA转染,联合小分子抑制剂,手动挑取克隆并扩增。
验证所得hiPSC的多能性和基因组稳定性。
免疫荧光检测多能性标记OCT4和SOX2,三胚层分化验证分化潜能,G显带核型分析。
将患者特异hiPSCs分化为早期生殖细胞。
通过两种方案(PreME和HENSM)获得前体细胞,形成拟胚体并在细胞因子诱导下分化5天。
确认hPGCLC身份并评估效率。
免疫荧光检测SOX17、TFAP2C、OCT4,流式细胞术检测TNAP和PDPN阳性细胞比例。
验证hiPSCs和hPGCLCs的转录组特征。
进行批量RNA测序,与已发表数据集比较,PCA和热图分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Thermo Fisher Scientific | #10569010 |
| 胎牛血清 | Sigma-Aldrich | #F7524 | |
| 青霉素-链霉素 | Thermo Fisher Scientific | #15140122 | |
| 基质胶 | Corning | #354230 | |
| 贴壁因子1x | Thermo Fisher Scientific | #S006100 | |
| CELLBANKER1培养基 | Zenogen Pharma | #11910 | |
| hiPSC诱导 | StemMACS™ iPSC mRNA重编程试剂盒 | Miltenyi Biotec | #130-132-990 |
| EPZ-5676 | MedChemExpress | #HY-15593 | |
| SGC-CBP30 | MedChemExpress | #HY-15826 | |
| hiPSC培养 | Essential 8培养基 | Thermo Fisher Scientific | #A1517001 |
| 重组人层粘连蛋白-521 | Thermo Fisher Scientific | #A29248 | |
| 玻连蛋白 | Thermo Fisher Scientific | #A14700 | |
| TrypLE™ | Thermo Fisher Scientific | #12604013 | |
| 免疫染色 | Triton X-100 | Sigma-Aldrich | #T8787 |
| 正常驴血清 | ImmunoReagents | #SP-072-VX2 | |
| 抗OCT3/4抗体 | Santa Cruz Biotechnology | #sc-8628 | |
| 抗SOX2抗体 | Abcam | #ab97959 | |
| 驴抗山羊IgG Alexa Fluor™ 488 | Invitrogen | #A11055 | |
| 驴抗兔IgG Alexa Fluor™ 568 | Invitrogen | #A10042 | |
| DAPI | Sigma-Aldrich | #D9542 | |
| 驴抗小鼠IgG Alexa Fluor™ 488 | Invitrogen | #A21202 | |
| 驴抗小鼠IgG Alexa Fluor™ 647 | Invitrogen | #A31571 | |
| 三胚层分化 | STEMdiff™三胚层分化试剂盒 | STEMCELL Technologies | #05230 |
| 抗PAX6抗体 | Thermo Fisher Scientific | #42-6600 | |
| 抗Nestin抗体 | Merck Millipore | #MAB5326 | |
| 抗Brachyury抗体 | Cell Signaling Technology | #81694 | |
| 抗NCAM1抗体 | Cell Signaling Technology | #3576 | |
| 抗FOXA2抗体 | Thermo Fisher Scientific | #710730 | |
| 抗SOX17抗体 | R&D Systems | #AF1924 | |
| hPGCLC特化 | RPMI 1640培养基 | Thermo Fisher Scientific | #21870076 |
| B27补充剂 | Thermo Fisher Scientific | #17504044 | |
| L-谷氨酰胺 | Thermo Fisher Scientific | #25030081 | |
| 激活素A | Thermo Fisher Scientific | #120-14-10UG | |
| CHIR99021 | Tocris | #4423 | |
| Neurobasal培养基 | Thermo Fisher Scientific | #21103049 | |
| DMEM/F-12培养基 | Thermo Fisher Scientific | #21331020 | |
| N-2补充剂 | Thermo Fisher Scientific | #17502048 | |
| 二甲基2-氧代戊二酸 | Sigma-Aldrich | #349631 | |
| L-抗坏血酸2-磷酸倍半镁盐水合物 | Sigma-Aldrich | #A8960 | |
| 人白血病抑制因子 | Thermo Fisher Scientific | #300-05-25UG | |
| PD0325901 | Axon Medchem | #1408 | |
| XAV939 | Axon Medchem | #1527 | |
| BIRB0796 | Axon Medchem | #1358 | |
| Gö6983 | Axon Medchem | #2466 | |
| CGP77675 | Axon Medchem | #2097 | |
| Accutase | Thermo Fisher Scientific | #A1110501 | |
| 骨形态发生蛋白4 | Thermo Fisher Scientific | #AF-120-05ET | |
| 干细胞因子 | Thermo Fisher Scientific | #300-07-50UG | |
| 表皮生长因子 | R&D Systems | #236-EG | |
| 超低吸附96孔板 | Sarstedt | #83.3926 | |
| 免疫荧光 | 抗TFAP2C抗体 | Abcam | #ab76007 |
| 抗OCT4抗体 | BD Biosciences | #611203 | |
| OCT包埋剂 | Sakura Finetek | #4583 | |
| ProLong-Gold防淬灭剂 | Thermo Fisher Scientific | #P36930 | |
| 流式细胞术 | Alexa Fluor 488抗TNAP抗体 | BD Biosciences | #561495 |
| PE/Cyanine7抗PDPN抗体 | BioLegend | #337013 | |
| SH800细胞分选仪 | SONY | -- | |
| RNA提取 | Quick-RNA微量提取试剂盒 | Zymo Research | #R2060 |
| RNA裂解缓冲液 | Zymo Research | #R1060-1-100 | |
| RNA-seq文库制备 | Nextera XT试剂盒 | Illumina | #FC-131-1024 |
| AMPure XP磁珠 | Beckman Coulter | #A63881 | |
| Qubit 1X高灵敏度DNA定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | #Q33230 | |
| 2100生物分析仪 | Agilent | -- | |
| RNA-seq测序 | NovaSeq X Plus测序平台 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 原代细胞培养 | 患者年龄、治疗史、精原细胞耗竭程度(S/T和Z-score)、组织处理细节 阅读提示:Materials and methods: 'Testicular tissue processing and primary testicular tissue cell expansion' |
| 重编程 | 细胞密度、转染时间、小分子抑制剂浓度(EPZ-5676和SGC-CBP30) 阅读提示:Materials and methods: 'hiPSC generation and maintenance' |
| hiPSC验证 | 核型分析结果、多能性标记表达、三胚层分化能力 阅读提示:Materials and methods: 'Karyotyping', 'Immunocytochemical staining for pluripotency markers', 'Pluripotency validation via trilineage differentiation capability' |
| hPGCLC特化 | 前体细胞类型和密度、细胞因子浓度、分化时间 阅读提示:Materials and methods: 'hPGCLC specification' |
| hPGCLC分析 | 流式细胞术抗体、分选策略、效率计算方法 阅读提示:Materials and methods: 'hPGCLC sorting and analysis' |
| RNA-seq | RNA提取方法、文库制备、测序平台、生物信息学分析流程 阅读提示:Materials and methods: 'RNA-sequencing libraries preparation', 'Bioinformatics analysis' |