单细胞表面蛋白质组学鉴定AtpTreg
检测并比较ICI-IA患者与对照组的免疫细胞表面蛋白表达差异,以鉴定疾病特征性细胞亚群。
对ICI-IA、RA-CA和ICI-NC患者外周血CD45+ PBMC进行单细胞表面蛋白质组学分析,通过UMAP聚类和差异表达分析。
IL-6 receptor blockade impedes proinflammatory atypical Treg subset associated with immune checkpoint inhibitor-induced inflammatory arthritis
整合单细胞多组学、体外功能实验(抑制实验、共培养)、患者纵向队列及抗IL-6R治疗干预,多层次验证机制与临床关联。
ICI-IA患者外周血单核细胞 MH7A人滑膜细胞系 胃癌患者队列 健康对照外周血T细胞
AtpTreg细胞频率与关节炎严重程度(MRI-WIPE、CDAI)及总生存期相关 抗IL-6R治疗后AtpTreg比例下降 Treg抑制实验证实AtpTreg抑制功能受损 共培养实验证实AtpTreg促进滑膜细胞增殖及MMP3/10表达
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测并比较ICI-IA患者与对照组的免疫细胞表面蛋白表达差异,以鉴定疾病特征性细胞亚群。
对ICI-IA、RA-CA和ICI-NC患者外周血CD45+ PBMC进行单细胞表面蛋白质组学分析,通过UMAP聚类和差异表达分析。
在转录水平验证AtpTreg的独特基因表达谱和通路激活情况。
从患者外周血中分离CD4+CD25+CD127−细胞,进行单细胞RNA测序,分析聚类和差异表达基因。
验证AtpTreg是否丧失免疫抑制功能并促进滑膜细胞炎症。
通过Treg抑制实验评估AtpTreg对Tresp增殖的抑制能力;通过共培养实验评估AtpTreg对滑膜细胞系MH7A的炎症因子分泌和增殖的影响。
探究AtpTreg在外周血、滑液和肿瘤间的分布和克隆关系。
从患者外周血、滑液和肿瘤组织分离Treg,进行单细胞表面蛋白质组学、VDJ-TCR测序和分泌蛋白质组学分析。
评估AtpTreg频率与关节炎严重程度和癌症生存的相关性。
对胃癌患者(cohort 2)进行12个月随访,评估关节炎活动度(CDAI、CRP、MRI-WIPE)和30个月总生存期。
验证托珠单抗(抗IL-6R)治疗是否减少AtpTreg并改善临床结局且不损害抗肿瘤免疫。
纳入18名接受托珠单抗治疗的ICI-IA患者,比较治疗前后AtpTreg比例和临床指标变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco | #11875093 |
| 胎牛血清 | Gibco | #10099141 | |
| Normocin | InvivoGen | #ant-nr-1 | |
| 脱氧核糖核酸酶I | Roche | #4716728001 | |
| 胶原酶IV | Worthington Biochem | #LS004186 | |
| 细胞分离 | Percoll密度梯度培养基 | Cytiva | #17-0891-01 |
| Ficoll-Paque加梯度 | Cytiva | #17144003 | |
| LeucoSep管 | Greiner Bio-One | #227290 | |
| 流式分析 | 人Fc受体阻断剂 | Miltenyi Biotec | #130-059-901 |
| 细胞分选 | 调节性T细胞分离试剂盒II | Miltenyi Biotec | 130-094-775 |
| 单细胞测序 | BD Rhapsody Express系统 | BD Biosciences | #633707 |
| BD AbSeq抗体-寡核苷酸预混液 | BD Biosciences | 未明确说明 | |
| BD Rhapsody靶向mRNA扩增试剂盒 | BD Biosciences | #633774 | |
| 免疫反应面板 | BD Biosciences | #633750 | |
| dsDNA检测试剂盒 | ThermoFisher | #Q32851 | |
| 高灵敏度D5000 ScreenTape | Agilent | 未明确说明 | |
| 单细胞分泌蛋白质组学 | 抗CD3抗体(OKT3) | ThermoFisher | 未明确说明 |
| 抗CD28抗体 | ThermoFisher | 未明确说明 | |
| 白细胞介素-2 | Biolegend | 未明确说明 | |
| Treg抑制实验 | 人全T细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-096-535 |
| TexMACS培养基 | Miltenyi Biotec | 130-097-196 | |
| CFSE细胞增殖试剂盒 | Biolegend | 423801 | |
| Immunocult人CD3/CD28 T细胞激活剂 | Stemcell Technologies | 10971 | |
| 细胞实验 | MH7A细胞 | Procell system | #CL-0747 |
| CCK-8溶液 | Beyotime | #C0038 | |
| 蛋白质检测 | OLINK Explore-3072面板 | OLINK | 未明确说明 |
| MMP-10和MMP-3 ELISA试剂盒 | Abcam; Wuhan Boster | #ab100602; 未明确说明 | |
| 细胞分选 | CD137微珠 | Miltenyi Biotec | 130-093-476 |
| 流式分析 | 抗CD3-APC Cy7抗体 | BioLegend | 未明确说明 |
| 抗CD4-BV510抗体 | BioLegend | 未明确说明 | |
| 抗CD137-BV421抗体 | BD | 未明确说明 | |
| 抗CD127-Spark.NIR.685抗体 | BioLegend | 未明确说明 | |
| 抗CD25-BB515抗体 | BD | 未明确说明 | |
| 抗FOXP3-PE抗体 | BD | 未明确说明 | |
| Cytek Aurora光谱流式细胞仪 | Cytek | 未明确说明 | |
| 细胞分选 | BD FACSAria II流式细胞仪 | BD | 未明确说明 |
| 药物处理 | 肿瘤坏死因子-α | 未明确说明 | 未明确说明 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 样本采集 | 外周血、滑液和肿瘤样本采集时间点(ICI-naive、preclinical、onset、follow-up) 阅读提示:Methods 'Sampling procedure of tumor, blood, and synovial fluid' |
| 单细胞测序 | 细胞分选策略(CD4+CD25+CD127−)、单细胞测序平台(BD Rhapsody) 阅读提示:Methods 'Single-cell VDJ repertoire, surface proteomic, and RNA sequencing' |
| Treg抑制实验 | Tresp与Treg共培养比例(1:1, 4:1, 8:1)、刺激物(Immunocult CD3/CD28激活剂)、培养时间(5天) 阅读提示:Methods 'Treg suppression assay' |
| 共培养实验 | MH7A细胞处理(TNF-α刺激)、共培养条件、检测指标(MMP3/10、CCK-8) 阅读提示:Methods 'Cellular experiments' |
| 临床评估 | 关节炎评估指标(CDAI、CRP、MRI-WIPE)、时间点(onset、3月、6月、12月) 阅读提示:Methods 'Clinical assessment' and 'Magnetic resonance imaging scoring' |
| 治疗干预 | 托珠单抗治疗方案(剂量、频率) 阅读提示:文中未明确说明具体方案,需参考原始文献或补充材料 |