炎症小体驱动的肠道干细胞分化程序可抵抗沙门氏菌感染

An inflammasome-driven differentiation program in intestinal stem cells protects against Salmonella infection

作者信息S Lebon, A Habshush Menachem, N Davidzohn, A Katz, N Wigoda, T Braun, D Yahalomi, R Rotkopf, V Holiar, T Dadosh, S Levin-Zaidman, N Dezorella, I Goliand, M Kupervaser, S Leebhoff, N Blumberger, D Hoffman, M Grunewald, Y Levin, Y Haberman, M Hofree, M Biton
PMID42120792
发布时间2026-07
DOI10.1038/s41590-026-02514-6

摘要

肠道干细胞对于维持上皮更新和屏障完整性至关重要,但它们在协调抵抗肠道病原体中的作用尚不清楚。本研究鉴定了一种干细胞固有的免疫机制,其中Lgr5+肠道干细胞能够检测细胞内沙门氏菌,并激活依赖炎症小体的分化程序。通过使用荧光标记的沙门氏菌、单细胞转录组学、谱系示踪、类器官模型和遗传扰动,我们发现被入侵的肠道干细胞通过ASC介导的炎症小体信号通路,迅速重编程为富含抗菌肽的潘氏细胞。这种命运转换增强了上皮的抗菌能力,并限制了病原体在隐窝中的持续存在。该反应是沙门氏菌特异性的,并且在人类肠道类器官中保守。此外,入侵相关的转录特征在克罗恩病患者的肠道干细胞中富集。我们的研究结果表明,肠道干细胞可作为细菌入侵的主动传感器,并通过炎症小体信号启动上皮重塑,凸显了干细胞可塑性作为一种前沿的先天免疫策略。

实验方法

产品清单

名称品牌货号
SH800索尼分选仪SonySH800
Cytoflex分析仪--Cytoflex
索尼分选仪Sony--
Chromium单细胞RNA测序平台10x genomics--
Next GEM G芯片10x genomicsNext GEM Chip G
Chromium Controller仪器10x genomicsChromium Controller
NovaSeq 6000测序仪IlluminaNovaSeq 6000
S1 100循环试剂盒IlluminaS1 100 cycles
QuantStudio 12K Flex软件Thermo Fisher ScientificQuantStudio 12K flex
阿利新蓝和PAS试剂盒ScyTek LaboratoriesAPS-1
Sub-x封片剂Leica--
TUNEL检测试剂盒Abcamab66110
RNAScope多重荧光试剂盒Advanced Cell Diagnostics--
LSM900共聚焦显微镜ZeissLSM900
EVOS M5000成像系统--EVOS M5000
Leica EM UC7超薄切片机LeicaEM UC7
Tecnai SPIRIT透射电子显微镜Thermo Fisher ScientificSPIRIT
Gatan OneView相机GatanOneView
VUTARA SR352系统BrukerSR352
奥林巴斯Olympus--
FEI Tecnai SPIRIT透射电子显微镜Thermo Fisher ScientificSPIRIT
ibidi µ-Slide玻璃底腔室ibidi--
蔡司LSM900共聚焦显微镜ZeissLSM900
IntestiCult类器官生长培养基Stemcell06010
IntestiCult分化培养基Stemcell100-0214
pSpCas9(BB)-2A-GFP (PX458)质粒--PX458
纳升级超高效液相色谱仪BrukernanoElute2
捕获型Pepmap Neo C18色谱柱Thermo scientific--
Aurora色谱柱IonOpticks--
timsTOF Ultra质谱仪Bruker DaltonicstimsTOF Ultra
分光光度计Tecan--
液相色谱-串联质谱系统----