患者队列研究
评估早期RA、PsA患者中脂联素-PEPITEM通路的状态
从早期关节炎队列(BEACON、NEAC)和健康对照中分离PBMC,通过RT-qPCR、流式细胞术和Western blot检测ADIPOR1/2、APPL-1、14-3-3ζ的表达,并检测血清和滑液中PEPITEM及脂联素水平。
PEPITEM Regulates the Synovial Microenvironment During Immune-Mediated Inflammatory Arthritis to Limit Disease
包含患者样本(PBMC、血清、滑液)、三种小鼠关节炎模型、体外迁移实验、scRNA-seq、Western blot、ELISA等多层级验证,并涉及机制(COX-2/NF-κB)。
胶原诱导关节炎(CIA)小鼠模型 抗原诱导关节炎(AIA)小鼠模型 单钠尿酸盐(MSU)诱导的急性痛风性关节炎小鼠模型 患者来源的PBMC和滑液样本
PEPITEM治疗剂量和给药途径:CIA和AIA模型中300 μg/只腹腔注射,MSU模型中3 μg/只关节内注射 治疗时机:CIA模型中分别在亚临床期(第21天)和治疗性(关节炎发作时)给药 主要检测指标:临床评分、关节厚度、CD45+白细胞浸润数量、滑膜细胞因子/趋化因子水平 机制验证:COX-2和NF-κB蛋白表达水平
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估早期RA、PsA患者中脂联素-PEPITEM通路的状态
从早期关节炎队列(BEACON、NEAC)和健康对照中分离PBMC,通过RT-qPCR、流式细胞术和Western blot检测ADIPOR1/2、APPL-1、14-3-3ζ的表达,并检测血清和滑液中PEPITEM及脂联素水平。
验证PEPITEM对Treg细胞跨内皮迁移的影响
从健康供体PBMC中分离Treg细胞,用PEPITEM(15 ng/mL)或对照处理,在TNF-α和IFN-γ激活的HUVEC单层上进行迁移实验,计算跨内皮迁移百分比。
评估PEPITEM在多种关节炎模型中的治疗效果
在CIA、AIA和MSU模型中,在亚临床期或治疗性给予PEPITEM或对照,监测临床评分、关节厚度,并通过组织学、micro-CT、流式细胞术和ELISA评估关节炎症和损伤。
揭示PEPITEM对滑膜免疫细胞组成和转录状态的影响
在AIA模型炎症高峰期,从PEPITEM或对照处理的小鼠关节中分选CD45+细胞进行scRNA-Seq,分析细胞亚群和差异表达基因。
验证PEPITEM对COX-2和NF-κB信号通路的影响
通过Western blot检测滑膜组织中COX-2和NF-κB(p65)的蛋白表达,并通过ELISA检测多种细胞因子和趋化因子的水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI1640培养基 | Sigma-Aldrich | -- |
| 胎牛血清 | Sigma-Aldrich | F7524-500ML | |
| PBMC分离 | Histopaque分离液 | Sigma-Aldrich | -- |
| 细胞处理 | 脂联素 | Enzo Life Sciences | -- |
| PEPITEM | Cambridge Research Biochemicals Limited | -- | |
| 迁移实验 | 肿瘤坏死因子α | R&D Systems | -- |
| 干扰素-γ | PeproTech | -- | |
| EasySep人CD4+CD127lowCD49-调节性T细胞富集试剂盒 | STEMCELL Technologies | 19232 | |
| T细胞极化 | 抗CD3抗体(OKT3) | BioLegend | -- |
| ImmunoCult-XF T细胞扩增培养基 | STEMCELL Technologies | -- | |
| Ultra-LEAF抗CD28(CD28.2) | BioLegend | -- | |
| 转化生长因子β1 | R&D Systems | 7754-BH-025/CF | |
| 白细胞介素-2 | Roche | 111475208001 | |
| 流式细胞术 | 抗CD25-efluor 450(BC96) | Invitrogen | -- |
| 抗CD3-PE-Cy7(OTK3) | Invitrogen | -- | |
| 抗CD4-Alexafluor 488(SK3) | BioLegend | -- | |
| Zombie Aqua活/死染料 | BioLegend | 423101 | |
| Foxp3/转录因子染色缓冲液套装 | eBioscience | 00-5523-00 | |
| 抗Foxp3-PE(259D) | BioLegend | -- | |
| Ki67-BV711(350516) | BioLegend | -- | |
| 基因表达分析 | RNeasy小型试剂盒 | QIAGEN | -- |
| iScript cDNA合成试剂盒 | Bio-Rad Laboratories Ltd | -- | |
| Western blot | 硝酸纤维素膜 | Bio-Rad Laboratories | -- |
| 兔单克隆抗COX-2(D5H5) | Cell Signaling Technology | -- | |
| 兔单克隆抗NF-κB(D14E12) | Cell Signaling Technology | -- | |
| 小鼠单克隆抗β-肌动蛋白(MAB8929) | R&D Systems | -- | |
| Clarity Western ECL底物 | Bio-Rad Laboratories | -- | |
| RIPA裂解液 | Sigma-Aldrich | R0278 | |
| cOmplete Mini蛋白酶抑制剂混合物 | Merck | 11836153001 | |
| Pierce BSA蛋白定量试剂 | Thermo Fisher Scientific | 23225 | |
| 兔单克隆抗APPL-1抗体 | Proteintech | 12639-1-AP | |
| 抗兔二抗 | Cell Signaling Technology | 7074S | |
| ReBlot Plus Western blot剥离试剂盒 | Millipore | -- | |
| 质谱分析 | C18固相萃取柱 | Waters XBridge | -- |
| SCIEX QTRAP 6500液相色谱-串联质谱仪 | SCIEX | -- | |
| 动物实验 | 甲基化牛血清白蛋白 | Sigma-Aldrich | -- |
| 完全弗氏佐剂 | Fisher Scientific | -- | |
| 英夫利昔单抗 | -- | -- | |
| 牛II型胶原 | -- | -- | |
| 单钠尿酸盐 | Sigma-Aldrich | U2875 | |
| 组织学 | 番红固绿染色液 | Abbexa | -- |
| DPX封片剂 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 蔡司Axio Scan.Z1扫描仪 | ZEISS | -- | |
| 蛋白提取 | 胶原酶D | Roche | -- |
| 脱氧核糖核酸酶I | Sigma-Aldrich | -- | |
| 胶原酶分散酶 | Roche | -- | |
| 红细胞裂解液 | Sigma-Aldrich | R7757 | |
| 溶组织梭菌胶原酶 | Sigma-Aldrich | C2139 | |
| 透明质酸酶 | Sigma-Aldrich | H3506 | |
| 流式细胞术 | 抗CD45 BV605(克隆:104) | BioLegend | -- |
| 抗CD11b BV650(克隆:M1/70) | BioLegend | -- | |
| LY6C FITC(克隆:HK1.4) | BioLegend | -- | |
| F4/80 APC-efluro(克隆:BM8) | BioLegend | -- | |
| 抗CD64 PE(克隆:X454-5/7.1) | eBiosciences | -- | |
| 抗CD11c PE-Cy7(克隆:NH418) | eBiosciences | -- | |
| LY6G APC(克隆:1A8) | BD Pharmingen | -- | |
| CountBright计数微球 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 可固定活力染料eFluor | eBioscience | -- | |
| Fortessa-X20流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| BriCyte E6流式细胞仪 | Mindray Bio-Medical Electronics | -- | |
| FACS Aria流式分选仪 | BD Biosciences | -- | |
| 兔抗adipoR1多克隆抗体(G-001-44) | Phoenix Pharmaceuticals | -- | |
| 兔抗adipoR2多克隆抗体(G-001-23) | Phoenix Pharmaceuticals | -- | |
| 山羊抗兔AF488二抗 | Invitrogen | A11034 | |
| 抗CD56 PE(克隆:5.1H11) | BioLegend | -- | |
| 抗CD14 APC(克隆:HCD14) | BioLegend | -- | |
| 抗CD4 AF700(克隆:RPA.T4) | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 抗CD8 E450(克隆:OKT8) | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 抗CD3 PerCPCy5.5(克隆:OKT3) | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 抗CD19 PE-Cy7(克隆:HIB19) | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| scRNA-Seq | Chromium Next GEM单细胞3'试剂盒版本3.1 | 10x Genomics | PN-1000269 |
| ELISA | 人脂联素/Acrp30 DuoSet ELISA试剂盒 | R&D Systems | DY1605 |
| 小鼠细胞因子蛋白组学芯片试剂盒 | R&D Systems | ARY006 | |
| PGE2 ELISA试剂盒(KGE004B) | R&D Systems | -- | |
| PGD2 ELISA试剂盒(E-EL-0066) | Elabscience | -- | |
| 5-HETE ELISA试剂盒(MBS2602657) | MyBioSource | -- | |
| 12-HETE ELISA试剂盒(MBS265806) | MyBioSource | -- | |
| Synergy HT酶标仪 | BioTek | -- | |
| Multiskan GO微孔板分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 统计分析 | GraphPad Prism软件 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本采集与处理 | 患者分组标准:CSA、UA、RA、PsA定义;样本量:RA n=47, PsA n=14, HC n=12等;PBMC分离方法及储存条件 阅读提示:Patients and Methods: Human samples, Isolation of peripheral blood mononuclear cells; Figure 1 legend |
| PEPITEM治疗方案 | 给药剂量:CIA和AIA模型中300 μg/只,MSU模型中3 μg/只;给药途径:腹腔注射或关节内注射;给药时机:亚临床期(第21天)或治疗性(关节炎发作时) 阅读提示:Patients and Methods: Antigen-induced arthritis, Collagen-induced arthritis, Monosodium urate-induced acute gouty arthritis; Figure 2 legend |
| 关节炎模型诱导 | 小鼠品系:C57BL/6, DBA-1, CD1;免疫抗原:mBSA (10 μg/100 μg), 牛CII (100 μg), MSU晶体 (200 μg); 佐剂:CFA;诱导时间:第0天和第21天 阅读提示:Patients and Methods: Antigen-induced arthritis, Collagen-induced arthritis, Monosodium urate-induced acute gouty arthritis |
| 疗效评估 | 临床评分标准;关节厚度测量频率;组织学评分(炎症、软骨损伤);micro-CT骨侵蚀评分 阅读提示:Patients and Methods: Histopathological staining, Micro-computed tomography; Figure 2 and 3 legends |
| 滑膜细胞分析 | 关节消化酶:胶原酶D、DNase I、胶原酶分散酶;消化时间和温度;流式抗体组合;scRNA-Seq参数(捕获细胞数、测序平台) 阅读提示:Patients and Methods: Synovial tissue digest, Flow cytometry and cell sorting, scRNA-Seq |
| 机制验证 | Western blot检测COX-2和NF-κB的抗体和浓度;ELISA检测细胞因子/趋化因子的试剂盒;蛋白定量方法 阅读提示:Patients and Methods: Western blot, Enzyme-linked immunosorbent assay |