TSPO-PET成像评估MS患者体内先天免疫细胞激活
确认MS患者存在体内小胶质细胞激活
对6名MS患者和6名健康对照进行[11C]PK11195-PET成像,计算DVR值评估TSPO结合。
Microglia from patients with multiple sclerosis display a cell-autonomous immune activation state
研究包含患者iPSC分化模型、转录组测序、qPCR、Western blot、细胞因子分泌检测和吞噬功能实验等多个独立证据层级,并进行体内TSPO-PET成像关联验证。
患者来源iPSC分化的小胶质细胞样细胞(iMGLs) 健康对照iPSC来源的iMGLs MS患者和健康对照的TSPO-PET成像队列
iPSC细胞系来源:6例MS患者和7例健康对照 细胞分化条件:Konttinen等方案,5% O2低氧培养至第4天 炎症刺激:LPS(20 ng/ml)、IFN-γ(20 ng/ml)或联合处理 RNA-seq样本处理:LPS刺激24小时,每孔400,000个细胞 吞噬功能检测:pHrodo Zymosan生物颗粒(100 μg/ml),刺激后24小时检测
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认MS患者存在体内小胶质细胞激活
对6名MS患者和6名健康对照进行[11C]PK11195-PET成像,计算DVR值评估TSPO结合。
生成并验证MS患者和健康对照的iPSC系
从患者PBMCs使用CytoTune™-iPS 2.0 Sendai重编程试剂盒生成iPSC,通过多能性标志物、三胚层分化、核型、STR等验证。
将iPSC分化为小胶质细胞样细胞并验证其身份
根据Konttinen等方案分化iMGL,通过免疫荧光检测Iba1、TMEM119、P2RY12表达,并通过RNA-seq与已有微胶质细胞数据比较确认细胞类型。
验证iMGL对炎症刺激的响应能力
用LPS、IFN-γ或联合刺激iMGL,通过免疫荧光和Western blot检测NF-κB p65核转位和磷酸化。
比较MS与HC iMGLs的转录差异
对6个MS和4个HC iMGL系进行RNA-seq(基础状态和LPS刺激),分析差异表达基因和通路富集。
验证RNA-seq发现的关键差异表达基因
对所有6个MS和7个HC iMGL系,通过qPCR检测HLA-DRA、HLA-DPA1等基因表达。
评估MS iMGLs的炎症因子释放
使用多重免疫分析检测基础状态和LPS刺激后iMGLs培养基中趋化因子和细胞因子的水平。
评估MS iMGLs的吞噬能力
使用pHrodo Zymosan生物颗粒,在基础状态和炎症刺激下测量吞噬活性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| iPSC重编程 | CytoTune™-iPS 2.0仙台病毒重编程试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 细胞培养 | Essential 8™ Flex培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 基质胶 | Corning | -- | |
| 重组人层粘连蛋白-521 | Biolamina | -- | |
| 骨形态发生蛋白4 | Peprotech | -- | |
| 激活素A | Peprotech | -- | |
| CHIR 99021 | Axon | -- | |
| 成纤维细胞生长因子2 | Peprotech | -- | |
| 血管内皮生长因子 | Peprotech | -- | |
| SB431542 | Sigma–Aldrich | -- | |
| 胰岛素 | Sigma–Aldrich | -- | |
| 促血小板生成素 | Peprotech | -- | |
| 白细胞介素-6 | Peprotech | -- | |
| 干细胞因子 | Peprotech | -- | |
| 白细胞介素-3 | Peprotech | -- | |
| 巨噬细胞集落刺激因子 | Peprotech | -- | |
| 白细胞介素-34 | Peprotech | -- | |
| TrypLE™ Select酶 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| ROCK抑制剂(Y-27632) | StemCell Technologies | -- | |
| 炎症刺激 | 脂多糖(LPS 0111:B4) | Sigma–Aldrich | -- |
| 干扰素-γ | Peprotech | -- | |
| RNA提取 | NucleoSpin RNA试剂盒 | Macherey-Nagel | -- |
| RNA质量控制 | DNF-471 RNA试剂盒(15 nt) | Agilent | -- |
| 片段分析仪 | Agilent | -- | |
| RNA-seq建库 | CORALL Total RNA-Seq V2文库制备试剂盒(含RiboCop) | Lexogen | -- |
| 高灵敏度DNA分析试剂盒 | Agilent | -- | |
| RNA-seq测序 | Illumina NextSeq500测序仪 | Illumina | -- |
| Illumina NextSeq 500/550高输出试剂盒v2.5,75循环 | Illumina | -- | |
| 免疫细胞化学 | 正常驴血清 | -- | -- |
| Triton X-100 | -- | -- | |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| 抗Iba1抗体(兔,1:500;019-19741) | FujiFilm Wako | 019-19741 | |
| 抗P2RY12抗体(兔,1:125;HPA014518) | Sigma-Aldrich | HPA014518 | |
| 抗TMEM119抗体(兔,1:100;ab185333) | Abcam | ab185333 | |
| 抗NF-κB p65抗体(兔,1:400;D14E12) | Cell Signaling Technology | D14E12 | |
| Alexa Fluor 488偶联驴抗兔二抗 | Thermo Fisher | A21206 | |
| ProLong™ Gold抗淬灭封片剂(含DAPI) | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 奥林巴斯IX51荧光显微镜 | Olympus | -- | |
| 滨松ORCA-Flash4.0 LT + sCMOS相机(型号C11440-42U30) | Hamamatsu | C11440-42U30 | |
| 免疫细胞化学定量 | CellProfiler (v4.2.1) | -- | -- |
| CellProfiler Analyst (v3.0.4) | -- | -- | |
| qPCR | 高容量cDNA反转录试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| TaqMan检测 | -- | -- | |
| qPCR仪器 | ABI QuantStudio 12 K Flex实时荧光定量PCR系统 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Western blot | Pierce™ 660 nm蛋白质检测试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Mini-PROTEAN® TGX™预制胶 | Bio-Rad | 456-1033 | |
| Trans-Blot® Turbo™ Mini PVDF转印膜 | Bio-Rad | #1704156 | |
| Trans-Blot Turbo转印系统 | Bio-Rad | -- | |
| 抗NF-κB p65抗体(小鼠,1:1000,6956) | Cell Signaling Technology | 6956 | |
| 抗磷酸化NF-κB p65抗体(兔,1:1000,3033) | Cell Signaling Technology | 3033 | |
| 抗IκBα抗体(小鼠,1:1000,4814) | Cell Signaling Technology | 4814 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体(小鼠,1:2000,sc-47778) | Santa Cruz | sc-47778 | |
| IRDye® 800CW驴抗小鼠IgG | LI-COR Biosciences | 926-32212 | |
| IRDye® 680RD驴抗兔IgG | LI-COR Biosciences | 926-68073 | |
| LI-COR Odyssey CLx成像系统 | LI-COR Biosciences | -- | |
| Image Studio软件 | LI-COR Biosciences | -- | |
| 吞噬实验 | pHrodo™绿色Zymosan生物颗粒™偶联物用于吞噬检测 | Thermo Fisher Scientific | P35365 |
| Opti-MEM培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Hoechst 33342 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 细胞松弛素D | Sigma–Aldrich | -- | |
| 徕卡DMi8倒置显微镜 | Leica | -- | |
| 细胞因子分泌检测 | U-PLEX定制生物标志物组1(人)检测试剂盒 | Meso Scale Diagnostics | -- |
| MESO QuickPlex SQ120 | Meso Scale Diagnostics | -- | |
| DISCOVERY WORKBENCH®软件(v4.0) | Meso Scale Diagnostics | -- | |
| IMB SPSS Statistics软件(版本29.0) | IBM | -- | |
| 统计分析 | GraphPad Prism(版本10) | GraphPad | -- |
| 细胞培养 | DMEM/F-12(不含谷氨酰胺) | Thermo Fisher Scientific | -- |
| GlutaMAX添加剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 碳酸氢钠 | -- | -- | |
| L-抗坏血酸 | Sigma–Aldrich | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| Iscove改良Dulbecco培养基(IMDM) | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 热灭活胎牛血清(FBS) | Sigma–Aldrich | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者招募与成像 | 研究对象:6例MS患者(2例RRMS,4例SPMS),女性;对照组:6例年龄性别匹配的健康对照。 阅读提示:Materials and methods: Subjects and procedures; Table 1 |
| iPSC生成 | iPSC重编程方法:CytoTune™-iPS 2.0仙台病毒重编程试剂盒;细胞来源:PBMCs。 阅读提示:Materials and methods: Generation and maintenance of iPSCs |
| iMGL分化 | 分化方案:Konttinen等方案,低氧条件(5% O2)培养至第4天;培养基成分和细胞因子浓度。 阅读提示:Materials and methods: Differentiation of iMGLs |
| 炎症刺激 | LPS浓度:20 ng/ml;IFN-γ浓度:20 ng/ml;刺激时间:NF-κB分析45分钟,RNA-seq等24小时。 阅读提示:Materials and methods: Inflammatory treatments |
| RNA-seq | 细胞密度:400,000细胞/孔;刺激:LPS 20 ng/ml 24小时;测序平台:Illumina NextSeq500。 阅读提示:Materials and methods: RNA sequencing and analysis |
| qPCR | 细胞密度:400,000细胞/孔;内参基因:GAPDH;分析方法:ΔΔCt法。 阅读提示:Materials and methods: qPCR |
| Western blot | 细胞密度:400,000细胞/孔;处理:LPS 45分钟;抗体浓度和货号。 阅读提示:Materials and methods: Western blot analysis |
| 吞噬实验 | 细胞密度:15,000细胞/孔;pHrodo生物颗粒浓度:100 μg/ml;孵育时间:6小时;刺激:LPS、IFN-γ或联合处理24小时。 阅读提示:Materials and methods: Phagocytosis assay |
| 细胞因子分泌 | 细胞密度:15,000细胞/孔;刺激:LPS或IFN-γ 24小时;检测试剂盒:U-PLEX Custom Biomarker Group 1 (human) Assay。 阅读提示:Materials and methods: Cytokine secretion |