检测胰岛和β细胞中γ-羧化机制
验证VK循环(GGCX和VKORC1)在胰岛和β细胞中表达并具有活性。
通过qPCR、western blot和免疫沉淀检测Ggcx、Vkorc1表达和γ-羧化蛋白,并在小鼠胰岛、β细胞、INS-1 832/3细胞和人胰岛中用VK1或华法林处理。
Vitamin K-dependent carboxylation regulates Ca2+ flux and adaptation to metabolic stress in β cells
采用细胞系、小鼠模型、人胰岛和质谱等多种方法,包括基因敲除小鼠、GSIS、钙成像、蛋白质组学等功能与机制验证。
小鼠β细胞(Ggcxff; Ins1-Cre) 小鼠胰腺(Ggcxff; Pdx1-Cre) 人胰岛 HEK293细胞(ASPH−/−)
Ggcx基因敲除小鼠模型(Ggcxff; Pdx1-Cre和Ggcxff; Ins1-Cre) 高脂饮食喂养7天(60% kcal from fat, TD.06414; Envigo) 维生素K1处理(22 μM) 毒胡萝卜素处理(10-40 nM) STIM1和Orai1相互作用检测
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证VK循环(GGCX和VKORC1)在胰岛和β细胞中表达并具有活性。
通过qPCR、western blot和免疫沉淀检测Ggcx、Vkorc1表达和γ-羧化蛋白,并在小鼠胰岛、β细胞、INS-1 832/3细胞和人胰岛中用VK1或华法林处理。
确定Ggcx失活是否改变胰岛基因表达谱。
对Ggcxff; Pdx1-Cre胰岛进行RNA测序,并进行通路富集分析,与糖尿病模型转录组比较。
评估γ-羧化对β细胞质量和胰岛素分泌的长期影响。
对Ggcxff; Pdx1-Cre小鼠进行代谢分析(GTT、ITT)、β细胞形态计量、TUNEL染色和离体GSIS。
探究γ-羧化是否在β细胞面对短期高脂饮食应激时调节胰岛素分泌。
10周龄Ggcxff; Pdx1-Cre和Ggcxff; Ins1-Cre小鼠喂HFD或对照饮食7天,进行代谢表型分析。
验证γ-羧化能否保护β细胞免受ER应激诱导的凋亡。
用VK1预处理INS-1 832/3细胞,然后用毒胡萝卜素诱导ER应激,检测凋亡标志物和γ-羧化。
寻找β细胞中新的γ-羧化蛋白。
通过免疫沉淀和质谱分析,鉴定ERGP为γ-羧化内质网蛋白,并在不同组织和细胞中验证表达。
明确ERGP γ-羧化发生的具体谷氨酸残基,并检测羧化对钙结合能力的影响。
通过表达ERGP突变体结合LC-MS/MS定位γ-羧化位点,并通过45Ca2+ overlay实验比较羧化和非羧化ERGP的钙结合。
验证γ-羧化ERGP是否通过调节STIM1/Orai1相互作用影响SOCE。
在ASPH−/− HEK293细胞中过表达STIM1、Orai1、ERGP,用Ca2+成像、免疫荧光和FRET检测SOCE和复合物形成。
确认γ-羧化缺失导致β细胞钙超载,并测试维拉帕米是否能恢复正常胰岛素水平。
对Ggcxff; Ins1-Cre胰岛细胞进行Ca2+成像,测量SOCE和基础钙;在HFD小鼠中用维拉帕米处理。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 药物处理 | 维生素K1 | MilliporeSigma | V3501 |
| 华法林 | Santa Cruz Biotechnology | SC-204941 | |
| 毒胡萝卜素 | Tocris | 1138/1 | |
| 盐酸维拉帕米 | MilliporeSigma | V4629 | |
| 二氮嗪 | MilliporeSigma | D9035 | |
| 细胞培养 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | 11668019 |
| 基因编辑 | Lipofectamine CRISPRMAX Cas9转染试剂 | Invitrogen | CMAX00001 |
| 重组化脓性链球菌Cas9蛋白 | Synthego | SpCas9 | |
| 细胞培养 | G418抗生素 | -- | -- |
| 免疫沉淀 | 抗FLAG琼脂糖珠 | MilliporeSigma | A2220 |
| 蛋白A琼脂糖珠 | Roche Diagnostics | 11719408001 | |
| 免疫印迹 | 抗裂解型Caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9661 |
| 抗磷酸化(Ser139)组蛋白H2A.X抗体 | Cell Signaling Technology | 9718 | |
| 抗磷酸化(S724)-IRE1抗体 | Abcam | ab124945 | |
| 抗GRP78/BIP抗体 | ProteinTech | 11587-1-AP | |
| 抗GFP抗体 | ProteinTech | 50430-2-AP | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | MilliporeSigma | A1978 | |
| 抗GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 5174 | |
| 抗Myc抗体 | Cell Signaling Technology | 2276 | |
| 抗HA抗体 | Cell Signaling Technology | 3724 | |
| 抗FLAG抗体(小鼠) | MilliporeSigma | F1804 | |
| 抗FLAG抗体(兔) | Cell Signaling Technology | 14793 | |
| 抗GGCX抗体 | ProteinTech | 16209-1-AP | |
| 抗Gla抗体 | -- | -- | |
| 抗A/E-GRD抗体 | -- | -- | |
| 抗STIM1抗体 | Cell Signaling Technology | 5668 | |
| 免疫荧光 | 抗胰岛素抗体(兔) | Santa Cruz Biotechnology | sc-9168 |
| 抗胰岛素抗体(山羊) | Santa Cruz Biotechnology | sc-7839 | |
| Alexa Fluor 488偶联驴抗兔二抗 | Jackson Immunoresearch Laboratories | 711-545-152 | |
| Alexa Fluor 594偶联驴抗山羊二抗 | Jackson Immunoresearch Laboratories | 705-585-147 | |
| 免疫组织化学 | Vectastain Elite ABC-过氧化物酶试剂盒 | Vector Laboratories | PK-6101 |
| NovaRED底物试剂盒 | Vector Laboratories | SK-4800 | |
| 凋亡检测 | Click-iT Plus TUNEL检测试剂盒 | Invitrogen | C10617 |
| ELISA | 小鼠胰岛素ELISA试剂盒 | Mercodia | 10-1247-01 |
| RNA提取 | RNeasy Plus微型试剂盒 | Qiagen | 74134 |
| RNA测序 | NEBNext Poly(A)磁分离模块 | New England Biolabs | E7490 |
| KAPA链特异性RNA-seq文库制备试剂盒 | Roche Diagnostics | KR0934 | |
| TruSeq DNA文库制备LT试剂盒 | Illumina | -- | |
| HiSeq PE簇试剂盒v4 cBot | Illumina | PE-401-4001 | |
| Illumina HiSeq 2500系统 | Illumina | -- | |
| qPCR | PowerUp SYBR Green预混液 | Applied Biosystems | A25741 |
| ViiA7实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 逆转录 | M-MLV逆转录酶 | Invitrogen | 28025013 |
| DNA酶处理 | 脱氧核糖核酸酶I | Invitrogen | 18068015 |
| DNA聚合酶 | Q5高保真DNA聚合酶 | New England Biolabs | M0491 |
| 细胞分离 | Histopaque-1077密度梯度分离液 | MilliporeSigma | 10771 |
| 胰岛分离 | Liberase TL酶 | Roche Applied Science | 5401020001 |
| 钙成像 | Fluo-4 AM钙指示剂 | Invitrogen | F14201 |
| Fura Red AM钙指示剂 | Invitrogen | F3021 | |
| Pluronic F-127表面活性剂 | Invitrogen | P6866 | |
| 钙结合实验 | 45CaCl2放射性标记物 | Perkin Elmer | NEZ013001MC |
| 质谱分析 | 测序级胰蛋白酶 | Promega | -- |
| MCX萃取柱 | Waters | -- | |
| Easy-nLC II液相色谱系统 | Proxeon Biosystems | -- | |
| Orbitrap Fusion质谱仪 | Thermo Scientific | -- | |
| Nanospray Flex离子源 | Thermo Scientific | -- | |
| 成像 | Typhoon FLA 9500激光扫描成像系统 | Cytiva | -- |
| 显微镜 | SteREO Discovery.V12体视显微镜 | Zeiss | -- |
| FACSAria III流式细胞分选仪 | Becton Dickinson | -- | |
| 共聚焦旋转盘倒置显微镜 | Zeiss | -- | |
| Yokogawa CSU-1共聚焦扫描单元 | Yokogawa | -- | |
| DM5500B荧光显微镜 | Leica | -- | |
| Retiga EXi相机 | QImaging | -- | |
| 代谢监测 | Promethion连续代谢监测系统 | Sable Systems International | -- |
| 组织形态计量 | OsteoMeasure分析系统 | Osteometrics | -- |
| 试剂 | Tris-甘氨酸凝胶 | -- | -- |
| EGTA | -- | -- | |
| PMSF | -- | -- | |
| 蛋白酶抑制剂 | Roche Diagnostics | 4693132001 | |
| 动物实验 | 胰岛素(优泌林R) | Lilly | -- |
| 70%葡萄糖注射液 | McKesson | -- | |
| 0.9%生理盐水 | Baxter | -- | |
| 动物饮食 | 高脂饮食(60%千卡来自脂肪) | Envigo | TD.06414 |
| 对照饮食(10%千卡来自脂肪) | Envigo | TD.08806 | |
| 标准饲料 | Envigo | 2918 | |
| 分析软件 | Fiji软件 | -- | -- |
| Image Lab软件 | Bio-Rad Laboratories | -- | |
| GraphPad Prism软件 | Graphpad | -- | |
| Volocity 6.0软件 | Perkin Elmer | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型 | 小鼠品系、基因型、性别、年龄 阅读提示:Methods: Mice |
| 高脂饮食喂养 | 饮食组成(60% kcal from fat)、喂养时间(7天)、起始年龄(10周) 阅读提示:Methods: Metabolic analysis |
| 药物处理 | VK1浓度(22 μM)、华法林浓度(50 μM)、毒胡萝卜素浓度(10-40 nM)、维拉帕米浓度(1 mg/mL饮水) 阅读提示:Methods: INS-1 832/3 and islet treatments; Metabolic analysis |
| 细胞培养 | 细胞系(INS-1 832/3, HEK293, ASPH−/− HEK293)、培养基、血清浓度 阅读提示:Methods: Cell lines |
| 钙成像 | 指示剂浓度(Fluo-4 AM, Fura Red AM)、缓冲液成分、毒胡萝卜素和CaCl2添加时间 阅读提示:Methods: Ca2+ live-cell imaging in ASPH−/− HEK293 and islets |