验证Tp47对巨噬细胞吞噬作用的影响
确定Tp47是否能增强巨噬细胞的吞噬能力
用不同浓度(5、10、25、50 μg/mL)的Tp47处理腹腔巨噬细胞6小时,或25 μg/mL处理不同时间,通过流式细胞术检测吞噬荧光标记乳胶珠的细胞百分比。
Recombinant Treponema pallidum protein Tp47 promoted the phagocytosis of macrophages by activating NLRP3 inflammasome induced by PKM2-dependent glycolysis
包含细胞实验、药理抑制剂、siRNA敲低及糖酵解代谢检测等多个独立证据层级,明确验证了功能与机制。
兔腹腔巨噬细胞 THP-1来源的巨噬细胞
Tp47处理浓度:5、10、25、50 μg/mL Tp47处理时间:1、3、6、12小时 NLRP3抑制剂MCC950预处理2小时 糖酵解抑制剂2-DG预处理2小时 PKM2抑制剂shikonin预处理2小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定Tp47是否能增强巨噬细胞的吞噬能力
用不同浓度(5、10、25、50 μg/mL)的Tp47处理腹腔巨噬细胞6小时,或25 μg/mL处理不同时间,通过流式细胞术检测吞噬荧光标记乳胶珠的细胞百分比。
确定Tp47诱导的吞噬作用是否依赖于NLRP3炎症小体激活
使用NLRP3抑制剂MCC950预处理或si-NLRP3转染巨噬细胞,再用Tp47处理,检测吞噬能力变化。
探索Tp47是否增强巨噬细胞的糖酵解
通过Seahorse分析仪测量细胞外酸化率(ECAR)评估糖酵解和糖酵解能力,并检测培养上清中柠檬酸、磷酸烯醇丙酮酸和乳酸的产量。
确定Tp47诱导的NLRP3激活是否依赖于糖酵解
使用糖酵解抑制剂2-DG预处理巨噬细胞,再用Tp47刺激,检测糖酵解参数、NLRP3炎症小体相关mRNA和蛋白表达。
确定PKM2是否是Tp47诱导糖酵解和NLRP3激活的关键酶
检测Tp47处理后PKM2、HK1、HK2的蛋白表达,并用PKM2抑制剂shikonin或si-PKM2预处理,检测糖酵解和NLRP3激活。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 蛋白制备 | EtEraserTM内毒素去除试剂盒 | Chinese Horseshoe Crab Reagent Manufactory, Ltd. | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| RPMI 1640培养基 | American Type Culture Collection | -- | |
| 细胞分化 | 佛波醇12-肉豆蔻酸酯13-乙酸酯 | Sigma-Aldrich | 79346 |
| 药物处理 | MCC950 | MedChemExpress | HY-12815A |
| 2-脱氧-D-葡萄糖 | Sigma-Aldrich | D8357 | |
| 紫草素 | MedChemExpress | HY-N0822 | |
| 细胞活性检测 | 甲基噻唑基四唑比色法 | Solarbio | M1020 |
| 吞噬实验 | 荧光标记乳胶珠 | Sigma-Aldrich | L4655 |
| 流式分析 | 流式细胞仪 | Beckman | -- |
| RNA提取 | RNA提取试剂盒 | TIANGEN | DP419 |
| 逆转录 | 逆转录试剂盒 | TransGen Biotech | TG-AQ601-02 |
| 实时PCR | TBGreen® Premix Ex Taq™II | Takara | RR820 |
| Roche480实时荧光定量PCR系统 | Roche | -- | |
| Western blotting | RIPA裂解液 | Solarbio | R0010 |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Takara | T9300A | |
| PVDF膜 | BioRad | -- | |
| NLRP3抗体 | Abcam | ab263899 | |
| pro-IL-1β抗体 | Abcam | ab216995 | |
| IL-1β抗体 | Cell Signalling Technology | 83186S | |
| pro-caspase-1抗体 | Abcam | ab179515 | |
| caspase-1抗体 | Cell Signalling Technology | 4199T | |
| PKM2抗体 | Cell Signalling Technology | 8337T | |
| HK1抗体 | Cell Signalling Technology | 8337T | |
| β-actin抗体 | Abcam | ab8226 | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG H&L抗体 | Abcam | ab205718 | |
| 抗小鼠IgG(H+L) | Cell Signalling Technology | 14709 | |
| ELISA | IL-1β ELISA试剂盒 | NeoBioscience | EHC002b.96 |
| siRNA转染 | Lipofectamine™ 3000转染试剂盒 | Invitrogen | L3000150 |
| 糖酵解功能测定 | Seahorse XF96生物分析仪 | Seahorse Bioscience | -- |
| XF糖酵解压力测试试剂盒 | Seahorse Bioscience | 102194-100 | |
| 生化检测 | 柠檬酸检测试剂盒 | Abcam | ab83396 |
| 乳酸检测试剂盒 | Abcam | ab65330 | |
| 统计分析 | GraphPad Prism 8.0 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与分化 | 腹腔巨噬细胞提取方法:15%胰蛋白胨腹腔注射4天;THP-1分化:50 ng/mL PMA处理24小时;培养基成分:DMEM或RPMI1640含10%热灭活FBS。 阅读提示:Materials and Methods, Cell culture |
| 药物处理 | 抑制剂浓度:MCC950、2-DG、shikonin的浓度未明确说明;预处理时间均为2小时。 阅读提示:Materials and Methods, Cell culture |
| 吞噬实验 | 细胞密度:10^6细胞/孔;荧光乳胶珠体积:0.3 μL/mL;共培养时间:1小时;检测方法:流式细胞术。 阅读提示:Materials and Methods, Phagocytosis assay |
| 糖酵解功能测定 | 细胞数量:7.5×10^4/孔;使用XF糖酵解压力测试试剂盒;测量ECAR参数。 阅读提示:Materials and Methods, Glycolytic function assay |
| 基因敲低 | siRNA序列及转染量:si-NLRP3和si-PKM2序列已提供;150 pmol/well。 阅读提示:Materials and Methods, Transfection of siRNA |