C.R感染模型建立与验证
建立并验证C.R感染诱导的肠道炎症模型。
小鼠经口灌胃C.R(4×10^8 CFU),在感染后第9天评估体重、粪便含水量、肠道传输距离、结肠长度、肠道通透性、组织病理和炎症因子表达。
Citrobacter rodentium infection impairs dopamine metabolism and exacerbates the pathology of Parkinson's disease in mice
包括肠道炎症模型、行为学测试、免疫组化、蛋白免疫印迹、HPLC检测、微生物组测序等多层级验证,涵盖体内模型、功能验证和机制探索。
C57BL/6J小鼠 MPTP诱导的帕金森病小鼠模型 啮齿类柠檬酸杆菌感染的结肠炎模型
C.R感染剂量:4×10^8 CFU/200 μL灌胃 MPTP给药剂量:单次40 mg/kg腹腔注射 MPTP给药时间:C.R感染后6天 行为学测试时间:MPTP给药后3天 样本量:每组7-12只小鼠
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立并验证C.R感染诱导的肠道炎症模型。
小鼠经口灌胃C.R(4×10^8 CFU),在感染后第9天评估体重、粪便含水量、肠道传输距离、结肠长度、肠道通透性、组织病理和炎症因子表达。
评估C.R感染对肠道微生物群多样性和组成的影响。
收集粪便样本,提取DNA,扩增16S rRNA V3-V4区域,进行Illumina MiSeq测序,分析α多样性和β多样性,并比较各分类水平的相对丰度。
检测C.R感染对肠道短链脂肪酸和纹状体神经递质代谢的影响。
采用HPLC检测粪便中乙酸、丙酸和丁酸浓度,以及纹状体中DA、DOPAC、HVA、5-HT和5-HIAA水平。
建立MPTP诱导的PD小鼠模型,并评估C.R感染对MPTP引起的运动功能障碍的影响。
在C.R感染后6天,腹腔注射MPTP(40 mg/kg)或生理盐水,3天后进行行为学测试(杆测试、旋转杆测试、钢丝悬挂测试、旷场测试、站立测试)。
评估C.R感染对MPTP诱导的多巴胺能神经元变性和胶质细胞活化的影响。
通过免疫组化、免疫荧光、Western blotting和体视学计数检测黑质和纹状体中TH阳性神经元、Iba1阳性小胶质细胞和GFAP阳性星形胶质细胞的变化。
探究C.R感染对TLR4-NF-κB信号通路的影响。
通过qPCR、Western blotting和免疫荧光检测结肠和纹状体中TLR4、NF-κB p65及其磷酸化水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细菌培养 | 麦康凯琼脂平板 | Solarbio life sciences | LA8200 |
| LB肉汤 | -- | -- | |
| 动物模型 | 1-甲基-4-苯基-1,2,3,6-四氢吡啶 | Sigma-Aldrich | M0896 |
| 肠道通透性检测 | FITC-葡聚糖 | Sigma-Aldrich | FD4 |
| 肠道功能检测 | 活性炭 | Sigma-Aldrich | 934674 |
| 阿拉伯胶 | Sigma-Aldrich | G9752 | |
| ELISA | 小鼠IL-6 ELISA试剂盒 | Neobioscience | EMC004.96 |
| 钙卫蛋白ELISA试剂盒 | Keborui | KBR-hlk7175 | |
| 蛋白质提取 | RIPA裂解液 | Thermo Fisher Scientific | P0013B |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂 | Thermo Fisher Scientific | 78425 | |
| 蛋白质定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23227 |
| Western blotting | IRDye 800CW山羊抗小鼠IgG | LI-COR | 92632210 |
| IRDye 800CW山羊抗兔IgG | LI-COR | 92632211 | |
| 小鼠抗TH抗体 | Sigma-Aldrich | T2928 | |
| 兔抗GFAP抗体 | Proteintech | 16825-1-AP | |
| 兔抗Iba1抗体 | Abcam | ab178846 | |
| 兔抗COX2抗体 | Abcam | ab179800 | |
| 小鼠抗β-actin抗体 | Santa Cruz | sc-47778 | |
| 兔抗DAT抗体 | Abcam | ab184451 | |
| 兔抗MAOA抗体 | Abcam | ab12675 | |
| 兔抗MAOB抗体 | Proteintech | 12602-1-AP | |
| 小鼠抗TLR4抗体 | Santa Cruz | sc-293072 | |
| 小鼠抗NF-κB p65抗体 | Abcam | ab32536 | |
| 兔抗磷酸化NF-κB p65 (Ser536)抗体 | Cell Signaling Technology | 93H1 | |
| 免疫荧光 | 异硫氰酸荧光素-葡聚糖 | Sigma-Aldrich | FD4 |
| Alexa Fluor 488偶联二抗 | Invitrogen | A-11008 | |
| Alexa Fluor 594偶联二抗 | Invitrogen | A-11012 | |
| Cy3偶联二抗 | Invitrogen | A10522 | |
| 免疫组化 | 生物素化山羊抗兔IgG | Vector Laboratories | PK-6101 |
| 生物素化山羊抗小鼠IgG | Vector Laboratories | PK-6102 | |
| DAB底物试剂盒 | Vector Laboratories | SK-4100 | |
| 小鼠抗TH抗体 | Sigma-Aldrich | T2928 | |
| 兔抗GFAP抗体 | Proteintech | 16825-1-AP | |
| 兔抗Iba1抗体 | Abcam | ab178846 | |
| 兔抗C3抗体 | Abcam | ab200999 | |
| 大鼠抗CD16/32抗体 | BD Pharmingen | 553142 | |
| 兔抗ZO-1抗体 | Santa Cruz | sc-33725 | |
| 兔抗Occludin抗体 | Santa Cruz | sc-133256 | |
| 兔抗Claudin 1抗体 | Santa Cruz | sc-166338 | |
| 小鼠抗TLR4抗体 | Santa Cruz | sc-293072 | |
| RNA提取 | TRIzol RNA提取试剂 | Tiangen | DP424 |
| RNA反转录 | 高效cDNA反转录试剂盒 | Tiangen | KR116 |
| qPCR | SYBR Green荧光染料 | CWBIO | CW3008M |
| QuantStudio 3实时荧光定量PCR仪 | Applied Biosystems | -- | |
| HPLC | Acclaim 120 C18色谱柱 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 高效液相色谱系统 | ESA | -- | |
| 电化学检测器 | ESA | 5014B | |
| 16S rRNA测序 | QIAamp快速粪便DNA迷你试剂盒 | QIAGEN | -- |
| Equalbit双链DNA高灵敏度检测试剂盒 | -- | -- | |
| Illumina MiSeq测序平台 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| C.R感染 | C.R菌株(DBS770,氯霉素抗性)、感染剂量(4×10^8 CFU/200 μL)、灌胃前禁食8-12小时、感染后监测天数 阅读提示:参见Materials and Methods中的Bacterial culture and infection of mice部分。 |
| MPTP处理 | MPTP剂量(40 mg/kg,单次腹腔注射)、注射时间(C.R感染后6天)、溶剂(0.9%生理盐水)、浓度(5 mg/mL) 阅读提示:参见Materials and Methods中的Establishment of Parkinson’s disease mouse model部分。 |
| 行为学测试 | 测试时间(MPTP后3天)、测试项目(杆测试、旋转杆测试、钢丝悬挂测试、旷场测试、站立测试)、具体参数(如旋转杆转速32 rpm,测试时间300秒等) 阅读提示:参见Materials and Methods中的Behavioral tests部分。 |
| 神经递质检测 | 纹状体组织样本、HPLC条件(C18柱、电化学检测)、检测时间点(9、15、21、30天) 阅读提示:参见Materials and Methods中的Measurement of neurotransmitters and SCFAs by high-performance liquid chromatography (HPLC)部分。 |
| 肠道微生物组分析 | 粪便样本收集时间点、DNA提取方法、16S rRNA V3-V4区域扩增、测序平台(Illumina MiSeq)、生物信息学分析(QIIME等) 阅读提示:参见Materials and Methods中的Gut microbe 16 S rRNA sequencing and data analysis部分。 |