肠道共生菌代谢物鼠李糖通过激活SLC12A4促进巨噬细胞吞噬并保护小鼠免受脓毒症

Gut commensal metabolite rhamnose promotes macrophages phagocytosis by activating SLC12A4 and protects against sepsis in mice

作者信息Dongping Li, Rongjuan Wei, Xianglong Zhang, Shenhai Gong, Meijuan Wan, Fangzhao Wang, Jiaxin Li, Meiling Chen, Ruofan Liu, Yantong Wan, Yinghao Hong, Zhenhua Zeng, Peng Gu, Zhang Wang, Kutty Selva Nandakumar, Yong Jiang, Hongwei Zhou, Peng Chen
PMID39027244
发布时间2024-07
DOI10.1016/j.apsb.2024.03.025

实验完整度

高

包含动物模型(CLP、粪便注射、大肠杆菌腹膜炎)、细胞实验(小鼠BMDMs、人THP-1来源巨噬细胞)、机制验证(蛋白芯片、SPR、siRNA/过表达)及人体样本(脓毒症患者)等多层级验证。

主要模型

小鼠CLP脓毒症模型 小鼠粪便上清注射腹膜炎模型 大肠杆菌诱导腹膜炎模型 骨髓来源巨噬细胞(BMDMs)和THP-1来源巨噬细胞

重点核对

CLP模型:18或21号针头进行穿刺以诱导致死或中度脓毒症 抗生素混合物处理:氨苄西林、甲硝唑、新霉素、万古霉素剂量及给药时长(3天) 鼠李糖干预剂量:74 mg/kg,CLP前2小时口服 体外吞噬实验条件:鼠李糖100 μmol/L预处理18小时,与大肠杆菌共孵育45分钟,MOI=60

摘要

脓毒症的进展与肠道菌群失调显著相关。然而,脓毒症期间肠道菌群的调节机制仍不清楚。在此,我们在临床前模型中研究了肠道共生菌如何影响脓毒症的发展。采用盲肠结扎穿刺(CLP)手术建立小鼠多微生物脓毒症模型。通过抗生素混合物(ABX)清除肠道菌群的小鼠死亡率显著高于对照组。代谢组学分析表明,ABX处理消耗了许多代谢物,随后补充L-鼠李糖(鼠李糖,Rha),一种细菌碳水化合物代谢物,发挥了显著的免疫调节特性,显著增强巨噬细胞吞噬作用,进而改善器官损伤和死亡率。机制上,鼠李糖直接结合并激活巨噬细胞中的溶质载体家族12(钾-氯共转运体)成员4(SLC12A4),并通过激活小G蛋白Ras相关的C3肉毒杆菌毒素底物1(Rac1)和细胞分裂控制蛋白42同源物(Cdc42)促进吞噬作用。有趣的是,鼠李糖增强了脓毒症患者巨噬细胞的吞噬能力。总之,通过鉴定SLC12A4为宿主相互作用蛋白,我们揭示了肠道共生菌代谢物鼠李糖是一种功能性分子,能够促进巨噬细胞的吞噬能力并保护宿主免受脓毒症。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
肠道菌群及其代谢物如何影响脓毒症的进展?
核心机制
肠道菌群来源的鼠李糖直接结合并激活巨噬细胞表面的SLC12A4,进而激活Rac1和Cdc42,促进巨噬细胞吞噬和细菌清除,从而减轻脓毒症。
主要证据
通过CLP模型和粪便注射实验证明清除肠道菌群加重脓毒症;补充鼠李糖改善生存率;体外实验证明鼠李糖增强BMDMs和THP-1巨噬细胞吞噬;蛋白芯片和SPR证明鼠李糖直接结合SLC12A4;siRNA敲低SLC12A4消除鼠李糖效应;Western blot显示GTP-Rac1/Cdc42激活。
研究意义
作者提出鼠李糖或靶向SLC12A4的疗法有望转化为促进脓毒症患者巨噬细胞吞噬的临床策略。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

肠道菌群在脓毒症中的保护作用验证

评估清除肠道菌群对小鼠脓毒症结局的影响

使用抗生素混合物预处理小鼠3天,然后进行CLP手术或粪便上清注射,观察生存率和器官损伤。

2

候选代谢物筛选与验证

鉴定清除肠道菌群后缺失的代谢物并验证其对脓毒症的影响

通过代谢组学分析ABX处理小鼠粪便,筛选出鼠李糖,并在CLP模型中补充鼠李糖观察其保护作用。

3

单细胞转录组分析免疫细胞变化

探索鼠李糖对脓毒症小鼠外周血单个核细胞的影响

对三组小鼠PBMCs进行单细胞RNA测序,分析细胞类型和信号通路变化,重点关注FcγR介导的吞噬途径。

4

体外验证鼠李糖对巨噬细胞吞噬的影响

验证鼠李糖是否直接增强巨噬细胞的吞噬和杀菌能力

用鼠李糖预处理BMDMs或THP-1来源巨噬细胞,然后与大肠杆菌共培养,检测吞噬和细胞内杀菌情况。

5

鉴定鼠李糖结合蛋白

寻找鼠李糖在巨噬细胞表面的直接靶点

使用生物素化鼠李糖探针进行人蛋白质组微阵列分析,结合分子对接、SPR和ELISA验证结合特异性。

6

验证SLC12A4的功能

确证SLC12A4在鼠李糖促进吞噬中的必要性

通过siRNA敲低SLC12A4或过表达,检测巨噬细胞吞噬和杀菌能力的变化,并观察鼠李糖效应是否被阻断。

7

机制研究:Rac1和Cdc42激活

探索SLC12A4下游信号通路

检测鼠李糖处理后巨噬细胞内GTP-Rac1和GTP-Cdc42的水平,并评估SLC12A4敲低对其影响。

8

人体样本验证

评估鼠李糖对健康人和脓毒症患者巨噬细胞吞噬能力的影响

分离人外周血单核细胞来源的巨噬细胞(MDMs),用鼠李糖预处理后检测吞噬和杀菌能力。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
氨苄西林钠MacklinA800429
甲硝唑MacklinM813526
硫酸新霉素MacklinN814740
万古霉素AladdinV105495
鼠李糖AladdinR108982
磷酸盐缓冲液GibcoC10010500BT
LB培养基SigmaL3022
TRIzol试剂Invitrogen15596018
RNA Nano 600检测试剂盒Agilent Technologies--
Illumina NovaSeq 6000测序仪Illumina--
丙氨酸氨基转移酶检测试剂盒Nanjing Jiancheng Bioengineering InstituteC009-3-1
天冬氨酸氨基转移酶检测试剂盒Nanjing Jiancheng Bioengineering InstituteC010-3-1
肌酐检测试剂盒Nanjing Jiancheng Bioengineering InstituteC011-2-1
TNF-α ELISA试剂盒NeoBioscienceEMC102a.96
IL-1β ELISA试剂盒NeoBioscienceEMC001b.96
IL-6 ELISA试剂盒NeoBioscienceEMC004.96
总RNA提取试剂盒Vazyme Biotech Co., Ltd.RC112-01
反转录试剂盒ToyoboFSQ-101
SYBR Green实时荧光定量PCR预混液ToyoboQPK-201
ABI 7500实时荧光定量PCR系统Applied Biosystems--
对照siRNARiboBio Co., Ltd.--
riboFECT CP转染试剂盒RiboBioC10511-05
SLC12A4过表达质粒iGene Biotechnology Co., Ltd.EX-Y3536-M98
对照质粒iGene Biotechnology Co., Ltd.EX-NEG-M98
脂质体转染试剂3000InvitrogenL3000015
玻璃底细胞培养皿NEST Biotechnology801002
麦胚凝集素Thermo Fisher ScientificW11262
Hoechst 33342染料GlpBioGC63515
尼康C1光谱共聚焦显微镜Nikon--
链霉亲和素偶联量子点(QD605s)Wuhan jiayuan quantum dots Co., Ltd.QS605
庆大霉素SigmaE003632
TritonX-100SigmaX100
HuProt 20K人类蛋白质组芯片CDI Laboratories--
链霉亲和素-Cy5Thermo Fisher ScientificSA1011
GenePix 4000B扫描仪Axon Instruments--
抗SLC12A4抗体预包被96孔板ELK Biotechnology Co., Ltd.ELK9749
重组人SLC12A4蛋白Crystalobio Biopharma--
Schrodinger-Maestro软件----
PlexArray HT系统Plexera Bioscience--
3D葡聚糖传感器芯片Plexera BiosciencePX201
MQAE荧光探针MCEHY-D0090
Prism 8.3软件GraphPad--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
动物模型
小鼠品系、年龄、性别;ABX剂量和给药时长;CLP针号;观察时间
阅读提示:见2.1节,图1图例
药物处理
鼠李糖剂量(74 mg/kg)、给药途径(口服)、给药时间(CLP前2小时)
阅读提示:见2.1节,结果3.2
细胞实验
细胞类型(BMDMs、THP-1)、鼠李糖浓度(100 μmol/L)和处理时间(18小时)、感染时间(45分钟)、MOI(60)
阅读提示:见2.13节,结果3.3
分子机制
siRNA序列、转染浓度和时间;SLC12A4过表达质粒浓度和时间;SPR和ELISA条件
阅读提示:见2.11、2.14、2.15、2.16节
人体样本
患者纳入标准;MDMs分离和培养条件;鼠李糖处理浓度和时间(文中未明确)
阅读提示:见2.3节,结果3.7