BMP8B表达模式分析
探究BMP8B在3T3-L1前脂肪细胞分化过程中的表达变化。
通过qRT-PCR检测3T3-L1细胞在分化不同时间点(Day 0、2、4、8)的Bmp8b mRNA水平。
BMP8B Activates Both SMAD2/3 and NF-κB Signals to Inhibit the Differentiation of 3T3-L1 Preadipocytes into Mature Adipocytes
包含体外细胞分化实验、基因过表达/敲低、免疫印迹、报告基因、转录组测序及信号通路抑制剂验证,功能验证和机制验证完整。
3T3-L1小鼠胚胎成纤维细胞系 HEK293T人胚胎肾细胞系
BMP8B过表达和敲低的验证 SMAD2/3和NF-κB信号通路的磷酸化水平 ALk4敲低对BMP8B抑制脂肪生成的影响 TP0427736 HCl和JSH-23抑制剂处理 PPARγ启动子活性测定
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究BMP8B在3T3-L1前脂肪细胞分化过程中的表达变化。
通过qRT-PCR检测3T3-L1细胞在分化不同时间点(Day 0、2、4、8)的Bmp8b mRNA水平。
验证BMP8B对3T3-L1脂肪细胞分化的功能影响。
通过慢病毒感染在3T3-L1细胞中过表达或敲低Bmp8b,随后诱导分化,使用油红O染色和qRT-PCR/蛋白印迹检测脂质积累和标志基因表达。
鉴定BMP8B激活的下游信号通路。
通过蛋白印迹检测BMP8B过表达细胞中SMAD1/5/8、SMAD2/3、ERK1/2、p38 MAPK和JNK的磷酸化水平。
确定BMP8B激活SMAD2/3信号所依赖的I型受体。
通过报告基因实验和显性负性突变体(ALK3-ΔGS、ALK4-ΔGS、ALK5-ΔGS)研究各受体对BMP8B信号的影响,并在分化实验中验证ALK4的功能。
全面分析BMP8B过表达对3T3-L1细胞基因表达的影响,特别是PPAR信号通路和免疫相关通路。
对LV-ZsGreen1和LV-Bmp8b组各3个生物学重复进行RNA测序,并进行KEGG通路富集分析。
验证BMP8B通过SMAD2/3信号抑制PPARγ转录。
构建PPARγ启动子荧光素酶报告质粒及其SMAD2/3结合位点突变体,转染HEK293T细胞,共转染BMP8B表达载体,检测荧光素酶活性。
验证BMP8B是否激活NF-κB信号并影响脂肪分化。
通过蛋白印迹检测磷酸化IKKα/β和p65,并使用NF-κB抑制剂JSH-23处理BMP8B过表达细胞,观察脂质积累变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 成脂分化 | 胰岛素 | -- | -- |
| 地塞米松 | -- | -- | |
| IBMX | -- | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Life Technologies | -- |
| qRT-PCR | Hifair® AdvanceFast一步法RT-gDNA消化SuperMix | -- | -- |
| ChamQ SYBR Color qPCR Master Mix | -- | -- | |
| Western blot | NP-40裂解液 | -- | -- |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| Omni-ECL™ Femto Light化学发光试剂盒 | -- | -- | |
| 荧光Western blot成像系统 | -- | -- | |
| 荧光素酶报告基因实验 | 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Yeasen | -- |
| 抑制剂处理 | DMH1 | Selleck | -- |
| TP0427736 HCl | Selleck | -- | |
| JSH-23 | Selleck | -- | |
| 抗体 | p-SMAD1/5/8抗体 | Affinity Biosciences | AF8313 |
| SMAD1/5/8抗体 | Affinity Biosciences | AF0614 | |
| p-SMAD2/3抗体 | Affinity Biosciences | AF3367 | |
| SMAD2/3抗体 | Affinity Biosciences | AF6367 | |
| C/EBPα抗体 | Affinity Biosciences | AF6333 | |
| p-ERK1/2抗体 | Affinity Biosciences | AF1015 | |
| ERK1/2抗体 | Affinity Biosciences | AF0155 | |
| p-p65抗体 | Affinity Biosciences | AF2006 | |
| p65抗体 | Affinity Biosciences | AF5006 | |
| p-IKKα/β抗体 | Affinity Biosciences | AF3013 | |
| IKKα/β抗体 | Affinity Biosciences | AF6014 | |
| p-ACC抗体 | Sangon Biotech | D155180 | |
| ACC抗体 | Sangon Biotech | D155300 | |
| BMP8B抗体 | Abcam | ab181253 | |
| 山羊抗兔IgG,HRP偶联 | CWBIO | CW0103S | |
| PPARγ抗体 | Bioss | bs-4590R | |
| p-p38 MAPK抗体 | Bioss | bs-2210R | |
| p38 MAPK抗体 | Bioss | bs-0637R | |
| β-actin抗体 | Bioss | bs-0061R | |
| p-JNK抗体 | Bioss | bs-1640R | |
| JNK抗体 | Bioss | bs-2592R | |
| 慢病毒包装 | psPAX2 | -- | -- |
| pMD2.G | -- | -- | |
| 筛选 | 嘌呤霉素 | -- | -- |
| RNA测序 | RNA测序服务 | Biomarker Technologies | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与分化 | 3T3-L1细胞来源(ATCC),培养条件(DMEM+10% FBS+1% 青霉素/链霉素),分化方案(接触抑制48小时后加入MDI(1 μg/mL胰岛素、0.25 μM DEX、0.5 mM IBMX)处理2天,再用胰岛素1 μg/mL处理2天,之后每2天换液) 阅读提示:Materials and Methods 2.2节 |
| BMP8B过表达/敲低 | 慢病毒载体(LV-Bmp8b、LV-shRNA-Bmp8b#1)、感染时间48小时、嘌呤霉素筛选浓度2 μg/mL 阅读提示:Materials and Methods 2.4节 |
| 信号通路抑制 | DMH1、TP0427736 HCl、JSH-23的浓度(5 μM),溶剂DMSO,处理时间(整个分化过程) 阅读提示:Materials and Methods 2.10节 |
| 报告基因检测 | HEK293T细胞,报告质粒(BRE-Luc、CAGA-Luc)、pRL-TK内参、共转染受体质粒(ALK2-7等)、检测时间(转染后2天) 阅读提示:Materials and Methods 2.5节 |
| 油红O染色定量 | 固定(4% PFA,20分钟)、染色步骤、定量方法(异丙醇萃取,OD492) 阅读提示:Materials and Methods 2.9节 |
| mRNA表达检测 | 引物序列(Table 1),内参Gapdh,qRT-PCR试剂和仪器 阅读提示:Materials and Methods 2.3节、Table 1 |
| 蛋白表达检测 | 抗体稀释比例(如1:1000),裂解缓冲液(NP-40),上样量(未明确),曝光条件(未明确) 阅读提示:Materials and Methods 2.7节、2.1节 |
| RNA-seq分析 | 样本数(每组3个),平台(Biomarker Technologies),分析工具(MKCloud) 阅读提示:Materials and Methods 2.6节 |
| 统计方法 | 重复次数(至少3次),统计软件(GraphPad Prism 8.0.2),检验方法(one-way ANOVA),显著性阈值(* p < 0.05, ** p < 0.01, *** p < 0.001) 阅读提示:Materials and Methods 2.11节 |