单细胞转录组分析
识别SAH后不同细胞类型间的信号通讯变化,特别是微血管与T细胞之间的相互作用。
分析公开的SAH小鼠白质单细胞RNA测序数据,通过CellChat推断细胞间通讯,识别CXCL12-CXCR4信号轴。
Single-cell sequencing reveals intracranial microvasculature-derived CXCL12 promotes CD8+ T-cell infiltration and blood-brain barrier dysfunction after subarachnoid hemorrhage in mice
包含单细胞转录组分析、免疫荧光、Western blot、ELISA、流式细胞术、行为学测试等多层级验证,并通过抗体和抑制剂进行功能干预,构成完整证据链。
成年雄性C57BL/6J小鼠蛛网膜下腔出血模型 小鼠脑皮质组织 单细胞RNA测序数据(来自SAH小鼠白质)
SAH模型诱导方法:血管内穿孔法 CXCL12通路干预:CXCL12中和抗体(80 ng/只,尾静脉注射,每日一次,连续3天) CXCR4拮抗剂AMD3100给药剂量:1 mg/kg,腹腔注射,每日一次,连续3天 重组CXCL12蛋白剂量:4 ng/mL,0.2 mL/只,尾静脉注射 关键检测时间点:SAH后1、3、7、14天
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
识别SAH后不同细胞类型间的信号通讯变化,特别是微血管与T细胞之间的相互作用。
分析公开的SAH小鼠白质单细胞RNA测序数据,通过CellChat推断细胞间通讯,识别CXCL12-CXCR4信号轴。
验证CXCL12在脑组织和外周血中的表达变化以及细胞来源。
使用Western blot、ELISA和免疫荧光检测CXCL12在脑皮质和血清中的水平,并定位其在CD31+内皮细胞和CD13+周细胞中的表达。
评估SAH后CD8+和CD4+ T细胞浸润的时间动态。
通过免疫荧光染色检测脑皮质中CD8+和CD4+ T细胞数量。
验证CXCL12-CXCR4信号在CD8+ T细胞浸润和脑损伤中的作用。
给予重组CXCL12蛋白、CXCL12中和抗体或AMD3100处理,通过流式细胞术和免疫荧光检测T细胞浸润,Western blot检测细胞毒性分子表达,并评估脑水肿。
评估CXCL12-CXCR4信号对血脑屏障完整性和内皮细胞凋亡的影响。
使用伊文思蓝渗漏实验、ZO-1免疫荧光染色和TUNEL染色评估BBB损伤。
评估CXCL12对神经元和轴突损伤的影响。
通过TUNEL染色检测神经元凋亡,TUJ1/GSDMD免疫荧光检测轴突焦亡,透射电镜观察超微结构并计算G-ratio。
评估CXCL12-CXCR4信号对神经功能恢复的影响。
通过旷场实验、平衡木实验和改良Garcia评分评估小鼠神经功能。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫荧光染色 | 冷冻切片机 | Leica | CM3050S-3-1-1 |
| 增强免疫染色通透缓冲液 | P400 Biotechnology | P0097 | |
| QuickBlock™免疫染色封闭液 | Beyotime | P0260 | |
| 抗CD31抗体 | Immunoway | YT0752 | |
| 抗CD13抗体 | Invitrogen | MA1-33449 | |
| 抗Iba-1抗体 | ServiceBio | GB12105 | |
| 抗GFAP抗体 | Novus Biologicals | NB100-53809 | |
| 抗CXCL12抗体 | Immunoway | YT4225 | |
| 抗CD8抗体 | HUABIO | 0108-7 | |
| 抗CD4抗体 | Immunoway | YT0762 | |
| 抗CXCR4抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-54534 | |
| TUNEL试剂盒 | Beyotime | C1089 | |
| 含DAPI的抗淬灭封片剂 | Beyotime | P0131 | |
| 超高分辨率倒置共聚焦显微镜 | Zeiss | LSM880 | |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0010 |
| 即时蛋白上样缓冲液 | EpiZyme | LT103 | |
| SDS-PAGE凝胶 | EpiZyme | LK304, | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| 无蛋白快速封闭液 | EpiZyme | PS108P | |
| 抗穿孔素抗体 | Immunoway | YT5792 | |
| 抗颗粒酶B抗体 | Immunoway | YT6137 | |
| 增强化学发光试剂盒 | Pierce | -- | |
| Fusion FX Edge Spectra多功能成像系统 | Vilber Bio Imaging | -- | |
| ELISA | CXCL12 ELISA试剂盒 | Signalway Antibody | EK7419 |
| 药物干预 | CXCL12中和抗体 | R&D Systems | MAB310-100 |
| AMD3100 | Sigma-Aldrich | A5602 | |
| 重组小鼠CXCL12蛋白 | MedChemExpress | HY-P72782 | |
| 流式细胞术 | FITC偶联抗CD3抗体 | -- | -- |
| BV421偶联抗CD4抗体 | -- | -- | |
| APC偶联抗CD8抗体 | -- | -- | |
| PerCP偶联抗CD45抗体 | -- | -- | |
| BD LSRFortessa™流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 血脑屏障评估 | 伊文思蓝染料 | Solarbio | IE0280 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| SAH模型 | 建模方法:血管内穿孔法;小鼠品系:C57BL/6J;性别:雄性;年龄8-10周;体重22-25g;SAH严重程度评分≥8 阅读提示:Materials and methods, SAH model |
| CXCL12通路干预 | 抗体剂量:80 ng/只(0.2 mL,静脉注射,每日一次,连续3天);AMD3100剂量:1 mg/kg(腹腔注射,每日一次);重组CXCL12剂量:4 ng/mL(0.2 mL,静脉注射) 阅读提示:Materials and methods, Administration of CXCL12 neutralizing antibody, AMD3100, or recombinant CXCL12 protein |
| T细胞浸润检测 | 流式抗体组合:CD3-FITC、CD4-BV421、CD8-APC、CD45-PerCP;样本:脑皮层单细胞悬液;检测时间点:1、3、7、14天 阅读提示:Materials and methods, Flow cytometry |
| 血脑屏障评估 | 伊文思蓝注射浓度和体积:2%,5 mL/kg;检测时间:注射后1小时;定量方法:620 nm吸光度;半定量:555 nm荧光 阅读提示:Materials and methods, Evans blue leakage |
| 神经功能评估 | 评估时间点:1、3、7、14天;行为学设备规格;评估者设盲 阅读提示:Materials and methods, Neurobehavioral testing |