检测备解素表达水平与来源
评估缺血后脑中备解素的表达变化及其细胞来源
通过Western blot和ELISA检测tMCAO后不同时间点脑和血清备解素水平;利用单细胞RNA测序和免疫荧光染色确定脑内备解素的细胞来源。
Infiltrating myeloid cell-derived properdin markedly promotes microglia-mediated neuroinflammation after ischemic stroke
包含转基因小鼠体内模型(全身性和髓系特异性敲除)、原代细胞体外实验、单细胞RNA测序及转录组分析、分子互作验证(Co-IP、PLA)等多层级验证,并进行了功能与机制验证。
C57BL/6J小鼠tMCAO缺血性脑卒中模型 Cfp−/−(全身性敲除)小鼠 LysM-cre Cfpfl/fl(髓系特异性敲除)小鼠 原代小胶质细胞和原代皮层神经元
tMCAO模型中缺血时间60分钟 Cfp基因敲除小鼠品系(Cfp−/−和LysM-cre Cfpfl/fl) 重组小鼠备解素(rmProperdin)处理浓度(2、4、8 µg/ml) 慢病毒shRNA敲低Clec4e(MOI=40) 小胶质细胞条件培养基孵育神经元12小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估缺血后脑中备解素的表达变化及其细胞来源
通过Western blot和ELISA检测tMCAO后不同时间点脑和血清备解素水平;利用单细胞RNA测序和免疫荧光染色确定脑内备解素的细胞来源。
明确备解素在缺血性脑损伤中的作用
对Cfp−/−和WT小鼠行tMCAO,评估神经功能(mNSS、握力、转棒)、梗死体积(TTC染色)和神经元凋亡(TUNEL)。
研究备解素是否影响小胶质细胞介导的炎症反应
通过qPCR检测炎症基因表达;免疫荧光染色和三维重建分析小胶质细胞形态;FACS分选小胶质细胞进行PCR array和流式检测细胞因子。
检测重组备解素是否直接激活小胶质细胞并增强其神经毒性
原代小胶质细胞经不同浓度rmProperdin处理,检测炎症因子表达;收集条件培养基处理原代神经元,评估神经元活力(CCK8)和凋亡(Calcein-AM/PI)。
探索备解素处理小胶质细胞后差异表达基因及信号通路
对8 µg/ml rmProperdin处理3h的原代小胶质细胞进行RNA-seq,并进行GO、KEGG和GSEA富集分析。
确认备解素是否直接结合Mincle并激活其下游通路
qPCR和Western blot检测Mincle表达;Duolink PLA和Co-IP验证备解素-Mincle结合;Western blot检测p-Syk、p-p65、C/EBPβ水平。
明确Mincle在备解素诱导小胶质细胞炎症中的必要性
用慢病毒shRNA敲低原代小胶质细胞Clec4e,检测下游信号通路、炎症因子表达及条件培养基对神经元活力的影响。
确认巨噬细胞和中性粒细胞来源的备解素在脑损伤中的作用
对LysM-cre Cfpfl/fl小鼠行tMCAO,检测小胶质细胞炎症因子、神经功能和梗死体积。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型 | C57BL/6J小鼠 | -- | -- |
| 基因敲除小鼠构建 | Cfp-/-小鼠 | Cyagen Biosciences | -- |
| Cfpfl/fl小鼠 | Cyagen Biosciences | -- | |
| 动物麻醉 | 三溴乙醇 | -- | -- |
| 脑血流监测 | 激光散斑对比成像 | -- | -- |
| 行为学测试 | 握力计 | Bioseb | -- |
| 转棒式疲劳仪 | RWD Life Science | -- | |
| 梗死体积评估 | 2,3,5-氯化三苯基四氮唑 | Sigma-Aldrich | -- |
| 原代细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 原代神经元培养 | Neurobasal培养基 | -- | -- |
| B27添加剂 | -- | -- | |
| GlutaMAX添加剂 | -- | -- | |
| 多聚-D-赖氨酸 | -- | -- | |
| 细胞处理 | 重组小鼠备解素 | Cusabio | -- |
| 细胞活力检测 | CCK8溶液 | MedChemExpress | -- |
| 酶标仪 | Tecan Trading AG | -- | |
| 慢病毒敲低 | 靶向Clec4e的慢病毒shRNA | GeneChem | -- |
| 慢病毒感染 | 聚凝胺 | -- | -- |
| 流式分选 | Percoll分离液 | -- | -- |
| 抗小鼠CD45抗体 | BioLegend | 103114 | |
| 抗小鼠CD11b抗体 | Thermo Fisher Scientific | 53-0112-82 | |
| BD FACSAria™ III流式细胞分选仪 | BD | -- | |
| 流式检测 | PE抗TNF-α抗体 | Thermo Fisher Scientific | 12-7321-81 |
| PE抗IL-6抗体 | BioLegend | 504503 | |
| APC抗IL-1β抗体 | Cell Signaling Technology | 31202 | |
| BD LSRFortessa流式细胞仪 | BD | -- | |
| PCR array | PCR芯片 | Wcgene Biotech | -- |
| RNA测序 | TRIzol试剂 | -- | -- |
| NanoDrop 2000分光光度计 | Thermo Scientific | -- | |
| Agilent 2100生物分析仪 | Agilent | -- | |
| TruSeq链式mRNA文库制备试剂盒 | Illumina | -- | |
| Illumina测序平台(HiSeqTM 2500或HiSeq X Ten) | Illumina | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| 抗备解素抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-393723 | |
| 抗Mincle抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-390806 | |
| 抗p-Syk抗体 | Cell Signaling Technology | 2711 | |
| 抗Syk抗体 | Cell Signaling Technology | 2712 | |
| 抗p-p65抗体 | Cell Signaling Technology | 3033 | |
| 抗p65抗体 | Bioworld Technology | BS1257 | |
| 抗C/EBPβ抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-7962 | |
| 抗GAPDH抗体 | Bioworld Technology | AP0063 | |
| GEL-Pro成像系统 | Tanon Technologies | -- | |
| ELISA | 备解素ELISA试剂盒 | Signalway Antibody | -- |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | -- | -- |
| 驴血清 | -- | -- | |
| 抗Ly6G抗体 | Cell Signaling Technology | 87048 | |
| 抗备解素抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-365634 | |
| 抗TMEM119抗体 | Abcam | ab209064 | |
| 抗Iba-1抗体 | Abcam | ab5076 | |
| 含DAPI的抗淬灭封片剂 | Beyotime | -- | |
| TUNEL | TUNEL检测试剂盒 | Vazyme | -- |
| 免疫荧光 | 共聚焦显微镜(Olympus FV3000) | Olympus | -- |
| qPCR | HiScript III Q RT SuperMix逆转录试剂盒 | Vazyme | -- |
| AceQ qPCR SYBR® Green预混液 | Vazyme | -- | |
| Roche LightCycler 96 PCR仪 | Roche | -- | |
| Co-IP | 蛋白A/G PLUS-琼脂糖珠 | Millipore | -- |
| 小鼠对照IgG | Millipore | -- | |
| PLA | Duolink邻位连接试剂盒 | Sigma-Aldrich | -- |
| 数据分析 | ImageJ软件 | -- | -- |
| FlowJo软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系、性别、年龄、tMCAO缺血时间(60分钟)、麻醉方式(三溴乙醇) 阅读提示:Methods: tMCAO and laser speckle contrast imaging (LSCI) |
| 基因敲除策略 | Cfp−/−和Cfpfl/fl小鼠构建背景、LysM-cre介导的髓系特异性敲除、基因分型引物 阅读提示:Methods: Mouse strains and genotyping |
| 原代细胞培养 | 小胶质细胞和神经元分离方法、培养基成分、培养时间(10天) 阅读提示:Methods: Primary microglia and primary cortical neuron culture |
| 体外刺激 | rmProperdin浓度(2、4、8 µg/ml)、处理时间(24h或3h)、对照(PBS) 阅读提示:Results: Recombinant mouse properdin (rmProperdin) activates microglia... |
| 慢病毒敲低 | Clec4e shRNA序列、MOI=40、polybrene浓度(10 μg/ml)、感染时间(8h)和培养时间(3天) 阅读提示:Methods: Lentiviral knockdown of Clec4e |
| 小胶质细胞分选 | CD45intCD11b+门控策略、Percoll梯度离心条件 阅读提示:Methods: Fluorescence-activated cell sorting (FACS) and flow cytometry analysis |
| 蛋白互作验证 | Co-IP所用抗体(anti-Mincle)、PLA所需抗体和试剂盒 阅读提示:Methods: Co-immunoprecipitation (Co-IP) 和 Duolink proximity ligation assay (PLA) |
| 统计分析 | 统计方法(t检验、单因素方差分析、双因素方差分析)和显著性阈值(P < 0.05) 阅读提示:Methods: Statistics analysis |