TMZ耐药模型建立与ICAM1表达检测
确定TMZ耐药细胞中ICAM1是否上调,并验证其临床相关性。
通过逐步递增TMZ浓度诱导建立TMZ-R细胞系,并通过异种移植瘤建立体内耐药模型;检测ICAM1 mRNA和蛋白表达,分析公共数据库(CGGA、GLASS、TCGA)中复发患者ICAM1表达与生存的关系。
Intercellular adhesion molecule-1 suppresses TMZ chemosensitivity in acquired TMZ-resistant gliomas by increasing assembly of ABCB1 on the membrane
包含体外TMZ耐药细胞模型、体内异种移植瘤和原位瘤模型、患者数据库分析,以及基因敲除/过表达、蛋白互作和脂筏分离等机制验证。
TMZ耐药人胶质瘤细胞系(U87R、U251R、T98GR、U138R、U118R、A172R) U251R和GL261R异种移植瘤模型(裸鼠和C57BL/6J小鼠)
TMZ耐药细胞中ICAM1的表达水平及其在细胞膜上的定位 ICAM1敲低或敲除后TMZ处理的细胞活力和增殖变化 ICAM1调控的ABCB1在细胞膜上的表达及其对TMZ细胞内积累的影响 moesin的磷酸化状态和ICAM1/moesin/ABCB1复合物在脂筏中的组装
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定TMZ耐药细胞中ICAM1是否上调,并验证其临床相关性。
通过逐步递增TMZ浓度诱导建立TMZ-R细胞系,并通过异种移植瘤建立体内耐药模型;检测ICAM1 mRNA和蛋白表达,分析公共数据库(CGGA、GLASS、TCGA)中复发患者ICAM1表达与生存的关系。
验证ICAM1是否影响TMZ耐药细胞的增殖和对TMZ的敏感性。
在TMZ-R细胞中通过shRNA或CRISPR-Cas9敲低/敲除ICAM1,检测细胞活力、克隆形成和体内肿瘤生长。
确定ICAM1哪个结构域(胞外、跨膜、胞内)负责介导TMZ耐药。
构建ICAM1截短突变体(全长、ED、TC、TM),转染TMZ-R细胞,检测细胞增殖和ICAM1膜定位。
验证ICAM1是否通过影响TMZ的细胞内积累和外排来调节耐药。
检测ICAM1敲低/过表达或突变后细胞内TMZ浓度,并通过Rhodamine 123积累实验评估外排功能。
探究ICAM1是否通过调控ABCB1膜表达影响TMZ外排,以及moesin是否参与其中。
检测ICAM1调控下ABCB1总表达和膜表达的变化;通过IP、ELISA-IP和脂筏分离实验验证ICAM1/moesin/ABCB1复合物的组装及moesin磷酸化。
验证ICAM1敲低或敲除在体内是否增强TMZ的抗肿瘤效果。
建立U251R异种移植瘤和GL261R原位瘤模型,敲低/敲除ICAM1,给予TMZ治疗,评估肿瘤生长和ICAM1/ABCB1表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Keygen | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 药物处理 | 替莫唑胺 | Selleck Chemicals Inc | S1237 |
| 细胞刺激 | 佛波醇12-十四酸酯13-乙酸酯 | Sigma-Aldrich | P8139 |
| 植物血凝素 | MedChemExpress | HY-N7038 | |
| 药物诱导 | 多西环素 | MedChemExpress | -- |
| 转染 | ExFect转染试剂 | Vazyme Biotech | -- |
| 聚凝胺 | MCE | -- | |
| Western blot | ICAM1抗体 | Proteintech | 10831-1-AP |
| ABCB1抗体 | Proteintech | 22336-1-AP | |
| Moesin抗体 | Proteintech | 16495-1-AP | |
| 磷酸化Moesin(558)抗体 | Abcam | ab177943 | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 10494-1-AP | |
| 细胞学实验 | γH2AX抗体 | Beijing biosynthesis biotechnology | bsm-52163R |
| 免疫荧光 | keyFluor 488和568二抗 | Keygen Biotech | -- |
| 分子克隆 | QuickCut™ Xho I限制酶 | Taraka | 1635 |
| QuickCut™ BamH I限制酶 | Taraka | 1605 | |
| QuickCut™ EcoR I限制酶 | Taraka | 1611 | |
| ELISA | ICAM1 ELISA试剂盒 | Jinyibai Biological Technology | JEB-10163 |
| 脂筏提取 | ULTRARIPA®脂筏提取试剂盒 | Funakoshi | F015 |
| 免疫沉淀 | 蛋白A/D-琼脂糖 | Beyotime | -- |
| 用于免疫沉淀的抗兔IgG | Vazyme | RA1008-01 | |
| ELISA-IP | TMB显色液 | Beyotime | P0209 |
| 终止液 | Beyotime | P0215 | |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0010 |
| 小动物成像 | D-荧光素 | PerkinElmer | -- |
| IVIS Lumina成像系统 | Xenogen | -- | |
| 组织切片扫描 | NanoZoomer 2.0 RS数字切片扫描仪 | Hamamatsu Photonics | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| TMZ耐药细胞建立 | 初始TMZ浓度(IC50的1/10)、浓度递增倍数(2倍)、每浓度处理时间(15-21天)、总诱导时间(3-9个月) 阅读提示:Materials and methods: The establishment of TMZ-R model |
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基(DMEM+10%FBS)、培养条件(37°C、5%CO2)、耐药细胞维持TMZ浓度(20 μM) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture |
| ICAM1敲低/敲除 | shRNA/sgRNA序列、转染试剂(ExFect)、转染时间(24h)、筛选方法 阅读提示:Materials and methods: Plasmid construction, lentivirus production, knockdown, overexpression assay and transduction |
| TMZ敏感性检测 | TMZ浓度(0-2000 μM)、处理时间(48h)、检测方法(MTT、克隆形成) 阅读提示:Figure legends: Fig. 2C-F |
| 体内实验 | 动物品系、细胞注射数量、分组、TMZ给药剂量(5 mg/kg)、给药频率(每周3次,共3周)、肿瘤测量方法 阅读提示:Materials and methods: In vivo study |