临床样本关联分析
评估eEF2K表达与黑色素瘤患者抗PD-1治疗反应和预后的相关性。
对38例接受PD-1 mAb治疗的肢端黑色素瘤患者肿瘤组织进行免疫组化染色,分析eEF2K、PD-L1、p-GSK3β/S9表达,并评估其与临床反应(CR/PR/SD/PD)和总生存期的关联。
eEF2K promotes PD-L1 stabilization through inactivating GSK3β in melanoma
研究包含患者队列关联分析、体外细胞功能与机制实验(IP-MS、GST pull-down、激酶实验)、体内小鼠肿瘤模型及联合治疗评估,涵盖多层次验证。
人黑色素瘤细胞系A375、SK-5、SK-28 小鼠黑色素瘤细胞系B16F10 B16F10同种移植瘤小鼠模型(C57BL/6) 38例肢端黑色素瘤患者队列
患者队列:38例接受PD-1 mAb治疗的肢端黑色素瘤患者样本(2016-2020年) 细胞处理:siRNA敲低或Flag-eEF2K过表达处理48-72小时 蛋白质合成抑制:CHX(50 μg/mL)处理不同时间检测PD-L1半衰期 蛋白酶体抑制:MG132(10 μM)处理4小时 动物模型:B16F10细胞接种于C57BL/6小鼠,抗PD-1抗体(75 μg)在接种后第6、9、12、15、18天腹腔注射
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估eEF2K表达与黑色素瘤患者抗PD-1治疗反应和预后的相关性。
对38例接受PD-1 mAb治疗的肢端黑色素瘤患者肿瘤组织进行免疫组化染色,分析eEF2K、PD-L1、p-GSK3β/S9表达,并评估其与临床反应(CR/PR/SD/PD)和总生存期的关联。
验证eEF2K是否调控PD-L1表达,并阐明其分子机制。
在人黑色素瘤细胞系(A375、SK-5、SK-28)和小鼠B16F10细胞中敲低或过表达eEF2K,检测PD-L1蛋白和mRNA水平;使用CHX和MG132处理分析PD-L1稳定性;通过IP-MS、co-IP、GST pull-down、免疫荧光和体外激酶实验验证eEF2K与GSK3β的直接相互作用及磷酸化位点。
评估eEF2K敲低对肿瘤生长和肿瘤浸润T细胞的影响,并验证CD8+ T细胞的作用。
将对照或eEF2K敲低的B16F10细胞皮下接种到免疫缺陷裸鼠和免疫活性C57BL/6小鼠,监测肿瘤生长;通过流式细胞术分析肿瘤浸润CD8+ T细胞比例和GZMB表达;部分小鼠用CD8α抗体清除CD8+ T细胞观察肿瘤生长变化。
检测eEF2K抑制(NH125或敲低)与PD-1 mAb联用的抗肿瘤效果。
在B16F10同种移植瘤模型中,单独或联合给予NH125和PD-1 mAb,或使用eEF2K敲低的肿瘤细胞联合PD-1 mAb,观察肿瘤生长、体重变化及肿瘤组织中CD8+ T细胞浸润和GZMB表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜尔贝科改良伊格尔培养基 | -- | -- |
| RPMI 1640培养基 | -- | -- | |
| 药物处理 | MG132 | Selleck | -- |
| 转染 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Invitrogen | -- |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| 细胞处理 | Opti-MEM减血清培养基 | -- | -- |
| 蛋白检测 | 嘌呤霉素 | -- | -- |
| 免疫沉淀 | Protein A/G琼脂糖珠 | Santa Cruz | -- |
| GST pull-down | 谷胱甘肽-琼脂糖4B珠 | Sigma | -- |
| 细胞表型检测 | APC偶联抗人PD-L1抗体 | Proteintech | APC-65081 |
| 免疫荧光 | 抗eEF2K抗体 | Abcam | ab96685 |
| 抗GSK3β抗体 | Proteintech | 67329-1-lg | |
| Alexa Fluor 594偶联抗小鼠IgG | -- | -- | |
| Alexa Fluor 488偶联抗兔IgG | -- | -- | |
| DAPI | -- | -- | |
| 体外激酶实验 | 重组GSK3β蛋白 | -- | -- |
| 活性eEF2K蛋白 | -- | -- | |
| 10x激酶缓冲液 | Cell Signaling Technology | 9802 | |
| ATP | Cell Signaling Technology | 9804 | |
| PD-L1/PD-1相互作用检测 | 重组人PD-1 Fc嵌合蛋白 | MCE | -- |
| 抗人IgG/Alexa Fluor 488染料偶联物 | Bioss | -- | |
| 动物实验 | 抗PD-1单克隆抗体(克隆J43) | Bio X Cell | BE0033-2 |
| 抗CD8α抗体 | Bio X Cell | BP0117 | |
| 同型IgG对照 | Bio X Cell | BE0091, | |
| 药物处理 | NH125 | -- | -- |
| 流式细胞术 | eBioscience可固定活力染料eFluor 780 | eBiosciences | 65-0865-14 |
| FITC标记抗CD45抗体 | eBiosciences | 11-0451-81 | |
| PerCP/Cy5.5标记抗CD3抗体 | eBiosciences | 45-0031-80 | |
| PE/Cy7标记抗CD8抗体 | eBiosciences | 25-0081-81 | |
| APC标记抗GZMB抗体 | eBiosciences | 17-8898-80 | |
| 免疫印迹 | 抗eEF2K抗体 | Abcam | ab45168, |
| 抗PD-L1抗体 | Proteintech | 17952-1-AP | |
| 抗GSK3β抗体 | Proteintech | 22104-1-AP | |
| 抗β-actin抗体 | Proteintech | 60008-1-lg | |
| 抗Flag抗体 | Proteintech | 66008-3-lg | |
| 抗tubulin抗体 | Proteintech | 11224-1-AP | |
| 抗GST抗体 | Proteintech | 10000-0-AP | |
| 抗HA抗体 | Cell Signaling Technology | 3724 | |
| 抗p-GSK3β/S9抗体 | Cell Signaling Technology | 9323 | |
| 磷酸丝氨酸单克隆抗体 | CUSABIO | CSB-MA080235 | |
| 正常IgG/过氧化物酶偶联AffiniPure山羊抗兔/小鼠IgG (H+L) | Jackson Immuno Research | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本与免疫组化 | 样本来源:38例肢端黑色素瘤患者,接受帕博利珠单抗(Keytruda)治疗;IHC染色评分标准(阳性细胞百分比和染色强度评分) 阅读提示:Materials and methods - Patients and tissue samples、Immunohistochemical staining、Semi-quantitative analysis of IHC staining |
| 细胞培养与转染 | 细胞系(A375、SK-5、SK-28、B16F10)培养条件(DMEM或RPMI1640+10% FBS+双抗);siRNA转染浓度(50 nM)和转染试剂(Lipofectamine RNAiMAX);质粒转染(Flag-eEF2K)使用Lipofectamine 2000 阅读提示:Materials and methods - Cell lines and culture、siRNA, short hairpin RNA and plasmid transfection |
| 蛋白稳定性分析 | CHX处理浓度(50 μg/mL)及时间梯度;MG132浓度(10 μM)及处理时间(4小时) 阅读提示:Materials and methods - Pulse-chase assay; Results - eEF2K upregulates PD-L1 expression by inhibiting its proteasome-mediated degradation (Figure 2E, F) |
| 体外激酶实验 | 重组GSK3β用量(1 μg)和eEF2K用量(200 ng);ATP浓度(200 μM)和孵育条件(30°C、1小时) 阅读提示:Materials and methods - In vitro kinase assay |
| 动物实验与联合治疗 | B16F10细胞接种数(5×10^5);小鼠品系(C57BL/6和Balb/c裸鼠);NH125剂量(500 μg/kg,每日一次,2周);抗PD-1抗体剂量(75 μg)和时间点(第6、9、12、15、18天) 阅读提示:Materials and methods - Animal studies; Results - eEF2K inhibition synergistically enhanced the therapeutic efficacy of PD-1 blockade in vivo |