患者队列与样本收集
收集癌症手术患者的血液样本,用于分析术后MDSC的变化。
从55名癌症手术患者和6名健康志愿者中收集外周血样本,术前和术后第1天分离PBMCs。
Preventing surgery-induced natural killer cell suppression and metastases by inhibiting PI3K-gamma signaling in myeloid-derived suppressor cells
包含患者队列流式细胞术、单细胞RNA测序、体外共培养抑制实验、小分子筛选及小鼠手术应激模型等功能验证和机制验证。
癌症手术患者外周血单个核细胞 NK92-MI细胞系与K562靶细胞 C57Bl/6小鼠手术应激模型 B16F10-lacZ黑色素瘤转移模型
患者入组排除标准:排除术前接受化疗、放疗或免疫治疗以及术中输血的患者 scRNA-seq患者仅来自腹部癌症手术,且部分接受精氨酸补充或对照补充 MDSC:NK共培养比例如4:1,共培养时间24小时 小分子筛选浓度1μM,孵育时间1小时 小鼠给药方案:TG100-115 6 mg/kg腹腔注射每日一次,IPI-549 30 mg/kg口服每日两次
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
收集癌症手术患者的血液样本,用于分析术后MDSC的变化。
从55名癌症手术患者和6名健康志愿者中收集外周血样本,术前和术后第1天分离PBMCs。
定义手术诱导的MDSC亚群及其表型变化。
使用多色流式细胞术分析CD33+Lin−细胞的比例,并区分M-MDSC、PMN-MDSC和E-MDSC亚群。
揭示手术后单核细胞/髓系细胞的转录组变化。
对6名患者的基线及POD1冻存PBMC进行scRNA-seq,并进行差异表达分析、GSEA和NMF分析。
验证sx-MDSCs对NK细胞杀伤功能的抑制作用。
将分选的sx-MDSCs与NK92-MI细胞共培养,检测NK细胞对K562靶细胞的杀伤率。
鉴定能够解除sx-MDSC抑制活性的化合物。
在MDSC:NK共培养体系中筛选147种小分子化合物,以NK细胞杀伤率恢复>50%为命中标准。
验证PI3K-γ信号在sx-MDSC抑制功能中的必要性。
使用PI3K抑制剂(LY294002、IPI-549、TG100-115)处理共培养体系,检测NK细胞杀伤率及AKT磷酸化水平。
评估PI3K-γ抑制在体内对术后转移的影响。
小鼠手术应激模型(剖腹手术+肾切除),给予PI3K-γ抑制剂,检测sx-MDSC抑制功能、NK细胞杀伤和肺转移数量。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 样本处理 | Ficoll密度梯度离心 | GE HealthCare | 17-1440-03 |
| 细胞培养 | RPMI培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 细胞分离 | CD33微珠 | Miltenyi | 130-045-501 |
| CD15微珠 | Miltenyi | 130-046-601 | |
| Histopaque 1077 | Sigma-Aldrich | 10771 | |
| Histopaque 1119 | Sigma-Aldrich | 11191 | |
| 细胞毒性实验 | 细胞增殖染料eFluor 450 | eBioscience | 65-0842-90 |
| 溴化乙锭同二聚体 | Invitrogen | E1169 | |
| 流式细胞术 | 可固定活力染料 | BD | 564406 |
| CD33抗体(克隆P67.6) | BioLegend | 366617 | |
| CD14抗体(克隆MθP9) | BD | 561709 | |
| CD11b抗体(克隆ICRF44) | Novus | FAB1699N | |
| HLA-DR抗体(克隆L243) | BioLegend | 307609 | |
| CD15抗体(克隆MMA) | eBioscience | 48-0158-41 | |
| CD124抗体(克隆25463) | R&D systems | FAB230P-025 | |
| CD3抗体(克隆UCHT1) | BioLegend | 300440 | |
| CD56抗体(克隆NCAM16.2) | BD Biosciences | 340410 | |
| CD19抗体(克隆HIB19) | BioLegend | 302205 | |
| LOX-1抗体(克隆15C4) | BioLegend | 358603 | |
| VISTA抗体(克隆730804) | R&D systems | FAB71261N | |
| PD-L1抗体(克隆MIH1) | eBioscience | 12-5983-42 | |
| Cytofix/Cytoperm试剂盒 | BD | 554714 | |
| Arg1抗体(APC) | R&D systems | IC5868A | |
| scRNA-seq | 10x Genomics Chromium单细胞3'平台 | 10x Genomics | -- |
| NextSeq 500 | Illumina | -- | |
| RT-qPCR | RNeasy Plus试剂盒 | Qiagen | 4134 |
| High-Capacity cDNA反转录试剂盒 | Applied Biosystems | 4374966 | |
| SsoAdvanced Universal SYBR Green Supermix | Bio-Rad | 1725271 | |
| PI3K抑制实验 | IPI-549 | Selleckchem | S8330 |
| TG100-115 | -- | -- | |
| 磷酸化检测 | AKT pT308抗体(克隆D25E6) | Cell Signaling Technology | 13038S |
| AKT pS473抗体(克隆M89-61) | BD Biosciences | 561670 | |
| Lyse/Fix缓冲液 | BD Biosciences | 558049 | |
| 固定缓冲液 | BD Biosciences | 554655 | |
| Perm缓冲液III | BD Biosciences | 558050 | |
| 动物实验 | PEG-300 | Sigma-Aldrich | 8.07484 |
| PEG-400 | Sigma-Aldrich | 25322-68-3 | |
| 5-0 Polysorb缝线 | Covidien | SL5687G | |
| 细胞过滤器 | Thermo Fisher Scientific | 08-771-2 | |
| MDSC分离试剂盒 | Miltenyi | 130-094-538 | |
| EasySep NK细胞分离试剂盒 | STEMCELL | 100-0960 | |
| 重组IL-2 | Thermo Fisher Scientific | CB-40043 | |
| 转移评估 | X-Gal | Thermo Fisher Scientific | R0404 |
| 成像 | Nikon Te2000e显微镜 | Nikon | -- |
| Zeiss SteREO Discovery模块化显微镜 | Zeiss | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者入组 | 排除标准:术前化疗、放疗、免疫治疗,术中输血 阅读提示:Materials and methods, Study design |
| MDSC分离 | 分选纯度 阅读提示:Methods, Cell lines and isolation of sx-MDSC subsets |
| 共培养抑制实验 | MDSC与NK细胞比例、共培养时间、靶细胞数量 阅读提示:Methods, MDSC:NK92 suppression assay |
| 小分子筛选 | 化合物浓度、孵育时间、筛选标准 阅读提示:Methods, Small molecule screen for MDSC antagonists |
| 小鼠手术模型 | 手术类型、麻醉方案、药物剂量及给药方式 阅读提示:Methods, Murine surgical stress model |
| 转移评估 | 肿瘤细胞数量、静脉注射、肺转移计数时间 阅读提示:Methods, Assessment of postoperative metastases |