构建肝细胞特异性EGFR敲除小鼠模型
生成肝细胞特异性EGFR缺失的小鼠,以研究EGFR在AILI中的细胞特异性作用。
给EGFRfl/fl小鼠腹腔注射AAV8.TBG.Cre(AAV-Cre组)或AAV8.TBG.eGFP(AAV-GFP对照组),1周后确认EGFR敲除效率。
Hepatocyte-specific epidermal growth factor receptor (EGFR) deletion attenuates acetaminophen-induced liver injury in mice
研究包含体内动物模型(EGFR条件敲除小鼠)、组织学与血清生化检测、蛋白免疫印迹、RNA-seq转录组分析、透射电镜验证自噬等多个独立证据层级,并进行了功能验证(自噬抑制剂)和机制验证。
EGFRflox/flox小鼠(AAV8.TBG.Cre介导的肝细胞特异性EGFR敲除) C57BL/6J背景小鼠
APAP剂量:500 mg/kg,腹腔注射 AAV8.TBG.Cre注射剂量:2.5 × 10^11 病毒颗粒/只 AAV8注射后1周进行APAP处理 APAP处理前禁食16小时 leupeptin给药方案:40 mg/kg,腹腔注射,APAP后8小时及处死前5小时 样本量:n = 3-5
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
生成肝细胞特异性EGFR缺失的小鼠,以研究EGFR在AILI中的细胞特异性作用。
给EGFRfl/fl小鼠腹腔注射AAV8.TBG.Cre(AAV-Cre组)或AAV8.TBG.eGFP(AAV-GFP对照组),1周后确认EGFR敲除效率。
诱导严重AILI,并评估EGFR缺失对肝损伤进展的影响。
小鼠禁食16小时后腹腔注射500 mg/kg APAP,在0、1、3、6、12、24小时收集血液和肝脏样本。
量化肝损伤程度,比较EGFR缺失对早期和后期损伤的影响。
测量血清ALT和AST水平,H&E染色评估坏死面积。
确定EGFR缺失是否影响APAP代谢活化和氧化应激的初始阶段。
检测CYP2E1表达、APAP-蛋白加合物形成和肝内GSH水平。
探究EGFR缺失是否影响JNK激活及其线粒体转位,以及下游线粒体损伤介质。
免疫印迹检测总肝裂解物中JNK磷酸化,分离线粒体和胞质部分检测磷酸化JNK和AIF水平,TUNEL染色评估核DNA损伤。
无偏倚地鉴定EGFR缺失后改变的信号通路和上游调控因子。
从肝脏样本提取RNA,进行RNA-seq,并使用IPA和DAVID分析通路和上游调控因子。
验证转录组分析中自噬和TFEB信号的激活,并评估其与肝损伤进展的关系。
通过免疫印迹检测TFEB(总蛋白和核蛋白),LC3-II、ATG蛋白,以及电子显微镜观察线粒体自噬结构;并用自噬抑制剂leupeptin处理EGFR缺陷小鼠。
评估EGFR缺失对严重APAP过量后肝细胞代偿性增殖的影响。
免疫印迹和免疫组化检测PCNA和CyclinD1表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物处理 | AAV8.TBG.PI.Cre.rBG | Addgene | 107787-AAV8 |
| AAV8.TBG.PI.eGFP.WPRE.bGH8 | Addgene | 105535-AAV8 | |
| 对乙酰氨基酚 | Sigma Aldrich | -- | |
| 血清生化检测 | ALT | -- | -- |
| AST | -- | -- | |
| 组织学 | Cytoseal | -- | -- |
| 免疫组织化学 | PCNA抗体 | CST | 2586 |
| Cyclin-D1抗体 | CST | 55506 | |
| TUNEL检测 | TUNEL检测试剂盒 | Sigma Aldrich | S7100 |
| 电镜样品制备 | Karnovsky固定液 | -- | -- |
| Poly/Bed 812树脂 | -- | -- | |
| 电镜成像 | JEOL 1400 Plus透射电子显微镜 | JEOL | -- |
| AMT 2k数码相机 | Advanced Microscopy Techniques | -- | |
| GSH检测 | GSH检测试剂盒 | Sigma Aldrich | CS0260 |
| 线粒体分离 | 组织线粒体分离试剂盒 | Thermo Scientific | 89801 |
| 线粒体裂解 | CHAPS水合物 | Sigma Aldrich | C5070 |
| 核分离 | NE-PER核和胞质提取试剂盒 | Thermo Scientific | 78835 |
| 蛋白提取 | 组织蛋白提取试剂 | Thermo Scientific | 78510 |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Thermo Scientific | 1861284 | |
| 蛋白定量 | Pierce BCA蛋白检测试剂盒 | Thermo Scientific | 23225 |
| Western blot | 4-12% NuPage Bis-Tris凝胶 | Invitrogen | -- |
| PVDF Immobilon-P转印膜 | Millipore | IPVH00010 | |
| ChemiDoc Touch成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| EGFR抗体 | CST | 4267 | |
| phospho-JNK (T183/Y185)抗体 | CST | 4668 | |
| JNK抗体 | CST | 9252 | |
| AIF抗体 | CST | 4642 | |
| PCNA抗体 | CST | 2586 | |
| TFEB抗体 | CST | 83010 | |
| LC3A/B抗体 | CST | 12741 | |
| Atg5抗体 | CST | 8540 | |
| Atg7抗体 | CST | 8558 | |
| Atg9a抗体 | CST | 13509 | |
| Atg3抗体 | CST | 3415 | |
| VDAC抗体 | CST | 4661 | |
| GAPDH抗体 | CST | 5174 | |
| β-actin抗体 | CST | 4970 | |
| CYP2E1抗体 | Sigma-Aldrich | HPA009128 | |
| GCLc抗体 | ABclonal Technologies | A25132 | |
| RNA提取 | TRIzol | Invitrogen | -- |
| 动物处理 | 亮抑酶肽 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型构建 | 小鼠品系(EGFRfl/fl,C57BL/6J背景);AAV8.TBG.Cre或AAV8.TBG.eGFP的剂量(2.5 × 10^11 病毒颗粒/只);注射途径(腹腔注射);注射后等待时间(1周) 阅读提示:Materials and Methods: Animals, treatments and tissue collections |
| APAP处理 | APAP剂量(500 mg/kg);给药途径(腹腔注射);禁食时间(16小时);给药后食物恢复时间(2小时) 阅读提示:Materials and Methods: Animals, treatments and tissue collections |
| 肝损伤评估 | 血清ALT和AST检测方法;H&E染色流程(切片厚度、染色时间);坏死面积量化方法 阅读提示:Materials and Methods: Serum ALT measurements, histological analysis, immunohistochemistry and TUNEL assay |
| JNK信号通路分析 | 免疫印迹抗体(phospho-JNK T183/Y185、JNK);线粒体分离试剂盒及方法;线粒体裂解条件(2% CHAPS);时间点(1, 3, 6, 12, 24小时) 阅读提示:Materials and Methods: Isolation of mitochondrial and nuclear fractions; Protein estimation and immunoblotting; Results |
| GSH测定 | GSH检测试剂盒(Sigma CS0260);组织裂解液制备;标准曲线和检测步骤 阅读提示:Materials and Methods: Estimation of hepatic glutathione (GSH) levels |
| 自噬评估 | 免疫印迹抗体(LC3A/B、Atg3/5/7/9a);透射电镜样品制备和观察参数;自噬体/线粒体自噬计数方法 阅读提示:Materials and Methods: Electron microscopy; Protein estimation and immunoblotting; Results (Fig. 6) |
| RNA-seq分析 | RNA提取方法(TRIzol);测序平台和质量控制;比对参考基因组(mm39);差异表达基因筛选标准(p<0.05) 阅读提示:Materials and Methods: RNA isolation, sequencing and analysis |
| 自噬抑制实验 | leupeptin剂量(40 mg/kg);给药途径(腹腔注射);给药时间(APAP后8小时和处死前5小时) 阅读提示:Materials and Methods: Animals, treatments and tissue collections (Additional experiments) |