BPA对高果糖饮食小鼠脂肪生成和氧化的影响
评估BPA是否减少DNL并增加脂肪酸氧化。
WT小鼠给予15%果糖/葡萄糖水4周,每日BPA 30mg/kg灌胃,通过D2O和13C-油酸示踪检测肝脏脂肪酸合成及氧化产物。
Bempedoic acid suppresses diet-induced hepatic steatosis independently of ATP-citrate lyase
包含动物模型、细胞实验、代谢示踪、RNA-seq等多层级验证,明确功能与机制验证。
C57BL/6小鼠 肝脏ACLY敲除(LAKO)小鼠 ACLY/ACSS2双敲除(DKO)小鼠 A549细胞系
Western diet (0.2%或1.25%胆固醇) 喂养时间 BPA剂量 (10或30 mg/kg) 及给药方式 AAV8-TBG-Cre/GFP介导的基因敲除效率 组织采集时间点 (ZT8-10) 及禁食状态
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估BPA是否减少DNL并增加脂肪酸氧化。
WT小鼠给予15%果糖/葡萄糖水4周,每日BPA 30mg/kg灌胃,通过D2O和13C-油酸示踪检测肝脏脂肪酸合成及氧化产物。
验证肝脏ACLY缺失是否加重饮食诱导的脂肪变性及其与ACSS2的关系。
使用LAKO和DKO小鼠喂养Western diet,评估肝脏组织学、脂质含量及VLDL分泌。
探究ACLY缺失是否影响PPARα信号和脂肪酸氧化。
通过RNA-seq和RT-qPCR检测PPARα靶基因表达,并测量脂肪酸氧化速率和酰基肉碱。
确定BPA是否独立于ACLY改善脂肪变性。
WT和LAKO小鼠喂养Western diet,BPA治疗,检测肝脏脂质含量和PPARα靶基因。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | Bempedoic acid | MedChem Express | HY-12357 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | GIBCO | 11965084 |
| 小牛血清 | Gemini | 100-510 | |
| 透析胎牛血清 | Gemini | 100-108 | |
| 胆固醇甲基-β-环糊精 | Sigma-Aldrich | C4951 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Sigma-Aldrich | P8340 | |
| PhosSTOP磷酸酶抑制剂 | Roche | 4906837001 | |
| ACLY抗体 | Proteintech | 15421-1-AP | |
| ACSS2抗体 | Cell Signaling Technology | 3658S | |
| S6抗体 | Cell Signaling Technology | 2217S | |
| 微管蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 2144S | |
| GFP抗体 | Cell Signaling Technology | 2956S | |
| acH3K27抗体 | Abcam | ab4729 | |
| acH3K23抗体 | Abcam | ab177275 | |
| acH4抗体 | Millipore | 06-866 | |
| pAMPK抗体 | Cell Signaling Technology | 2535 | |
| IRDye800CW山羊抗兔二抗 | LI-COR | 926-32211 | |
| 蛋白浓度测定 | BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher | 23225 |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Life Technologies | 15596026 |
| RT-qPCR | 高容量RNA-to-cDNA预混液 | Applied Biosystems | 4368814 |
| PowerUp SYBR Green预混液 | Applied Biosystems | A25778 | |
| ViiA-7实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| RNA-seq | Illumina NextSeq测序平台 | Illumina | -- |
| BPA制备 | 羧甲基纤维素 | Sigma-Aldrich | C5678 |
| 组织处理 | OCT包埋剂 | -- | -- |
| 组织裂解 | TissueLyser II组织研磨仪 | Qiagen | -- |
| BPA制备 | 吐温-20 | -- | -- |
| BPA给药 | 口服灌胃 | -- | -- |
| 组织分离 | Wollenberger钳 | -- | -- |
| 脂质提取 | 氯仿-甲醇(2:1) | -- | -- |
| TLC显色 | 硫酸铜 | Sigma | 451657 |
| 磷酸 | Sigma | P6560 | |
| TLC标准品 | TLC非极性脂质混合物A | Matreya | 1129 |
| 脂质组学 | EquiSPLASH标记标准品 | Avanti Polar Lipids | 330731 |
| Q Exactive轨道阱质谱仪 | Thermo Scientific | -- | |
| Vanquish Flex二元超高效液相色谱系统 | Thermo Scientific | -- | |
| Accucore C30色谱柱 | Thermo | -- | |
| 代谢物组学 | ZIC-pHILIC色谱柱 | -- | -- |
| 脂蛋白分析 | Superose 6 Increase 10/300 GL色谱柱 | Cytiva | -- |
| Infinity Liquid Stable胆固醇试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Infinity Liquid Stable甘油三酯试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| BioTek Synergy Neo2酶标仪 | BioTek | -- | |
| VLDL-TAG分泌 | 泊洛沙姆-407 | -- | -- |
| 甘油三酯比色试剂盒 | Cayman Chemical | 10010303 | |
| 脂肪酸氧化 | 3H-棕榈酸 | -- | -- |
| 荧光素酶报告 | PPAR结合实验 | Invitrogen | PV4892 |
| 葡萄糖耐量试验 | D-葡萄糖 | Sigma Aldrich | G8270 |
| 胰岛素耐量试验 | 胰岛素 | -- | -- |
| 质谱分析 | Oasis HLB 1cc固相萃取柱 | Waters | -- |
| Ultimate 3000自动进样器 | Thermo | -- | |
| Thermo Q-Exactive Plus质谱仪 | Thermo | -- | |
| Waters HSS T3色谱柱 | Waters | -- | |
| Tracefinder软件 | Thermo Scientific | -- | |
| 酰基肉碱分析 | Vanquish Duo超高效液相色谱系统 | Thermo | -- |
| Ascentis Express HILIC色谱柱 | Supelco | -- | |
| β-羟基丁酸分析 | 正缬氨酸 | -- | -- |
| MTBSTFA衍生化试剂 | Millipore Sigma | 394882 | |
| 甲氧胺 | Millipore Sigma | 226904 | |
| 吡啶 | Millipore Sigma | 270970 | |
| GC-MS分析 | DB-5MS色谱柱 | Agilent | -- |
| 棕榈酸-d31 | Cambridge Isotope Laboratories | -- | |
| 粪甾醇 | Sigma | 7578 | |
| Agilent 7890 A气相色谱仪 | Agilent | -- | |
| Agilent 5975气相色谱-质谱联用仪 | Agilent | -- | |
| Select FAME色谱柱 | -- | -- | |
| Agilent DB-35MS色谱柱 | Agilent J&W Scientific | -- | |
| Western blot | LI-COR Odyssey Clx成像系统 | LI-COR | -- |
| RNA-seq | Kallisto | -- | -- |
| R | -- | -- | |
| RStudio | -- | -- | |
| Bioconductor | -- | -- | |
| tximport | -- | -- | |
| edgeR | -- | -- | |
| limma | -- | -- | |
| g:Profiler | -- | -- | |
| 图像分析 | ImageJ | -- | -- |
| 代谢通量分析 | FluxFix | -- | -- |
| 代谢组学 | EL-MAVEN | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型构建 | 基因型、AAV8-TBG-Cre/GFP注射剂量和时间 阅读提示:STAR Methods 动物研究部分 |
| 饮食干预 | Western diet类型(0.2%或1.25%胆固醇)、喂养时长 阅读提示:STAR Methods 动物饮食研究部分 |
| 药物处理 | BPA剂量(10或30 mg/kg)、给药方式(灌胃)、给药时长、最后一次给药时间 阅读提示:STAR Methods BPA研究部分 |
| 代谢示踪 | D2O用量、13C-油酸剂量、标记时间 阅读提示:STAR Methods 体内同位素示踪部分 |
| 组织采集 | 组织采集的昼夜时间点(ZT8-10)、禁食状态 阅读提示:STAR Methods 动物研究部分及图例 |