建立卵巢激素缺乏模型
模拟绝经后雌激素缺乏状态,比较卵巢切除(OVX)与假手术(Sham)小鼠的差异
C57BL/6雌性小鼠(6-8周龄)进行双侧卵巢切除术或假手术,术后监测10天,记录体重变化以验证激素状态。
Ovarian hormone deficiency enhances wood smoke-induced immune dysfunction via transcriptomic and metabolic alterations
包含单细胞转录组发现(OVX小鼠)和 Sham/OVX 双队列功能验证(代谢、基因表达、蛋白),证据层级独立且含机制推断。
去卵巢(OVX)C57BL/6小鼠模型 骨髓来源巨噬细胞(BMDMs)
卵巢激素状态(OVX vs Sham) 木烟暴露浓度约0.575 mg/m³,每天4小时,连续2天 BMDM分化方案(M-CSF 50 ng/ml,7天) 代谢测定(Seahorse XF96,细胞密度80,000/孔)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟绝经后雌激素缺乏状态,比较卵巢切除(OVX)与假手术(Sham)小鼠的差异
C57BL/6雌性小鼠(6-8周龄)进行双侧卵巢切除术或假手术,术后监测10天,记录体重变化以验证激素状态。
评估急性木烟暴露对骨髓免疫细胞的影响
将OVX和Sham小鼠暴露于木烟(WS)或过滤空气(FA),每天4小时,连续2天,浓度约0.575±0.12 mg/m³。
在OVX背景下鉴定木烟暴露引起的骨髓免疫细胞转录组变化
收集暴露后骨髓细胞进行单细胞RNA测序,分析免疫细胞组成和差异表达基因,并验证关键通路。
验证卵巢激素状态和木烟暴露对BMDM代谢和极化标志物的影响
从Sham和OVX小鼠(暴露于FA或WS)分离骨髓细胞,分化BMDM,进行代谢通量分析(OCR、ECAR)、qRT-PCR(M1/M2相关基因)和Western blot(ARG1、PPARγ)。
评估手术(OVX/Sham)和暴露(FA/WS)的相互作用效应
使用双因素方差分析(代谢参数、蛋白)或线性混合模型(qRT-PCR数据)分析主要效应和交互作用。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 外科手术 | 异氟烷 | Sigma-Aldrich | 51144 |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco | 11875085 |
| 胎牛血清 | Gibco | 10438026 | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15140122 | |
| 小鼠M-CSF | PeproTech | 315-02 | |
| EDTA | Thermo Fisher Scientific | 15575-038 | |
| 流式细胞术 | CD11b抗体 | Cell Signaling | 85601 |
| F4/80抗体 | Cell Signaling | 40781 | |
| IgG2b同型对照 | Cell Signaling | 79201 | |
| IgG2b同型对照 | Cell Signaling | 52572 | |
| 代谢分析 | Seahorse XF细胞线粒体压力测试试剂盒 | Agilent | 103015-100 |
| Seahorse XF糖酵解压力测试试剂盒 | Agilent | 103020-100 | |
| qRT-PCR | RNeasy迷你试剂盒 | Qiagen | 74104 |
| High-Capacity cDNA反转录试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 4374966 | |
| iTaq通用SYBR Green超混液 | Bio-Rad | 1725121 | |
| QuantiTect引物检测 | Qiagen | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Mini-PROTEAN TGX预制胶(4-20%) | Bio-Rad | 4561094 | |
| PVDF膜 | Bio-Rad | IPVH00010 | |
| ARG1抗体 | Cell Signaling Technology | 93668 | |
| PPARγ抗体 | Cell Signaling Technology | 2443 | |
| Vinculin抗体 | Cell Signaling Technology | 13901 | |
| HRP标记二抗 | Cell Signaling Technology | 7074S | |
| SuperSignal West Femto最大灵敏度底物 | Thermo Fisher Scientific | 34095 | |
| 设备 | Chromium iX控制器 | 10X Genomics | PN-1000328 |
| Chromium Next GEM芯片G | 10X Genomics | PN-1000120 | |
| 测序 | Chromium Next GEM单细胞3'试剂盒v3.1 | 10X Genomics | PN-1000286 |
| Dual Index试剂盒TT Set A | 10X Genomics | PN-1000215 | |
| Agilent Bioanalyzer高灵敏度DNA试剂盒 | Agilent Technologies | 5067-4626 | |
| Qubit DNA HS检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | Q32851 | |
| Illumina NovaSeqX Plus测序仪 | Illumina | -- | |
| 设备 | Seahorse XF96分析仪 | Agilent | -- |
| CXF OPUS 96实时荧光定量PCR系统 | Bio-Rad | -- | |
| ChemiDoc成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| Image Lab软件 | Bio-Rad | -- | |
| 细胞分离 | 70 μm细胞筛网 | Corning | 352350 |
| 红细胞裂解 | ACK红细胞裂解液 | Quality Biological | 118-156-101 |
| 细胞计数 | Nexcelom Cellometer Auto2000细胞计数仪 | Nexcelom Bioscience | -- |
| 流式分析 | CytoFLEX S流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系、年龄、OVX和Sham手术操作、术后恢复时间、体重变化验证 阅读提示:Materials and methods - Animals and surgical procedures |
| 木烟暴露 | 木烟浓度(约0.575 mg/m³)、暴露时长(每天4h,连续2d)、生物质类型(pinyon)、FA对照 阅读提示:Materials and methods - WS exposure and characterization |
| 单细胞RNA测序 | OVX小鼠、每组n=3、细胞加载数(16,000)、测序深度(30,000 reads/细胞)、差异表达阈值 阅读提示:Materials and methods - Library preparation and single-cell RNA sequencing; Results - Fig. 2, Fig. 4, Fig. 5 |
| BMDM分化 | M-CSF浓度(50 ng/ml)、分化时间(7天)、培养皿类型、细胞密度(5×10^6/皿) 阅读提示:Materials and methods - BMDM differentiation |
| 代谢通量分析 | 细胞密度(80,000/孔)、Seahorse试剂盒、药物浓度(oligomycin 1μM、FCCP 1μM、Rotenone/Antimycin A 0.5μM、glucose 10mM、2-DG 50mM)、蛋白归一化方法 阅读提示:Materials and methods - Metabolic flux analysis; Results - Fig. 6 |
| qRT-PCR | RNA量(2000ng)、内参基因(18S rRNA)、ΔΔCt方法、技术重复(3次) 阅读提示:Materials and methods - Quantitative real-time PCR; Results - Fig. 7 |
| Western blot | 蛋白上样量(30μg)、抗体稀释比(ARG1 1:1000、PPARγ 1:1000、Vinculin 1:1000、二抗 1:2000) 阅读提示:Materials and methods - Western blot analysis; Results - Fig. 8 |