单细胞转录组图谱构建
描绘健康与银屑病皮肤ECs的异质性,识别关键亚群。
从银屑病患者皮损和健康对照中分离ECs,进行scRNA-Seq,并与已发表健康数据整合,聚类分析。
An IGFBP7hi endothelial cell subset drives T cell extravasation in psoriasis via endothelial glycocalyx degradation
包括单细胞转录组分析、体外细胞实验、体内小鼠模型及患者样本验证,并进行功能与机制验证。
HMEC-1细胞 IMQ诱导的银屑病样小鼠模型 银屑病患者皮肤样本 健康人皮肤样本
内皮糖萼降解:使用透明质酸酶(400 μg/小鼠)和乙酰肝素酶III(100 mU/小鼠)静脉注射,隔日一次,共5次 IMQ诱导:每日局部涂抹5% IMQ乳膏于背部皮肤和耳皮肤,连续5至8天 IGFBP7处理:重组小鼠IGFBP7(10 μg/小鼠)静脉注射,隔日一次,共5次 抗IGFBP7治疗:中和抗体(100 μg/小鼠)腹腔注射,隔日一次,共3次 T细胞粘附检测:HMEC-1细胞处理100 μg/mL透明质酸酶和50 mU/mL乙酰肝素酶III或400 μg/mL rhIGFBP7 3小时,然后进行静态共培养或流动实验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
描绘健康与银屑病皮肤ECs的异质性,识别关键亚群。
从银屑病患者皮损和健康对照中分离ECs,进行scRNA-Seq,并与已发表健康数据整合,聚类分析。
验证银屑病中内皮糖萼是否受损。
通过TEM和SEM观察糖萼超微结构,免疫荧光检测HA和HS的MFI,ELISA检测血清HA和HS水平。
研究糖萼降解对银屑病样皮炎的影响。
通过静脉注射透明质酸酶和乙酰肝素酶III降解糖萼,结合IMQ诱导银屑病模型,评估皮肤炎症、血管和T细胞浸润。
鉴定介导糖萼降解的关键EC亚群。
通过拟时间分析识别IGFBP7hi EC亚群,并进行GO、SCENIC分析,免疫荧光验证其在皮损中的分布。
验证IGFBP7在体内对糖萼和炎症的影响。
给小鼠注射重组小鼠IGFBP7(rmIGFBP7),结合IMQ模型,评估糖萼降解、血管形态、T细胞浸润和炎症。
探索IGFBP7对糖萼和T细胞粘附的直接作用。
用rhIGFBP7处理人真皮微血管内皮细胞系HMEC-1,检测HA/HS变化,并进行静态共培养和流动实验。
确定IGFBP7的上游调控因子。
通过GSEA筛选通路,并用IFN-γ等细胞因子处理HMEC-1,检测IGFBP7表达和分泌,以及下游T细胞粘附。
评估抗IGFBP7作为治疗策略的潜力。
在IMQ小鼠中给予中和性抗IGFBP7抗体,评估皮损严重程度、糖萼恢复和T细胞浸润。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 小鼠模型处理 | 咪喹莫特乳膏 | INova Pharmaceuticals | -- |
| 糖萼降解 | 透明质酸酶 | MilliporeSigma | H3506 |
| 乙酰肝素酶III | MilliporeSigma | H8891 | |
| 药物处理 | 重组小鼠IGFBP7 | Sino Biological | 51125-M02H |
| 重组人IGFBP7 | Sino Biological | 13100-H08H | |
| 抗体治疗 | IGFBP7中和抗体 | ABclonal | A4615 |
| T细胞分离 | 抗CD4抗体包被的磁性微珠 | Miltenyi Biotech | 130-045-101 |
| 荧光标记 | 钙黄绿素-AM | Invitrogen | C1429 |
| 血管标记 | TRITC-葡聚糖 | MilliporeSigma | 52194 |
| 免疫荧光 | 抗小鼠CD3抗体 | Abcam | ab135372 |
| JAK抑制剂处理 | 巴瑞替尼 | -- | -- |
| 乌帕替尼 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| scRNA-Seq | 细胞分离方法、测序平台、数据分析参数、样本数量来源 阅读提示:Methods - Human samples 和 scRNA-Seq and data analysis;补充方法 |
| 糖萼降解小鼠模型 | 透明质酸酶剂量(400 μg/小鼠)、乙酰肝素酶III剂量(100 mU/小鼠)、注射方案(隔日一次,共5次)、小鼠品系、年龄、性别 阅读提示:Methods - Mouse model of psoriasis and treatments |
| IMQ诱导银屑病模型 | IMQ浓度(5%)、应用部位(背部及耳部)、频率(每日)、持续时间(5-8天) 阅读提示:Methods - Mouse model of psoriasis and treatments |
| IGFBP7处理 | 重组小鼠IGFBP7剂量(10 μg/小鼠)、注射途径、频率、时间;重组人IGFBP7浓度(400 μg/mL) 阅读提示:Methods - Mouse model of psoriasis and treatments 和 Flow assay |
| 抗IGFBP7治疗 | 抗体剂量(100 μg/小鼠)、给药途径(i.p.)、频率(隔日一次,共3次)、治疗起始时间(预防性 vs 治疗性) 阅读提示:Methods - Mouse model of psoriasis and treatments |
| 体外T细胞粘附实验 | HMEC-1细胞系来源和处理条件(100 μg/mL透明质酸酶和50 mU/mL乙酰肝素酶III或400 μg/mL rhIGFBP7,3小时);CD4+ T细胞分离方法;共培养时间(5小时);流动实验流速(1 mL/min) 阅读提示:Methods - Flow assay 和 相关图注 |