验证TET2在AST中的作用
确定TET2是否参与调控肺腺鳞转化。
通过CRISPR/Cas9在KL模型中敲除Tet1/2/3,并使用条件性Tet2敲除小鼠(KLT)观察鳞状转化表型。
TET2-STAT3-CXCL5 nexus promotes neutrophil lipid transfer to fuel lung adeno-to-squamous transition
包含基因敲除小鼠模型、细胞系实验、类器官、体内药物处理等多层级验证,并进行了机制和功能验证。
KL小鼠模型 (KrasLSL-G12D/+; Lkb1L/L) KLT小鼠模型 (KrasLSL-G12D/+; Lkb1L/L; Tet2L/L) KL原代细胞系 (KL-#1, KL-#2) KL鳞状类器官
Tet2基因敲除在KL模型中对鳞状转化的抑制作用 STAT3-CXCL5轴在中性粒细胞浸润中的作用 中性粒细胞向肿瘤细胞脂质转移的机制及EIPA的阻断效果 Ruxo和C188-9对STAT3信号通路的抑制效果
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定TET2是否参与调控肺腺鳞转化。
通过CRISPR/Cas9在KL模型中敲除Tet1/2/3,并使用条件性Tet2敲除小鼠(KLT)观察鳞状转化表型。
探究TET2是否通过调节免疫微环境促进鳞状转化。
通过流式细胞术和免疫荧光检测KL和KLT小鼠肿瘤中中性粒细胞等免疫细胞浸润情况。
阐明TET2调控CXCL5表达和中性粒细胞浸润的分子机制。
通过ELISA、RT-qPCR、hMeDIP-qPCR和ChIP-qPCR检测CXCL5表达及TET2在Cxcl5启动子区域的结合。
评估靶向STAT3-CXCL5轴对鳞状转化的抑制作用。
使用CXCL5中和抗体、Ruxo、C188-9处理KL小鼠,观察鳞状转化及中性粒细胞浸润情况。
探究中性粒细胞是否通过脂质转移促进鳞状转化。
通过BODIPY染色、SRS显微镜和FACS分析脂质含量,并共培养中性粒细胞与KL细胞,观察脂质转移及细胞增殖。
评估EIPA对鳞状转化的抑制作用。
对KL小鼠给予EIPA治疗,观察鳞状转化及脂质转移情况。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI培养基 | Gibco | -- |
| DMEM培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 药物处理 | 鲁索利替尼 | MedChemExpress | HY-50856 |
| C188-9 | MedChemExpress | HY-112288 | |
| EIPA | MedChemExpress | HY-101840 | |
| 蛋白检测 | CXCL5中和抗体 | R&D | mab433 |
| 免疫组化/免疫荧光 | TTF1抗体 | Abcam | ab133638 |
| p63抗体 | Abcam | ab124762 | |
| SOX2抗体 | Abcam | ab92494 | |
| KRT5抗体 | Bioworld | BS1208 | |
| 5mC抗体 | Eurogentec | BI-MECY-0100 | |
| 5hmC抗体 | Active Motif | 39792 | |
| Ki-67抗体 | Novus | NB500 | |
| pSTAT3抗体 | CST | 9145 | |
| MPO抗体 | R&D system | AF3667 | |
| 脂质检测 | BODIPY荧光染料 | GLPBIO | GC42959 |
| 免疫组化/免疫荧光 | EpCAM抗体 | CST | 2929 |
| DAPI | CST | 4083 | |
| Western blot | TET2抗体 | CST | 18950S |
| STAT3抗体 | CST | 9132 | |
| β-actin抗体 | ABclonal | AC026 | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | -- | -- |
| 第一链合成试剂盒 | Invitrogen | -- | |
| SYBR-Green荧光定量PCR预混液 | Roche | -- | |
| hMeDIP-qPCR | 5hmC抗体 | Active Motif | 39769 |
| ChIP-qPCR | TET2抗体 | Shanghai Youke | -- |
| 类器官培养 | I型胶原酶 | Worthington-Biochem | LS004196 |
| 免疫沉淀 | G蛋白琼脂糖珠 | GE | 17061801 |
| 脂质分析 | 甘油三酯 | Aladdin | G107438 |
| 胆固醇 | Innochem | A90286 | |
| 磷脂酰胆碱 | Topscience | T19514 | |
| 磷脂酰丝氨酸 | Topscience | T21437 | |
| 鞘磷脂 | Macklin | S877036 | |
| 动物实验 | 腺病毒Cre重组酶 | -- | -- |
| SRS显微镜 | 受激拉曼散射显微镜 | Olympus | FV1200 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| Tet2敲除对鳞状转化的影响 | Tet2基因敲除方式(CRISPR/Cas9或条件性敲除)及敲除效率验证;鳞状转化评估指标(AST发生率、SCC数量及负荷) 阅读提示:见Methods 'Mouse study' 和 'CRISPR-Cas9 plasmids construction and lentivirus production',以及Fig. 1和S1图注 |
| STAT3-CXCL5轴 | Ruxo、C188-9的药物剂量、给药方式及时间;CXCL5表达水平检测方法 阅读提示:见Methods 'Mouse study',Fig. 4图注和讨论部分 |
| 脂质转移 | 中性粒细胞分离方法、共培养条件(比例、时间);脂质检测方法(BODIPY染色、SRS显微镜);EIPA浓度及处理时间 阅读提示:见Methods 'Co-culture KL cells with neutrophils' 和 'SRS microscope analysis',Fig. 5图注 |