验证HER2信号对MYC翻译后调控
探究HER2激活是否调控MYC蛋白稳定性及Ser62磷酸化
构建MCF10A-Neu8142稳定细胞系,检测MYC蛋白水平、mRNA、半衰期、Ser62磷酸化,并分析HER2+患者肿瘤中p-S62-MYC表达。
Deregulating MYC in a model of HER2+ breast cancer mimics human intertumoral heterogeneity
包含体外细胞模型、人源组织样本、基因工程小鼠模型、转录组分析及体内药物干预等多个独立证据层级,并进行功能与机制验证。
MCF10A-Neu8142细胞系 Rosa-LSL-Myc;LSL-NeuNT;Blg-Cre小鼠模型 HER2+患者肿瘤组织样本及组织芯片
MCF10A细胞中Neu8142表达对MYC蛋白稳定性及Ser62磷酸化的影响 MYC;NeuNT小鼠模型中MYC与NeuNT共表达对肿瘤发生、转移及生存期的影响 MYC;NeuNT肿瘤中不同分子亚型(G1、G2、G3)的组织学与分子特征 MYC;NeuNT肿瘤亚型对lapatinib和DT1154治疗的差异性反应
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究HER2激活是否调控MYC蛋白稳定性及Ser62磷酸化
构建MCF10A-Neu8142稳定细胞系,检测MYC蛋白水平、mRNA、半衰期、Ser62磷酸化,并分析HER2+患者肿瘤中p-S62-MYC表达。
评估失调MYC与NeuNT共表达对体内肿瘤发生的影响
将Rosa-LSL-Myc小鼠与LSL-NeuNT和Blg-Cre小鼠杂交获得MYC;NeuNT小鼠,监测肿瘤发生、转移和生存期,并检测MYC mRNA和p-S62-MYC水平。
分析MYC;NeuNT肿瘤的分子特征和异质性
对MYC;NeuNT和NeuNT肿瘤进行RNA-Seq,进行无监督层次聚类和GSEA分析,并关联组织学特征。
研究G3肿瘤亚型的组织学、分子和功能特征
通过组织学、IHC、免疫荧光和基因表达分析比较G3与G1/G2肿瘤的EMT标志物、基底标志物、EGFR信号及生存期。
评估MYC;NeuNT肿瘤亚型是否对应人类HER2+ER-肿瘤亚型
使用METABRIC研究中的133例HER2+ER-患者肿瘤数据进行ComBat归一化和聚类分析,比较GSEA富集结果。
探究不同肿瘤亚型对靶向治疗的反应差异
用lapatinib或DT1154治疗荷瘤MYC;NeuNT小鼠,监测肿瘤体积变化、p-S62-MYC和Ki-67表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | MCF10A | -- | -- |
| 腺病毒MYC | -- | -- | |
| Western blot | HER2抗体 | Cell Signaling Technology | 2242 |
| 免疫组织化学 | 细胞角蛋白14抗体 | Covance | PRB-155P |
| 细胞角蛋白5抗体 | Abcam | ab52635 | |
| Western blot | ERK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 4695 |
| p-ERK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 4370 | |
| 免疫组织化学 | ERα抗体 | Millipore | 04-227 |
| Ki-67抗体 | -- | NCL-Ki67P | |
| p-EGFR抗体 | Cell Signaling Technology | 3777 | |
| p-AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| Western blot | MYC N262抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-764 |
| MYC Y69抗体 | Abcam | ab32072 | |
| V5抗体 | Invitrogen | R-960-25 | |
| p-S62-MYC抗体 | BioAcademia | E71-161 | |
| 免疫荧光 | ZEB1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-515797 |
| Twist1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-15393 | |
| 免疫组织化学 | EMP3抗体 | antibodies-online.com | ABIN758600 |
| 免疫荧光 | 细胞角蛋白19抗体 | Biolegend | 628502 |
| HER2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-33684 | |
| Ki-67抗体 | Cell Signaling Technology | 9027 | |
| Western blot | Odyssey红外成像系统 | LI-COR | -- |
| 定量PCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| RNeasy小型试剂盒 | Qiagen | -- | |
| High-Capacity cDNA逆转录试剂盒 | Applied Biosystems | -- | |
| DNeasy小型试剂盒 | Qiagen | -- | |
| 组织芯片免疫荧光 | pH 6柠檬酸盐缓冲液 | -- | -- |
| pH 9 Tris/EDTA缓冲液 | -- | -- | |
| 压力锅 | Biocare Medical | -- | |
| 正常山羊血清 | Vector Laboratories | -- | |
| Slowfade Gold DAPI | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 蔡司Axioscan Z1 | Zeiss | -- | |
| 过氧化氢 | -- | -- | |
| RNA测序 | NEBNext Ultra Directional RNA文库制备试剂盒(Illumina) | New England BioLabs | -- |
| Illumina HiSeq | Illumina | -- | |
| 药物处理 | 拉帕替尼 | -- | -- |
| DT1154 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养及MYC稳定性检测 | MCF10A-Neu8142细胞中MYC蛋白半衰期(22分钟 vs 71分钟)及Ser62磷酸化水平 阅读提示:Methods: Cell lines and patient samples, Western blots and MYC half-life; Figure 1 |
| MYC;NeuNT小鼠模型建立 | 小鼠遗传背景(BL6/129S1/FVB混合),妊娠/哺乳周期数(2次),Cre激活时间(10-12周龄) 阅读提示:Methods: Animal studies; Figure 3 |
| 肿瘤亚型分子分析 | RNA-Seq样本数量(14 MYC;NeuNT,4 NeuNT),聚类方法(WARD),GSEA基因集 阅读提示:Methods: RNA-Seq and gene expression analyses, GSEA; Figure 4 |
| 药物治疗实验 | lapatinib给药剂量(100 mg/kg每日),DT1154给药剂量(100 mg/kg每日两次),治疗周期(30天),肿瘤起始体积(100 mm3) 阅读提示:Methods: Animal studies; Figure 9 |