桥粒COP9调控致心律失常性右心室发育不良/心肌病中的蛋白质组降解

Desmosomal COP9 regulates proteome degradation in arrhythmogenic right ventricular dysplasia/cardiomyopathy

作者信息Yan Liang, Robert C Lyon, Jason Pellman, William H Bradford, Stephan Lange, Julius Bogomolovas, Nancy D Dalton, Yusu Gu, Marcus Bobar, Mong-Hong Lee, Tomoo Iwakuma, Vishal Nigam, Angeliki Asimaki, Melvin Scheinman, Kirk L Peterson, Farah Sheikh
PMID33857019
发布时间2021-06
DOI10.1172/JCI137689

实验完整度

包含酵母双杂交、分子对接、细胞共免疫沉淀、蛋白印迹、免疫荧光、透射电镜、心脏功能与电生理检测、小鼠模型及人类心肌样本等多层级验证。

主要模型

小鼠心脏(Csn6-cKO、Csn6-iKO、Dsp-cKO、Double Het、Dsp Hom小鼠) 新生小鼠心室肌细胞 人类ARVD/C心肌活检/尸检组织

重点核对

Csn6敲除小鼠的构建方式(α-MHC-Cre或α-MHC-MerCreMer)及他莫昔芬注射方案(50 mg/kg/d,连续5天) CHX追踪实验中CHX浓度(10 μg/mL)和处理时间(0-32小时) MLN4924处理浓度(1 μM)和处理时间(6小时) Csn6-cKO和Csn6-iKO小鼠的生存分析(n=13和n=16)及心功能测量(MRI、超声) 人类样本的突变类型(DSP R315C, PKP2 IVS10-1 G>C等)及免疫荧光检测CSN6定位

摘要

蛋白质降解途径失调日益被认为是人类疾病的介质。这一机制可能特别与桥粒蛋白相关,这些蛋白在组织结构和细胞间通讯中发挥关键结构作用,因为桥粒蛋白质组的去稳/破坏是遗传性桥粒靶向疾病的标志,例如心脏病致心律失常性右心室发育不良/心肌病(ARVD/C)。然而,目前尚不清楚是否存在调节桥粒蛋白质组稳态的驻留蛋白。在这里,我们揭示了一个心脏组成型光形态建成9(COP9)桥粒驻留蛋白复合物,由COP9信号体亚基6(CSN6)组成,该复合物酶促限制类泛素化并靶向桥粒蛋白质组降解。在经典小鼠和人类ARVD/C模型中,CSN6的结合、定位、水平和功能均受到影响,这些模型分别受桥粒缺失和突变影响。由于连接部CSN6的减少/缺失以及人类桥粒突变导致连接部CSN6不稳定,桥粒蛋白质组降解控制的丧失也足以在小鼠中触发ARVD/C。我们鉴定了一个桥粒驻留调节复合物,该复合物限制了桥粒蛋白质组降解和疾病。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
桥粒蛋白质组稳态是否受驻留蛋白调节,以及该调节机制在ARVD/C发病中的作用。
核心机制
CSN6作为桥粒驻留蛋白,通过限制cullin-RING E3泛素连接酶的类泛素化(neddylation),进而抑制桥粒蛋白的泛素化降解,维持桥粒蛋白质组稳态。
主要证据
酵母双杂交和共免疫沉淀证实CSN6与DSP、PKP2相互作用;Csn6敲除小鼠选择性降解桥粒蛋白,超微结构显示自噬体聚集;MLN4924抑制类泛素化可挽救桥粒蛋白丢失;人类ARVD/C心肌中CSN6定位减少,DSP R315C突变破坏其与CSN6的结合;小鼠模型(Csn6-KO、Double Het、Dsp Hom)重现ARVD/C表型。
研究意义
本研究将ARVD/C归类为桥粒蛋白质降解疾病,并提示去类泛素化(deneddylation)可作为新的治疗干预靶点。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

鉴定CSN6为桥粒相互作用蛋白

发现调节桥粒蛋白质组稳态的驻留蛋白。

以人DSP N端(1-519 aa)为诱饵进行酵母双杂交筛选成人心脏cDNA文库,鉴定出CSN6;通过强制酵母双杂交、分子对接、共免疫沉淀、免疫荧光和蛋白印迹验证其与桥粒蛋白的相互作用和共定位。

2

验证CSN6缺失对桥粒蛋白质组的影响

确定CSN6在心脏中是否调控桥粒蛋白的稳定性。

生成心脏特异性Csn6敲除小鼠(Csn6-cKO和Csn6-iKO),通过蛋白印迹和免疫荧光检测桥粒蛋白水平及定位,观察超微结构变化。

3

机制研究:CSN6限制类泛素化介导的降解

探究CSN6如何调控桥粒蛋白降解。

在Csn6-iKO心脏中检测cullin类泛素化、NEDD8、泛素和p62水平;在新生心室肌细胞中进行CHX追踪实验和MLN4924处理,评估CSN6缺失对桥粒蛋白半衰期的影响及类泛素化抑制的挽救效果。

4

疾病相关性研究

评估CSN6通路在ARVD/C小鼠及人类样本中的改变。

在Dsp-cKO小鼠和人类ARVD/C心肌组织中检测CSN6定位和类泛素化水平;利用人类突变(DSP R315C)进行酵母双杂交和分子对接分析其与CSN6结合的影响。

5

体内功能验证

验证CSN6缺失或人类突变是否足以触发ARVD/C表型。

对Csn6敲除小鼠进行生存分析、心脏结构(MRI、超声、组织学)和电生理(ECG)评估;构建携带人类突变的Double Het和Dsp Hom小鼠,表征其分子、结构和电生理表型。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
抗CSN6抗体EnzolifeBML-PW8295
对照兔IgGMilliporeSigmaI5006
抗DSP抗体Bio-Rad2722-5204
抗PKP2抗体Fitzgerald10R-P130b
抗DSG2抗体Fitzgerald10R-D106a
抗DSC2抗体Fitzgerald20R-DR004
抗PKG抗体MilliporeSigmaSAB2500802
抗β-连环蛋白抗体Cell Signaling Technology8480
抗N-钙粘蛋白抗体Abcamab76057
抗连接蛋白43抗体Invitrogen71-0700
抗talin2抗体Bio-RadMCA4771
抗纽蛋白抗体MilliporeSigmaV9131
抗NEDD8抗体Cell Signaling Technology2745
抗泛素抗体Cell Signaling Technology3933
抗p62抗体Progen Biotechnik GMBH71001
抗GAPDH抗体Santa Cruz Biotechnology Inc.sc32233
抗cullin1抗体MilliporeSigmaC7117
抗cullin2抗体Thermo Fisher51-1800
抗cullin3抗体Santa Cruz Biotechnology Inc.sc-166053
抗cullin4A抗体MilliporeSigmaSAB1411512
抗cullin4B抗体AbgentAP20232c
抗β-肌动蛋白抗体Santa Cruz Biotechnology Inc.sc47778
抗GST抗体Thermo FisherMA4-004
抗α-微管蛋白抗体MilliporeSigmaT9028
抗CSN6抗体Santa Cruz Biotechnology Inc.sc-47965
抗CSN5抗体Cell Signaling Technology6895S
抗脂滴包被蛋白抗体Cell Signaling Technology3470S
二抗Jackson ImmunoResearch Inc.--
蛋白G琼脂糖珠GE Healthcare--
TRIzol试剂Invitrogen--
PrimeScript RT试剂盒(含gDNA Eraser)Takara--
Power SYBR Green PCR预混液Applied Biosystems--
DMEM培养基----
M199培养基----
胎牛血清----
马血清----
青霉素/链霉素/谷氨酰胺----
层粘连蛋白----
MLN4924----
他莫昔芬----
GST-CSN6融合蛋白----
谷胱甘肽琼脂糖4BGE Life Sciences--
马森三色染色Sigma-Aldrich--
油红O染色Sigma-Aldrich--
OCT包埋剂Sakura--
奥林巴斯FV1000共聚焦显微镜Olympus--
徕卡SP8共聚焦显微镜Leica--
FEI Tecnai Spirit G2 BioTWIN透射电子显微镜FEI--
滨松Nanozoomer 2.0 HT玻片扫描仪Hamamatsu--
7T水平磁共振扫描仪Bruker--
正交体线圈Bruker--
表面阵列线圈RAPID MRI--
Vevo 2100超声系统VisualSonics--
心电图发射器DSI--
GraphPad Prism----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
动物模型
基因型、他莫昔芬注射剂量和方案(50 mg/kg/d,连续5天)、动物的周龄和性别
阅读提示:Methods - Experimental animals
原代心肌细胞实验
腺病毒感染MOI(lacZ和Cre均为100)、CHX浓度(10 μg/mL)和处理时间点、MLN4924浓度(1 μM)和处理时间
阅读提示:Methods - Neonatal mouse ventricular cardiomyocyte isolation and treatments
蛋白检测
抗体来源和货号(如CSN6、DSP、PKP2等)、蛋白提取方法(总蛋白或不可溶组分)、上样量和转移条件
阅读提示:Methods - Protein analysis
电生理和分析
ECG记录条件(麻醉、电极位置)、异丙肾上腺素剂量(2.5 mg/kg)、遥测记录时长(48小时)
阅读提示:Methods - Surface and telemetry ECG