体外细胞功能验证
验证DMBT1在HNSCC细胞中的表达及其对细胞侵袭能力的影响
在HNSCC细胞系(UM-SCC-29和UM-SCC-1)中稳定过表达DMBT1或通过shEZH2上调内源DMBT1,敲低DMBT1,进行Matrigel侵袭实验和迁移实验。
Squamous cell carcinoma subverts adjacent histologically normal epithelium to promote lateral invasion
包含体外细胞系、鸡胚CAM和裸鼠异种移植模型,以及Dmbt1敲除小鼠和患者样本分析,并进行了功能获得/缺失、机制验证。
人HNSCC细胞系(UM-SCC-1、UM-SCC-29、UM-SCC-47等) 永生化口腔角质形成细胞系HOK16B和原代角质形成细胞HOK5973 鸡胚绒毛尿囊膜模型 裸鼠皮下异种移植模型 Dmbt1−/−基因敲除小鼠模型 人HNSCC组织样本和临床队列
DMBT1在HNSCC中的表达水平(细胞系、患者组织) TNFα和TGFβ1的浓度(10 ng/ml和1 ng/ml)及处理时间 CM制备的条件(饥饿处理时间、离心) siRNA转染效率验证(免疫印迹) 裸鼠异种移植实验中使用的细胞数量和注射方式
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证DMBT1在HNSCC细胞中的表达及其对细胞侵袭能力的影响
在HNSCC细胞系(UM-SCC-29和UM-SCC-1)中稳定过表达DMBT1或通过shEZH2上调内源DMBT1,敲低DMBT1,进行Matrigel侵袭实验和迁移实验。
验证DMBT1对体内肿瘤生长、侵袭和转移的影响
将HNSCC细胞接种于鸡胚CAM及裸鼠皮下,观察肿瘤生长、侵袭和转移,通过H&E染色和Alu-PCR等方法评价。
明确DMBT1调控E-cadherin和MMP9的机制
通过免疫印迹检测E-cadherin、MMP9、ZEB1表达,通过mRNA稳定性实验、荧光素酶报告基因实验、ChIP实验验证DMBT1对关键基因转录和转录后调控的影响。
验证HNSCC细胞分泌的TNFα和TGFβ1对邻近正常角质形成细胞中DMBT1的抑制作用
用HNSCC条件培养基处理角质形成细胞,检测DMBT1表达变化;利用中和抗体或siRNA敲低TNFα/TGFβ1,并加回重组细胞因子,验证对DMBT1的抑制作用。
评估侧向侵袭和DMBT1表达与患者预后的关联
分析Oncomine数据库和GEO数据,使用Kaplan-Meier生存分析;检测患者组织中DMBT1表达,并评估肿瘤侵袭模式与复发及生存的关系。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | EpiLife培养基 | Invitrogen | MEPICF500 |
| DMBT1过表达 | pCMV6-DMBT1质粒 | OriGene | RC215454 |
| siRNA转染 | siDMBT1 siRNA | Dharmacon | J-007883-07-0020 |
| siE-cadherin siRNA | Dharmacon | J-003877-08-0020 | |
| siTNFα siRNA | Origene | SR30002 | |
| siTGFβ1 siRNA | Dharmacon | LQ-012562-07 | |
| shRNA转染 | shEZH2慢病毒颗粒 | Dharmacon | V2LHS_17507 |
| Western blot | 抗DMBT1抗体 | Sigma-Aldrich | SAB2700429 |
| 抗EZH2抗体 | Cell Signaling Technology | 5246 | |
| 抗MMP2抗体 | Cell Signaling Technology | 4022 | |
| 抗MMP9抗体 | Cell Signaling Technology | 3852 | |
| 抗TNFα抗体 | Cell Signaling Technology | 3707 | |
| 抗TGFβ1抗体 | Cell Signaling Technology | 3907 | |
| 抗E-cadherin抗体 | BD Biosciences | 610182 | |
| 抗肌动蛋白抗体 | BD Biosciences | 612656 | |
| 抗ZEB1抗体 | Proteintech | 21544-1-AP | |
| 抗GAPDH抗体 | Millipore | MAB374 | |
| 免疫印迹检测 | SuperSignal West Pico化学发光底物 | -- | -- |
| Q-RT-PCR | Power SYBR Green预混液 | Applied Biosystems | -- |
| StepOne Plus实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| RNA提取 | miRNAeasy试剂盒 | QIAGEN | -- |
| RNeasy FFPE试剂盒 | QIAGEN | -- | |
| 逆转录 | SuperScript III逆转录酶 | Invitrogen | -- |
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 胰蛋白酶-EDTA | -- | -- | |
| 转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 侵袭实验 | Matrigel基质胶 | Corning, BD Biosciences | 354230 |
| Transwell小室 | Corning | 3422 | |
| 明胶酶谱法 | 明胶 | -- | -- |
| ChIP | EZ-Magna ChIP A/G试剂盒 | Millipore | 17-10086 |
| 荧光素酶报告基因 | 双荧光素酶报告基因系统 | Promega | -- |
| LightSwitch报告载体 | Active Motif | S718295 | |
| RenSP荧光素酶检测系统 | Active Motif | 32032 | |
| 组织学 | DAPI | Invitrogen | -- |
| LCM | PEN膜载玻片 | Leica | 11505158 |
| LCM V 4.0.3.7系统 | Leica | -- | |
| 细胞因子处理 | 重组人TNFα | -- | -- |
| 重组人TGFβ1 | -- | -- | |
| 中和抗体 | 抗TNFα中和抗体 | -- | -- |
| 抗TGFβ1中和抗体 | -- | -- | |
| 免疫印迹 | HRP标记二抗 | Jackson ImmunoResearch | -- |
| 蛋白质浓度测定 | BCA蛋白定量试剂盒 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养和条件培养基制备 | 细胞系来源和培养条件;HNSCC细胞培养基收集时间;无血清培养基使用;离心参数 阅读提示:Materials and methods: Cell culture, Depletion of TNFα and TGFβ1 |
| DMBT1表达调控 | siRNA序列和转染效率;shEZH2构建方法;DMBT1过表达质粒和对照 阅读提示:Materials and methods: Cell transfection and transduction |
| 体外侵袭实验 | Matrigel浓度和包被方法;细胞数量;侵袭时间;分析方法 阅读提示:Materials and methods: Invasion assay |
| 动物实验 | 小鼠品系和数量;注射细胞数;肿瘤测量时间点;组织处理和分析方法 阅读提示:Materials and methods: In vivo mouse xenograft model, Dmbt1−/− knockout mouse model |
| 临床样本分析 | 患者样本来源和数量;侧向侵袭判定标准;DMBT1免疫组化评分方法;生存分析模型 阅读提示:Materials and methods: Human tissue samples, Histology and immunohistochemistry |