鉴定IL1R2作为tiTreg标志物
确定IL1R2在不同肿瘤模型中的表达模式及其在免疫细胞中的特异性。
使用流式细胞术检测多种小鼠肿瘤模型中IL1R2+ tiTreg的比例,并比较不同器官中Treg的IL1R2表达。
Depleting IL1R2+ Tumor-Infiltrating Regulatory T Cells with an ADCC-Prone Nanobody Construct Boosts the Efficacy of Anti-PD-1 Immunotherapy
包括CITE-seq/scRNA-seq分析、流式细胞术、体外抑制实验、体内基因敲除模型、纳米抗体构建体生成及治疗实验等多个独立验证层级。
E0771小鼠乳腺癌模型 MC38小鼠结直肠癌模型 LLC-OVA小鼠肺癌模型 人类TNBC和结直肠癌肿瘤样本
IL1R2+ tiTreg百分比在不同肿瘤模型中的比例 IL1R2表达的特异性(肿瘤内Treg与外周Treg) IL1R2敲除对肿瘤生长和免疫细胞的影响 抗IL1R2 Nb-Fc构建体的ADCC功能 联合抗PD-1治疗的剂量和方案
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定IL1R2在不同肿瘤模型中的表达模式及其在免疫细胞中的特异性。
使用流式细胞术检测多种小鼠肿瘤模型中IL1R2+ tiTreg的比例,并比较不同器官中Treg的IL1R2表达。
揭示tiTreg亚群的异质性及IL1R2表达的相关基因特征。
对E0771和MC38肿瘤的CD45+细胞进行CITE-seq或scRNA-seq,并对Treg进行亚聚类分析,鉴定IL1R2高表达的亚群。
验证TCR信号和c-Rel是否调控IL1R2表达。
用抗CD3/抗CD28或OVA刺激脾细胞,检测Treg中IL1R2表达;使用SCENIC分析转录因子活性;用c-Rel抑制剂pentoxifylline处理验证。
确定IL1R2是否在tiTreg功能或肿瘤生长中起直接作用。
使用Treg特异性敲除(IL1R2Δtreg)和全身敲除小鼠,接种肿瘤后监测生长和免疫细胞组成。
开发针对IL1R2的ADCC依赖清除工具。
通过免疫羊驼生成抗IL1R2纳米抗体,筛选后构建Fc融合蛋白,包括阻断/非阻断、ADCC活性/失活变体,并验证结合和ADCC功能。
测试抗IL1R2构建体单独使用对肿瘤生长的影响。
在E0771和MC38荷瘤小鼠中给予不同构建体,监测肿瘤生长、生存期和免疫细胞变化。
测试与抗PD-1联合是否能增强疗效。
在E0771荷瘤小鼠中联合给予抗IL1R2构建体和抗PD-1抗体,比较不同组合的肿瘤生长和生存期。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 基质胶 | Corning | 356230 |
| 药物处理 | 他莫昔芬 | Sigma-Aldrich | -- |
| 细胞分选 | 抗Thy1.2磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-121-278 |
| CD4+CD25+调节性T细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-091-041 | |
| 抗CD4磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-117-043 | |
| 流式分析 | 可固定活力染料eFluor 506 | eBioscience | 65-0866-14 |
| BD FACSAria II | BD Biosciences | -- | |
| BD FACSCanto II | BD Biosciences | -- | |
| 抗小鼠IgG2a抗体 | BioLegend | 407108 | |
| 细胞培养 | RPMI培养基 | -- | -- |
| Hank's平衡盐溶液 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 细胞处理 | 胶原酶I | Worthington | -- |
| 胶原酶IV | Worthington | -- | |
| 脱氧核糖核酸酶 | Worthington | -- | |
| 细胞培养 | CellTrace CFSE | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 抗CD3抗体 | in-house | -- | |
| 抗CD28抗体 | eBioscience | -- | |
| 细胞处理 | 卵清蛋白 | Sigma-Aldrich | -- |
| 白细胞介素1β | -- | -- | |
| 己酮可可碱 | -- | -- | |
| 重组蛋白 | 人IL1R2重组蛋白 | Sino Biological | 10111-H08H |
| 小鼠IL1R2重组蛋白 | Sino Biological | 51090-M08H | |
| 纳米抗体生产 | Gerbu LQ3000佐剂 | Gerbu Biotechnik | -- |
| VCSM13辅助噬菌体 | Agilent Technologies | 200251 | |
| 质粒构建 | In-Fusion HD克隆试剂盒 | Takara Bio | 639642 |
| Phusion定点突变试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | F541 | |
| NEB Stable感受态大肠杆菌 | Bioke | C3040H | |
| GenElute质粒小提试剂盒 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 蛋白表达 | FreeStyle 293F细胞 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| FreeStyle培养基 | Thermo Fisher Scientific | 1233800 | |
| Opti-MEM培养基 | Thermo Fisher Scientific | 31985070 | |
| 聚乙烯亚胺 | Polysciences | 23966 | |
| EX-CELL培养基 | Sigma-Aldrich | 14571C | |
| 蛋白纯化 | Superdex 200 | -- | -- |
| 蛋白检测 | Biacore T200 | GE HealthCare | -- |
| ELISA | 酶联免疫吸附测定 | -- | -- |
| 组织学 | ApopTag Plus过氧化物酶原位凋亡检测试剂盒 | Merck | S7101 |
| 蛋白酶K | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Leica Aperio GT 450 | Leica | -- | |
| ZEISS Axioscan | ZEISS | -- | |
| 肠道通透性 | FITC标记的葡聚糖 | Sigma-Aldrich | FD4-1G |
| 粪便检测 | hemoCARE粪便检测 | Farla Medical | T3061 |
| 流式分析 | 抗CD16/CD32抗体 | in-house | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 肿瘤模型建立 | 细胞系(E0771、MC38等)、接种数量(例如3x10^6)、注射体积和部位、是否使用Matrigel 阅读提示:Methods: 'Cell cultures, tumor models, and treatments' |
| 流式细胞术分析 | 抗体克隆和稀释比例、死活染料、Fc受体阻断步骤、染色温度和时间 阅读提示:Methods: 'Flow cytometry and cell sorting' |
| T细胞抑制实验 | Treg与T细胞比例(1:1或2:1)、anti-CD3/anti-CD28浓度、培养时间 阅读提示:Methods: 'In vitro T-cell suppression assay' |
| IL1R2敲除实验 | 基因型(IL1R2Δtreg或Il1r2−/−)、他莫昔芬给药剂量和途径、肿瘤接种时间 阅读提示:Methods: 'Mice' 和 'Cell cultures, tumor models, and treatments' |
| 纳米抗体治疗 | 构建体类型(阻断/非阻断,ADCC活性)、给药剂量(200 μg或75 μg)、频率(每周两次)、联合治疗的时间安排 阅读提示:Methods: 'Cell cultures, tumor models, and treatments' 和 Results 相应部分 |