构建KC KrasG12D/fl小鼠模型以研究WT Kras缺失对早期病变的影响
评估WT Kras缺失在致癌Kras存在下对胰腺上皮内瘤变形成的影响。
将Pdx1-Cre KrasLSL-G12D小鼠与Krasfl小鼠交配,获得KC KrasG12D/fl小鼠;在42天龄分析胰腺组织,比较PanIN数量、分级和ADM面积。
KRAS Loss of Heterozygosity Promotes MAPK-Dependent Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Initiation and Induces Therapeutic Sensitivity to MEK Inhibition
包含体内基因工程小鼠模型(KC和KPC)、组织学分析、免疫组化、Western blot、RNA-seq、迁移实验和药物治疗实验,涉及功能验证和机制验证。
KC KrasG12D/fl小鼠(Pdx1-Cre KrasLSL-G12D/fl) KPC KrasG12D/fl小鼠(Pdx1-Cre KrasLSL-G12D Trp53R172H) KPC KrasG12D/+小鼠(对照)
WT Kras缺失的基因型确认(通过ddPCR检测KrasG12D等位基因频率) MAPK通路激活水平(pERK1/2、Dusp5/6表达) MEK1/2抑制剂AZD6244的给药剂量(25 mg/kg,每日两次,口服灌胃) 肿瘤起始和进展的监测(超声成像、组织学评分、生存分析)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估WT Kras缺失在致癌Kras存在下对胰腺上皮内瘤变形成的影响。
将Pdx1-Cre KrasLSL-G12D小鼠与Krasfl小鼠交配,获得KC KrasG12D/fl小鼠;在42天龄分析胰腺组织,比较PanIN数量、分级和ADM面积。
测试MAPK通路抑制能否减少WT Kras缺失引起的早期胰腺病变。
从42天龄开始,对KC KrasG12D/fl小鼠给予AZD6244(25 mg/kg,每日两次,口服灌胃)或安慰剂,持续28天,取胰腺组织进行分析。
探索在p53突变背景下,WT Kras缺失对胰腺癌发生和进展的影响。
将KC KrasG12D/fl小鼠与Trp53R172H突变小鼠杂交,获得KPC KrasG12D/fl小鼠;通过超声监测肿瘤起始和生长,评估生存期和转移情况。
阐明WT Kras缺失对MAPK信号、转录组和免疫浸润的影响。
对KPC KrasG12D/fl和KPC KrasG12D/+肿瘤进行Western blot、qRT-PCR、RNA-seq,并评估免疫细胞浸润(CD3、CD4、CD8)和基因表达程序。
评估MEK1/2抑制对已形成的KPC KrasG12D/fl肿瘤的治疗效果。
对具有可触及肿瘤的KPC KrasG12D/fl和KPC KrasG12D/+小鼠给予AZD6244或安慰剂,监测肿瘤体积和生存期。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 药物处理 | 司美替尼(selumetinib) | -- | -- |
| 免疫组化 | 抗磷酸化ERK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 9101 |
| 抗cMYC抗体 | Abcam | ab32072 | |
| 抗p53抗体 | Cell Signaling Technology | 2524 | |
| 抗α-平滑肌肌动蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | A2547 | |
| 抗p21抗体 | Abcam | 107099 | |
| 抗Ki67抗体 | Thermo Fisher Scientific | RM-9106 | |
| 抗Tenascin C抗体 | Sigma-Aldrich | T3413 | |
| 抗DUSP6抗体 | Abcam | Ab76310 | |
| 抗CD3抗体 | Abcam | Ab16669 | |
| 抗CD4抗体 | eBioscience | 14-9766-82 | |
| 抗CD8抗体 | eBioscience | 14-0808-82 | |
| 原位杂交 | RNAscope 2.0 高清棕色检测试剂盒 | Advanced Cell Diagnostics | -- |
| Dusp5探针 | Bio-Techne | 475698 | |
| Dusp6探针 | Bio-Techne | 429321 | |
| cmyc探针 | Bio-Techne | 508808 | |
| Western blot | KRAS G12D抗体 | Cell Signaling Technology | 14429 |
| β-actin抗体 | Sigma-Aldrich | A2228 | |
| ERK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 4695 | |
| pERK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 9101 | |
| MEK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 8727 | |
| pMEK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 2338 | |
| AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 9272 | |
| pAKT (Ser473)抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| PTEN抗体 | Cell Signaling Technology | 9559 | |
| DUSP6抗体 | Abcam | ab76310 | |
| 二抗(抗兔) | Dako | P0448 | |
| 二抗(抗小鼠) | Dako | P0447 | |
| RIPA裂解缓冲液 | -- | -- | |
| Precellys匀浆器 | -- | -- | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23225 | |
| Novex 4-12%梯度胶 | Novex | NP0322PK2 | |
| PVDF膜 | Millipore | IPFL00010 | |
| 牛血清白蛋白 | Sigma-Aldrich | A9647 | |
| 增强化学发光试剂 | Thermo Fisher Scientific | 32132 | |
| ChemiDoc成像仪 | Bio-Rad | -- | |
| Replot Plus | Millipore | 2504 | |
| RAS激活检测 | RAS激活检测生化试剂盒 | Cytoskeleton | BK008 |
| RNA提取 | RNAlater | Sigma-Aldrich | R0901 |
| RNeasy试剂盒 | QIAGEN | 74104 | |
| 反转录 | 高容量cDNA反转录试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 4368814 |
| qRT-PCR | QuantiFast SYBR Green RT-PCR试剂盒 | QIAGEN | 204156 |
| RNA测序 | Agilent RNA 6000 Nano试剂盒 | Agilent | 5067-1511 |
| Illumina TruSeq RNA样本制备试剂盒 | Illumina | -- | |
| Illumina NextSeq高输出75循环试剂盒 | Illumina | -- | |
| DNA提取 | DNeasy血液和组织试剂盒 | QIAGEN | -- |
| ddPCR | ddPCR超混合液 | Bio-Rad | -- |
| QX200微滴读取器 | Bio-Rad | -- | |
| 超声成像 | Vevo 3100超声成像系统 | VisualSonics | MX550D |
| Vevo LAB软件 | Fujifilm | 1.7.1 | |
| 免疫组化 | DPX封片剂 | CellPath | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型构建 | 小鼠基因型:Pdx1-Cre、KrasLSL-G12D、Krasfl、Trp53R172H;遗传背景;性别;年龄 阅读提示:Materials and Methods, Mouse models and experiments |
| 体内治疗 | MEK1/2抑制剂AZD6244剂量(25 mg/kg)、给药途径(口服灌胃)、频率(每日两次)、治疗起始和持续时间 阅读提示:Materials and Methods, In vivo treatment experiments; Figure legends 2 and 4 |
| 肿瘤监测 | 超声成像频率、肿瘤体积测量方法、临床终点标准 阅读提示:Materials and Methods, Tumor monitoring and In vivo treatment experiments |
| 分子分析 | 抗体稀释度、品牌、货号;RNA-seq流程和参数;ddPCR探针序列 阅读提示:Materials and Methods, Immunohistochemistry, Western blotting, mRNA isolation and RNA sequencing, Digital droplet PCR |