空间与单细胞转录组学揭示HNSCC中限制CD8+ T细胞浸润和抗肿瘤活性的癌症相关成纤维细胞亚群

Spatial and Single-Cell Transcriptomics Reveal a Cancer-Associated Fibroblast Subset in HNSCC That Restricts Infiltration and Antitumor Activity of CD8+ T Cells

作者信息Chuwen Li, Haiyan Guo, Peisong Zhai, Ming Yan, Chun Liu, Xiaoning Wang, Chaoji Shi, Jiang Li, Tong Tong, Zhiyuan Zhang, Hailong Ma, Jianjun Zhang
PMID37930937
发布时间2024-01-16
DOI10.1158/0008-5472.CAN-23-1448

摘要

尽管免疫疗法能够延长部分头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)患者的生存期,但其应答率仍然较低。阐明肿瘤微环境中调控CD8+ T细胞浸润与功能障碍的关键机制,有助于最大化免疫疗法治疗HNSCC的临床效益。本研究通过对不同免疫浸润程度的HNSCC样本进行空间转录组分析,并对五对肿瘤及癌旁组织进行单细胞RNA测序,揭示了与CD8+ T细胞浸润受限及功能障碍相关的特定癌症相关成纤维细胞(CAF)亚群。这些CAF高表达CXCLs(CXCL9、CXCL10和CXCL12)及MHC-I,并富集半乳糖凝集素-9(Gal9)。MHC-IhiGal9+ CAF的比例与TCF1+GZMK+ CD8+ T细胞亚群的丰度呈负相关。CAF表面的Gal9可诱导CD8+ T细胞功能障碍,并降低肿瘤浸润性TCF1+CD8+ T细胞的比例。总体而言,MHC-IhiGal9+ CAF的发现深化了我们对CAF在肿瘤免疫逃逸中精确作用的理解,并为开发更有效的HNSCC免疫疗法奠定了基础。研究意义:空间分析鉴定出干扰素诱导的MHC-IhiGal9+ CAF能够形成CD8+ T细胞捕获陷阱,为理解肿瘤微环境中调控T细胞浸润与功能的复杂网络提供了新见解。

实验方法

产品清单

名称品牌货号
自动化定量病理系统VectraPerkinElmer--
10×Genomics Chromium Next GEM Single Cell 3′试剂盒v3.110×Genomics1000268
Illumina Nova 6000 PE150平台IlluminaNova 6000 PE150
gentleMACS Octo解离器Miltenyi--
基质胶Corning354262
胰岛素注射器/针头VWR9151117
FV3000Olympus--
ImarisOxford Instruments--
Beckman CytoFlex SBeckman--
BD FACSCaliburBD Biosciences--
StepOnePlus实时PCR系统Applied Biosystems--
Amersham Imager 600GE--
TissueFAXS Spectra系统TissueGnostics GmbH--
ZEISS AXIOSCAN 7ZEISSAXIOSCAN 7