MET驱动EGFR-TKI耐药与STING诱导相关性验证
验证MET扩增是否诱导STING表达
比较HCC827亲本和耐药细胞(HCC827GR6、HCC827EPR)中STING表达,并用savolitinib处理、MET敲除或过表达检测STING水平。
MET-Induced CD73 Restrains STING-Mediated Immunogenicity of EGFR-Mutant Lung Cancer
研究包含细胞系模型、CRISPR敲除/过表达、流式、免疫印迹、类器官/PDX、免疫组化、人源化小鼠模型、抗原特异性T细胞模型等多种独立证据层级,并进行功能验证和机制验证
HCC827/HCC827GR6肺癌细胞系 HCC827GR6异种移植人源化小鼠模型 J76 TCR-LMP2B T细胞抗原识别模型 EGFR突变肺癌PDX组织样本
HCC827GR6细胞系(MET扩增) CD73敲除(CRISPR/Cas9) PEM(培美曲塞)处理 STING/cGAS敲除 HLA-A*11:01肽段(SSCSSCPLSK)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证MET扩增是否诱导STING表达
比较HCC827亲本和耐药细胞(HCC827GR6、HCC827EPR)中STING表达,并用savolitinib处理、MET敲除或过表达检测STING水平。
验证MET/STING对dsDNA诱导的TBK1-IRF3-STAT1信号和CXCL10分泌的影响
使用poly(dA:dT)或2'3'-cGAMP刺激,检测pTBK1、pIRF3、pSTAT1水平和CXCL10分泌。
验证MET扩增是否同时上调CD73
分析TCGA和CCLE数据库,使用免疫印迹和流式细胞术检测CD73表达,并通过MET敲除或过表达验证。
验证MET通过FRA1调控CD73
检测FRA1表达,通过FRA1过表达或敲除观察CD73变化。
筛选能激活STING的化疗药物并验证PEM特异性效应
多种化疗药物处理HCC827GR6细胞,检测CXCL10、cGAMP、pTBK1/pIRF3/pSTAT1,并验证STING或cGAS敲除的影响。
在体内模型中验证CD73缺失和PEM对免疫原性和肿瘤生长的影响
在人源化小鼠中植入HCC827GR6(对照或CD73 KO),监测肿瘤生长,并用PEM处理,分析CD8+ T细胞浸润。
验证CD73抑制和PEM对T细胞活化的协同作用
使用J76 TCR-LMP2B细胞与肿瘤细胞共培养,检测IFNγ和IL2产生。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Thermo Fisher Scientific | 11965-118 |
| RPMI1640培养基 | Thermo Fisher Scientific | 11875-119 | |
| 胎牛血清 | GeminiBio products | 100-106 | |
| 青霉素/链霉素 | Gibco | 15140-122 | |
| 药物处理 | 奥希替尼 | Selleckchem | S7297 |
| 萨沃替尼 | Selleckchem | S7674 | |
| 培美曲塞 | Selleckchem | S5971 | |
| 多西他赛 | Selleckchem | S1148 | |
| 长春瑞滨 | Selleckchem | S4269 | |
| 依托泊苷 | Selleckchem | S1225 | |
| 奥拉帕尼 | Selleckchem | S1060 | |
| 巴瑞替尼 | Selleckchem | S1147 | |
| 顺铂 | Selleckchem | S1166 | |
| 鲁索替尼 | Selleckchem | S1378 | |
| 曲美替尼 | Selleckchem | S2673 | |
| 克唑替尼 | Selleckchem | S1068 | |
| AB680 | MedChemExpress | HY-125286 | |
| 腺苷 | Sigma-Aldrich | A9251 | |
| 一磷酸腺苷 | Sigma-Aldrich | A1752 | |
| APCP | Sigma-Aldrich | M8386 | |
| 重组人肝细胞生长因子 | R&D Systems | 294-HG-005/CF | |
| 免疫组织化学 | STING抗体 | Cell Signaling Technology | 13647 |
| CD73抗体 | Cell Signaling Technology | 13160 | |
| c-MET抗体 | Abcam | ab243930 | |
| Bond聚合物精制检测试剂盒 | Leica Biosystems | DC9800 | |
| CRISPR/Cas9 | X-tremeGENE HP DNA转染试剂 | Roche | 06366236001 |
| Lenti-X浓缩器 | Clontech | 631231 | |
| qRT-PCR | RNeasy Mini试剂盒 | Qiagen | 74106 |
| SuperScript III第一链合成SuperMix | Thermo Fisher Scientific | 1683483 | |
| Power SYBR Green PCR预混液 | Thermo Fisher Scientific | 4367659 | |
| 免疫印迹 | RIPA裂解和提取缓冲液 | Thermo Fisher Scientific | 89900 |
| 蛋白酶抑制剂 | Roche | 11-836-145-001 | |
| MET抗体 | Cell Signaling Technology | 8198 | |
| 磷酸化MET抗体 | Cell Signaling Technology | 3077 | |
| TBK1抗体 | Cell Signaling Technology | 3013 | |
| 磷酸化TBK1抗体 | Cell Signaling Technology | 5483 | |
| IRF3抗体 | Cell Signaling Technology | 11904 | |
| 磷酸化IRF3抗体 | Cell Signaling Technology | 4947 | |
| STAT1抗体 | Cell Signaling Technology | 9172 | |
| 磷酸化STAT1抗体 | Cell Signaling Technology | 9167 | |
| ERK抗体 | Cell Signaling Technology | 9107 | |
| 磷酸化ERK抗体 | Cell Signaling Technology | 4370 | |
| AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 9272 | |
| 磷酸化AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| FRA1抗体 | Abcam | 124722 | |
| 磷酸化FRA1抗体 | Cell Signaling Technology | 5841 | |
| cGAS抗体 | Cell Signaling Technology | 15102 | |
| β-肌动蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 3700 | |
| IRDye 680LT山羊抗小鼠IgG | LI-COR Bioscience | 926-68020 | |
| IRDye 800CW山羊抗兔IgG | LI-COR Bioscience | 926-32211 | |
| 流式细胞术 | 抗HLA-A,B,C抗体 | BioLegend | 311436 |
| 抗CD73抗体 | BioLegend | 344004 | |
| 抗CD39抗体 | R&D Systems | FAB4397A | |
| 抗PD-L1抗体 | BioLegend | 329718 | |
| 抗CD45抗体 | BioLegend | 368511 | |
| 同型IgG对照抗体 | BioLegend | 400268 | |
| LMP2四聚体-SSCSSCPLSK | MBL | -- | |
| 细胞活力检测 | CellTiter-Glo发光细胞活力检测 | Promega | -- |
| 腺苷检测 | 腺苷检测试剂盒 | Abcam | ab211094 |
| dsDNA刺激 | poly(dA:dT) | Invivogen | tlrl-patn |
| siRNA转染 | 靶向MET的siRNA | Thermo Fisher Scientific | s8702 |
| 阴性对照siRNA | Thermo Fisher Scientific | 4390843 | |
| Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | 13778030 | |
| ELISA | 人CXCL10 ELISA | R&D Systems | DIP100 |
| 人IFNγ ELISA | R&D Systems | DIF50C | |
| 人IL2 ELISA | R&D Systems | D2050 | |
| 动物实验 | NSG小鼠 | The Jackson Laboratory | -- |
| CD34+细胞 | HumanCells Bioscience | -- | |
| 基质胶 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| IV型胶原酶 | Life Technologies | -- | |
| 脱氧核糖核酸酶I | Roche | -- | |
| 红细胞裂解液 | BioLegend | -- | |
| Live/Dead Zombie NIR | BioLegend | -- | |
| 人和小鼠TruStain FcX阻断试剂 | BioLegend | -- | |
| CD16抗体 | BioLegend | 302006 | |
| CD8抗体 | Thermo Fisher Scientific | BDB560662 | |
| CD56抗体 | BioLegend | 318348 | |
| PD-L1抗体 | BioLegend | 329708 | |
| CD3抗体 | BioLegend | 300424 | |
| HLA-DR抗体 | Thermo Fisher Scientific | BDB562804 | |
| CD45RO抗体 | BioLegend | 304237 | |
| CD15抗体 | BioLegend | 323028 | |
| CD19抗体 | BioLegend | 302243 | |
| CD4抗体 | BioLegend | 300554 | |
| CD14抗体 | BioLegend | 301840 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基(DMEM、RPMI1640)、FBS浓度(10%)、青霉素/链霉素(1%)、培养温度(37°C)和CO2浓度(5%) 阅读提示:Materials and Methods- Cell lines |
| 药物处理 | 药物种类、浓度(如PEM、OSI、SAVO等),处理时间(48小时、72小时) 阅读提示:Materials and Methods- Reagents and treatments |
| CRISPR/Cas9敲除 | sgRNA序列,转染试剂(X-tremeGENE HP),质粒用量,筛选抗生素浓度(嘌呤霉素0.5-2 μg/mL,杀稻瘟菌素1.5-8 μg/mL) 阅读提示:Materials and Methods- CRISPR/Cas9 system and lentiviral infection |
| dsDNA刺激 | poly(dA:dT)浓度(1 μg/mL),处理时间(4小时、24小时) 阅读提示:Materials and Methods- dsDNA stimulation |
| 流式细胞术 | 抗体克隆号、稀释度、细胞数量、染色条件(3% FBS/PBS,15分钟冰上) 阅读提示:Materials and Methods- Flow cytometry assay |
| 动物实验 | 小鼠品系(NSG)、年龄(3周)、辐射剂量(2 Gy)、CD34+细胞数量(35,000)、植入方式(静脉、皮下)、细胞数量(5×10^6)、Matrigel浓度(30%),PEM剂量(100 mg/kg i.p.) 阅读提示:Materials and Methods- Murine and tumor implantation studies |
| T细胞功能检测 | J76 TCR-LMP2B细胞与肿瘤细胞共培养比例(E:T比),肽段浓度(0.1,1,10 μg/mL),培养时间(72小时) 阅读提示:Results and Figure 2 legend |