LSD1与异常DNA甲基化介导支持BRAF突变结直肠癌的肠内分泌祖细胞持续存在

LSD1 and Aberrant DNA Methylation Mediate Persistence of Enteroendocrine Progenitors That Support BRAF-Mutant Colorectal Cancer

作者信息Samuel A Miller, Robert A Policastro, Shruthi Sriramkumar, Tim Lai, Thomas D Huntington, Christopher A Ladaika, Daeho Kim, Chunhai Hao, Gabriel E Zentner, Heather M O'Hagan
PMID34035083
发布时间2021-07-15
DOI10.1158/0008-5472.CAN-20-3562

摘要

尽管分泌细胞(包括杯状细胞和肠内分泌细胞)与含有黏液的不同结直肠癌组织学亚型存在关联,但它们在结直肠癌进展中的作用尚未得到充分探索。本研究通过对癌症基因组图谱(TCGA)和单细胞RNA测序数据的分析发现,肠内分泌祖细胞在BRAF突变型结直肠癌患者的肿瘤组织、细胞系及患者来源类器官中显著富集。在BRAF突变型结直肠癌中,DNA甲基化及关键分化基因NEUROD1的沉默阻断了肠内分泌祖细胞向成熟细胞的分化进程。机制研究表明,分泌细胞及其分泌的因子(如三叶因子3)能促进整个细胞群体的集落形成并激活细胞存活通路。赖氨酸特异性去甲基化酶1(LSD1)被鉴定为分泌细胞定向分化的关键调控因子——在体外实验和结肠原位异种移植模型中,LSD1的缺失可阻断肠内分泌祖细胞形成,并抑制肿瘤生长与转移。这些发现揭示了肠内分泌祖细胞在支持结直肠癌发展中的重要作用。 意义:本研究确立了肠内分泌祖细胞作为可靶向的细胞群体,其能促进BRAF突变型结直肠癌进展,而通过抑制LSD1可阻断该群体功能从而抑制肿瘤生长。

实验方法

产品清单

名称品牌货号
10X Genomics Chromium系统10X GenomicsChromium Next GEM Single Cell 3′ Kit v3.1
NovaSeq 6000测序仪--NovaSeq S2 reagent kit v1.0
RNeasy mini试剂盒Qiagen74104
RNeasy micro试剂盒Qiagen74004
DNeasy试剂盒Qiagen69504
QIAamp DNA micro试剂盒Qiagen56304
EZ DNA甲基化快速试剂盒Zymo ResearchD5030
Leica SP8扫描共聚焦系统Leica Microsystems--
IVIS成像系统----