验证CD271在治疗耐药中的表达上调
评估化疗和MAPK抑制剂治疗是否导致CD271表达升高。
用化疗药物(BCNU、CISP、DTIC)和MAPK抑制剂(PLX4032、MEK162)处理黑色素瘤细胞系及其3D球体,通过FACS和Western blot检测CD271表达;并在患者治疗前后的肿瘤活检标本中通过IHC评估CD271水平。
Specific Activation of the CD271 Intracellular Domain in Combination with Chemotherapy or Targeted Therapy Inhibits Melanoma Progression
包含体外2D/3D细胞实验、离体患者肿瘤切片、斑马鱼和裸鼠体内模型等多层次验证,并涉及CD271-JNK-ROS机制解析和功能验证。
八种黑色素瘤细胞系(包括WM115、WM266-4、SKMEL28、WM793B、1205Lu及患者来源细胞) 3D黑色素瘤球体 离体患者肿瘤切片 斑马鱼异种移植模型 裸鼠皮下移植瘤模型
CD271表达水平(高vs低)与Aβ(25–35)杀伤效果的相关性 化疗药物(顺铂、卡莫司汀、达卡巴嗪)和MAPK抑制剂(PLX4032、MEK162)的联合处理条件 Aβ(25–35)浓度(40 μmol/L)及处理时间 CD271敲除或过表达对细胞死亡的影响 体内模型中Aβ(25–35)给药途径(瘤内注射)和频率(每周三次)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估化疗和MAPK抑制剂治疗是否导致CD271表达升高。
用化疗药物(BCNU、CISP、DTIC)和MAPK抑制剂(PLX4032、MEK162)处理黑色素瘤细胞系及其3D球体,通过FACS和Western blot检测CD271表达;并在患者治疗前后的肿瘤活检标本中通过IHC评估CD271水平。
测试Aβ(25–35)单独或联合化疗/靶向药物对黑色素瘤细胞活力和凋亡的影响。
在2D细胞培养和3D球体模型中,用Aβ(25–35)(40 μmol/L)单独或联合顺铂、BRAFi、MEKi处理,通过MTT、PI染色、caspase-3/7活性检测评估细胞活力和凋亡。
验证Aβ(25–35)能否在耐药患者的肿瘤组织中抑制细胞增殖。
从对MAPKi耐药的患者中获取新鲜肿瘤,制备离体切片,用Aβ(25–35)单独或联合药物处理5天,通过IHC检测Ki67、TUNEL等标记。
确定Aβ(25–35)能否抑制黑色素瘤侵袭和体内转移。
在3D侵袭模型中,用Aβ(25–35)处理球体,通过活/死染色评估细胞死亡;在斑马鱼异种移植模型中,用Aβ(25–35)处理,评估转移发生率;在裸鼠皮下肿瘤模型中,瘤内注射Aβ(25–35),测量肿瘤体积。
证明Aβ(25–35)通过CD271发挥作用,并阐明其信号通路。
通过CD271敲除(CRISPR/Cas9)、过表达(TetON系统)和FACS分选CD271+细胞,检测Aβ(25–35)诱导的细胞死亡;通过Western blot和免疫共沉淀检测CD271裂解、JNK磷酸化、PARP裂解、ROS产生。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI1640培养基 | Sigma Life Science | -- |
| 胎牛血清 | Gibco, Life Technologies | -- | |
| L-谷氨酰胺 | Biochrom | -- | |
| 药物处理 | 维莫非尼 | Selleckchem | -- |
| 比美替尼 | Selleckchem | -- | |
| JNK抑制剂(SP600125) | Santa Cruz Biotechnology | -- | |
| MG132 | Calbiochem | -- | |
| DAPT | Calbiochem | -- | |
| TAPI2 | Calbiochem | -- | |
| N-乙酰-L-半胱氨酸 | Sigma | -- | |
| 顺铂 | Selleckchem | -- | |
| 达卡巴嗪 | Selleckchem | -- | |
| 卡莫司汀 | Selleckchem | -- | |
| Aβ(25–35)肽 | Bachem | -- | |
| 对照肽(35–25) | Bachem | -- | |
| 重组CD271胞外域 | LSBio | -- | |
| 细胞培养 | 多西环素 | 文中未明确说明 | -- |
| Western blot | CD271抗体 | Cell Signaling Technology | 8238 |
| CD271_ICD抗体 | Merck | 07–476 | |
| APR1抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5–67686 | |
| NRAGE抗体 | R&D System | MAB38352 | |
| PARP抗体 | Cell Signaling Technology | 9542 | |
| Cleaved-PARP抗体 | Cell Signaling Technology | 5625 | |
| p53抗体 | Cell Signaling Technology | 2527 | |
| p21抗体 | Cell Signaling Technology | 2946 | |
| GSK抗体 | Cell Signaling Technology | 9315 | |
| pGSK抗体 | Cell Signaling Technology | 9336 | |
| JNK抗体 | Cell Signaling Technology | 9252 | |
| pJNK抗体 | Cell Signaling Technology | 4668 | |
| GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 3683 | |
| Snail抗体 | Cell Signaling Technology | 3879 | |
| Slug抗体 | Cell Signaling Technology | 9585 | |
| N-cadherin抗体 | Cell Signaling Technology | 13116 | |
| E-cadherin抗体 | Cell Signaling Technology | 3195 | |
| 辣根过氧化物酶标记二抗 | Cell Signaling Technology | 7074 | |
| 免疫沉淀 | 免疫沉淀试剂盒 | Abcam | ab206996 |
| 流式检测 | CD271抗体 | Merck | 05–446 |
| Alexa Fluor 488标记抗鼠二抗 | Invitrogen | A21202 | |
| MitoSOX | Invitrogen | M36008 | |
| 碘化丙啶 | 文中未明确说明 | -- | |
| CellEvent Caspase-3/7绿色检测试剂 | Invitrogen | C10723 | |
| 细胞分选 | FACS Aria III流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| FACS Diva软件 | BD Biosciences | -- | |
| 细胞培养 | 钙黄绿素 | Sigma | 17783 |
| 乙锭同二聚体 | Sigma | E1510 | |
| 免疫组化 | S100抗体 | Novocastra, Agilent Technologies | NCL-L-S100p |
| CD271抗体 | Lab Vision Corporation | LS-C124234-100 | |
| Ki67抗体 | Dako | M7240 | |
| TUNEL | Sophistolab | -- | |
| Snail/Slug抗体 | Abcam | ab85936 | |
| Caspase-3抗体 | Abcam | ab2302 | |
| 斑马鱼实验 | Vybrant细胞标记溶液 | Molecular Probes | -- |
| 小鼠实验 | 基质胶 | BD Biosciences | -- |
| CRISPR敲除 | LentiCRISPRv2GFP表达质粒 | Addgene | 82242426, 82416 |
| psPAX2包装质粒 | Addgene | 12260 | |
| pMD2.G包膜质粒 | Addgene | 12259 | |
| PEImax转染试剂 | Polysciences | 24765 | |
| 聚凝胺 | Sigma-Aldrich | H9268 | |
| siRNA转染 | APR1 siRNA(OnTargetPlus SMART pool human MAGEH1) | Dharmacon Inc. | L-009135-00-0005 |
| 乱序siRNA(siGENOME对照池非靶向#1) | Dharmacon Inc. | D-001206-13-05 | |
| INTERFERin转染试剂盒 | Polyplus-transfection | 101000016 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | 11960-044 |
| 细胞实验 | GraphPad Prism 5.0 | GraphPad | -- |
| 图像分析 | ImageJ | 文中未明确说明 | -- |
| Photoshop | Adobe | -- | |
| 显微镜 | Leica TCS SPE共聚焦显微镜 | Leica | -- |
| Leica MZFLIII解剖显微镜 | Leica | -- | |
| Leica DFC7000T相机 | Leica | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基成分(RPMI1640、FBS、谷氨酰胺、丙酮酸钠)及培养条件 阅读提示:Materials and Methods, Cell culture |
| 药物处理 | Aβ(25–35)浓度(40 μmol/L)及配制方法;化疗药物(顺铂、卡莫司汀、达卡巴嗪)和MAPK抑制剂(PLX4032、MEK162)的浓度 阅读提示:Materials and Methods, Cell culture; Figure legends |
| 离体患者肿瘤培养 | 肿瘤切片厚度(300 μm)、处理时间(3-5天)、患者来源(MAPKi耐药、BRAF突变) 阅读提示:Materials and Methods, Ex vivo cultures; Figure 3 legend |
| 3D球体实验 | 细胞接种密度(5×10^3细胞/孔)、培养时间(72小时)、胶原I基质、处理时间(96-168小时) 阅读提示:Materials and Methods, Three-dimensional spheroids; Figure 2 legend |
| 斑马鱼异种移植 | 细胞注射量、Aβ(25–35)注射时间(2 dpi)、药物处理方式(水中加入)、转移评估时间(4天) 阅读提示:Materials and Methods, Zebrafish; Figure 4 legend |
| 小鼠异种移植 | 细胞注射量(5×10^5)、Matrigel比例、Aβ(25–35)剂量(15 μg)、给药频率(每周三次) 阅读提示:Materials and Methods, Mice; Figure 4F legend |