评估RAS(ON)抑制剂与CDK4/6抑制剂联合的抗肿瘤活性
确定在PDAC模型中,相比单药治疗,联合治疗是否能增强并延长肿瘤反应。
在KPC1、KPC2原位模型,KPC GEMM模型,以及KP-4 CDX和多种PDX模型中,给予RMC-7977或daraxonrasib(RAS(ON)抑制剂),palbociclib或abemaciclib(CDK4/6抑制剂)单药或联合治疗,通过超声和肿瘤体积测量评估抗肿瘤活性。
A RAS(ON) Multi-Selective Inhibitor Combination Therapy Triggers Long-term Tumor Control through Senescence-Associated Tumor-Immune Equilibrium in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
包含体外、原位、自发性、CDX、PDX等多种模型,功能验证(H2B-mCherry增殖示踪、细胞耗竭)和机制验证(scRNA-seq、IF、流式)充分。
KPC1、KPC2、KPC4原位移植瘤模型(C57Bl/6小鼠) KPC基因工程小鼠模型(Pdx1-Cre; LSL-KrasG12D/+; Trp53fl/+) KP-4细胞系来源异种移植瘤模型(BALB/c裸鼠) 患者来源异种移植瘤模型(PDX)
RMC-7977和palbociclib的给药剂量(25 mg/kg和100 mg/kg,口服,每周三次)及给药方案 FGK4.5(CD40激动剂)的给药剂量(100 μg/小鼠,每14天,腹腔注射)及时间点 CD4 T细胞耗竭(GK1.5抗体)对肿瘤复发的影响 H2B-mCherry增殖示踪实验中doxycycline的给予方案 scRNA-seq分析中Sen-High细胞的定义阈值
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定在PDAC模型中,相比单药治疗,联合治疗是否能增强并延长肿瘤反应。
在KPC1、KPC2原位模型,KPC GEMM模型,以及KP-4 CDX和多种PDX模型中,给予RMC-7977或daraxonrasib(RAS(ON)抑制剂),palbociclib或abemaciclib(CDK4/6抑制剂)单药或联合治疗,通过超声和肿瘤体积测量评估抗肿瘤活性。
验证联合治疗是否将存活肿瘤细胞驱动至衰老样表型并导致持久的增殖停滞。
对KPC1原位肿瘤进行治疗,并在多个时间点通过SA-β-gal染色、scRNA-seq、H2B-mCherry增殖示踪实验评估衰老相关标志物和增殖状态。
探究联合治疗对肿瘤浸润免疫细胞组成和功能的影响。
通过流式细胞术和免疫荧光分析治疗后的肿瘤组织,评估CD45+免疫细胞亚群比例、T细胞浸润、TLS形成以及免疫细胞表型变化。
确定添加CD40激动剂是否能增强治疗反应并产生持久肿瘤控制。
在KPC1、KPC2、KPC4原位模型中,将FGK4.5(CD40激动剂)添加到RMC-7977+palbociclib方案中,通过超声监测肿瘤体积,并评估生存期和组织学变化。
识别对维持肿瘤免疫平衡至关重要的免疫细胞亚群。
使用中和/耗竭抗体(针对CD4、CD8、CSF1R、CD20、IFN-γ)在三联疗法处理的小鼠中评估肿瘤复发时间,并通过流式、scRNA-seq和IF分析免疫细胞状态。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 胰蛋白酶-EDTA | -- | -- | |
| V型胶原酶 | Sigma-Aldrich | C9263 | |
| 分散酶 | Gibco | 17105041 | |
| Hank's平衡盐溶液 | Life Technologies | 14025-076 | |
| 基质胶 | Corning | 356231 | |
| 药物处理 | RMC-7977 | Revolution Medicines | -- |
| 帕博西尼 | LC Laboratories | P-7744 | |
| Daraxonrasib (RMC-6236) | -- | -- | |
| 阿贝西利 | -- | -- | |
| 抗体治疗 | 抗小鼠CD4抗体(GK1.5) | Bio X Cell | AB_1107636 |
| 抗小鼠CD8a抗体(2.43) | Bio X Cell | AB_1125541 | |
| 抗小鼠CSF1R抗体(AFS98) | Bio X Cell | AB_2687699 | |
| 抗小鼠CD20抗体(SA271G2) | BioLegend | 152104 | |
| 抗小鼠IFN-γ抗体(XMG2.2) | Bio X Cell | AB_1107694 | |
| 激动性抗小鼠CD40抗体(FGK4.5) | Bio X Cell | AB_1107601 | |
| 流式细胞术 | LIVE/DEAD固定蓝色死细胞染色试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | L23105 |
| LIVE/DEAD固定近红外死细胞染色试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | L10119 | |
| Foxp3/转录因子染色缓冲液套装 | eBioscience | 00-5523-00 | |
| Cytek Aurora光谱分析仪 | Cytek | SCR_019826 | |
| Sony MA900细胞分选仪 | Sony | SCR_026300 | |
| UltraComp eBeads补偿微球 | Thermo Fisher Scientific | 01-2222-41 | |
| 组织学 | X-gal(5-溴-4-氯-3-吲哚基-β-D-半乳糖苷) | Invitrogen | 15520018 |
| 免疫荧光 | 抗磷酸化ERK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 4370 |
| 抗裂解caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9664 | |
| 抗Ki67抗体 | Abcam | ab281928 | |
| 抗CD4抗体 | Abcam | ab271945 | |
| 抗CD8a抗体 | Abcam | ab277939 | |
| 抗泛角蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 4523 | |
| 抗CD45抗体 | Novus Biologicals | NB100-77417AF750 | |
| 抗CD3抗体 | BD Biosciences | 557869 | |
| 抗B220抗体 | BioLegend | 103226 | |
| 抗MHC-II抗体 | BioLegend | 107650 | |
| 抗podoplanin抗体 | BioLegend | 127407 | |
| 抗α-SMA抗体 | Thermo Fisher Scientific | 50-9760-82 | |
| 抗CD31抗体 | BioLegend | 102520 | |
| 抗F4/80抗体 | BioLegend | 123120 | |
| 抗E-钙黏蛋白抗体 | BioLegend | 147308 | |
| 抗髓过氧化物酶抗体 | Abcam | ab225474 | |
| 组织学 | ImmEdge疏水屏障PAP笔 | -- | -- |
| Fluoromount-G封片剂 | SouthernBiotech | 0100-01 | |
| scRNA-seq | 10x Genomics Chromium控制器 | 10x Genomics | -- |
| Cell Ranger | 10x Genomics | -- | |
| Seurat | -- | -- | |
| CellBender | -- | -- | |
| 数据分析 | FlowJo | -- | SCR_008520 |
| GraphPad Prism | -- | -- | |
| ImageJ/Fiji | -- | -- | |
| QuPath | -- | -- | |
| FlowJo | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 药物处理 | RMC-7977给药剂量(25 mg/kg,口服,每周三次)和palbociclib给药剂量(100 mg/kg,口服,每周三次);对于RMC-6236和abemaciclib的处理剂量和频率未明确说明 阅读提示:Methods部分“Small-Molecule RAS and CDK4/6 Inhibitor Treatments (In Vivo)” |
| 抗体治疗 | CD4耗竭抗体(GK1.5)剂量(200µg/小鼠,每周两次,腹腔注射);FGK4.5剂量(100µg/小鼠,每14天,腹腔注射);其他耗竭抗体的剂量和频率 阅读提示:Methods部分“Depleting, Antagonistic, or Agonistic Antibody Treatments (In Vivo)” |
| 细胞移植 | 细胞类型和数量(KPC1:2.5×10^4,KPC2:1×10^5,KPC4:3×10^4,KP-4:5×10^6);移植方式(原位或皮下)和动物品系(C57Bl/6、NSG、BALB/c裸鼠) 阅读提示:Methods部分“Orthotopic PDAC Cell Line Transplant Model”和“Animal Studies Using Xenograft Tumor Models” |
| scRNA-seq分析 | 样本制备(CD45-、ZsGreen+肿瘤细胞分选);文库制备(10x Genomics 5' v2);数据分析参数(Cell Ranger版本、Seurat版本、细胞周期回归、聚类分辨率) 阅读提示:Methods部分“scRNA-Seq Experiments” |
| 衰老检测 | SA-β-gal染色方法(X-gal底物)和定量方法;H2B-mCherry追踪实验的doxycycline诱导和洗脱方案 阅读提示:Methods部分“SA-β-Gal Staining”和“Functional Evaluation of Tumor-Cell Proliferative History” |