体外集落形成实验验证克唑替尼对患者CD34+细胞增殖的抑制
验证克唑替尼能否抑制MPN患者造血祖细胞的增殖。
从MPN患者外周血分离CD34+细胞,在添加生长因子的甲基纤维素培养基中,用0.5μM或1μM克唑替尼处理,统计集落形成单位(CFU)和红系爆式集落形成单位(BFU-E)。
Crizotinib Has Preclinical Efficacy in Philadelphia-Negative Myeloproliferative Neoplasms
包含患者样本、JAK2突变细胞系、转基因及移植小鼠模型等多个独立证据层级,并进行了功能验证(增殖、集落形成)和机制验证(相互作用、敲低/敲除)。
JAK2V617F敲入小鼠模型(JAK2V617FloxP/+;Vav1-Cre) MPN患者外周血CD34+细胞 JAK2突变细胞系(HEL、SET2) JAK2-V617F逆转录病毒骨髓移植小鼠模型
克唑替尼处理剂量:体内100mg/kg,口服,每周5天,共3周;体外0.5μM和1μM 细胞系:HEL(RRID:CVCL_0001)和SET2(RRID:CVCL_2187) 患者样本:MPN患者外周血CD34+细胞,来自Montefiore Hospital hematology biobank(IRB# 2013-2918) ruxolitinib耐药细胞:SET2和HEL ruxolitinib-persistent细胞 RON敲低:4种MST1R shRNA构建体(Origene,Cat# TL320425)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证克唑替尼能否抑制MPN患者造血祖细胞的增殖。
从MPN患者外周血分离CD34+细胞,在添加生长因子的甲基纤维素培养基中,用0.5μM或1μM克唑替尼处理,统计集落形成单位(CFU)和红系爆式集落形成单位(BFU-E)。
验证克唑替尼在体内能否降低MPN疾病负担。
对JAK2V617FloxP/+;Vav1-Cre小鼠(6周龄)以100mg/kg克唑替尼口服灌胃,每周5天,共3周,检测脾脏重量、血细胞计数和组织学。
验证克唑替尼对JAK2突变细胞系的直接抑制作用及对JAK/STAT信号的影响。
用不同浓度克唑替尼处理HEL和SET2细胞,测定细胞活力(CellTiter-Glo);用Western blot检测JAK2、STAT3、STAT5磷酸化。
验证克唑替尼能否克服JAK抑制剂耐药。
使用SET2和HEL ruxolitinib-persistent细胞,单独或联合使用克唑替尼和ruxolitinib,检测细胞活力、STAT5/3磷酸化,并进行协同分析(ZIP)。
验证磷酸化RON与磷酸化JAK2物理相互作用,以及克唑替尼能否破坏该相互作用。
在SET2-persistent细胞中进行免疫共沉淀(co-IP)检测pRON和pJAK2的结合,并用克唑替尼和ruxolitinib联合处理观察相互作用是否被破坏。
验证RON在JAK2突变细胞中调控JAK/STAT信号和增殖。
用靶向MST1R的shRNA慢病毒转导HEL和SET2细胞,通过qPCR确认敲低效率,检测细胞集落形成和JAK2/STAT3/5磷酸化。
验证RON缺失在体内是否抑制JAK2V617F诱导的MPN。
利用Stk−/−小鼠和野生型小鼠的骨髓cKit+细胞感染JAK2V617F-GFP逆转录病毒,移植到致死照射的受体小鼠,监测外周血WBC、Hb和GFP%随时间变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| CD34+细胞分离 | Ficoll-Paque PLUS | GE Healthcare | 17-1440-02 |
| 人CD34磁珠试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-046-702 | |
| 集落形成实验 | 人StemMACS完全培养基 | Miltenyi Biotec | 130-091-280 |
| M3434甲基纤维素培养基 | STEMCELL Technologies | -- | |
| M3334甲基纤维素培养基 | STEMCELL Technologies | -- | |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Corning | 10-040-CV |
| DMEM培养基 | Corning | 15-017-CV | |
| 胎牛血清 | Gemini | 900-108 | |
| 青霉素/链霉素 | Corning | 30-002-CI | |
| 细胞刺激 | 重组人促红细胞生成素 | Cell Sciences | CRE600B |
| 重组人干细胞因子 | Peprotech | 300-07 | |
| 重组人肝细胞生长因子 | Peprotech | 10039H | |
| 药物处理 | 克唑替尼 | Selleckchem (体外) | S1068 |
| 鲁索替尼 | Selleckchem | S1378 | |
| 色瑞替尼 | Selleckchem | s7083 | |
| 阿来替尼 | Selleckchem | s2762 | |
| 蛋白检测 | 抗磷酸化JAK2抗体 | Cell Signaling Technology | 3771 |
| 抗JAK2抗体 | Cell Signaling Technology | 3230 | |
| 抗磷酸化STAT3抗体 | Cell Signaling Technology | 9145 | |
| 抗STAT3抗体 | Cell Signaling Technology | 12640 | |
| 抗磷酸化STAT5抗体 | Cell Signaling Technology | 9314 | |
| 抗STAT5抗体 | Cell Signaling Technology | 94205 | |
| 抗RON抗体 | Cell Signaling Technology | 2654 | |
| 抗磷酸化RON抗体 | R&D Systems | AF1947 | |
| 抗纽蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | V9131 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | A2228 | |
| Western blot | NuPAGE 7% Tris-醋酸蛋白凝胶 | Thermo Fisher | EA0358BOX |
| 细胞活力测定 | CellTiter-Glo发光细胞活力测定试剂盒 | Promega | G9241 |
| shRNA转导 | MST1R shRNA质粒试剂盒 | Origene | TL320425 |
| MET shRNA质粒试剂盒 | Origene | TL320418 | |
| 乱序shRNA对照质粒 | Origene | TR30021 | |
| 分子克隆 | Qiagen HiSpeed质粒大提试剂盒 | Qiagen | 12663 |
| 病毒包装 | Trans293转染试剂 | Origene | TT500002P5 |
| pCMVR8.74包装质粒 | Addgene | RRID:Addgene_22036 | |
| pCMV-VSVg质粒 | Addgene | RRID:Addgene_8453 | |
| 逆转录病毒包装 | MSCV-JAK2V617F-GFP质粒 | Gilliland lab | -- |
| 小鼠骨髓移植 | CD117磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-091-224 |
| 重组小鼠IL-3 | Peprotech | 213-13 | |
| 重组小鼠SCF | Peprotech | 250-03 | |
| 重组小鼠IL-6 | Peprotech | 216-16 | |
| 拜耳百病消100 | Bayer | -- | |
| 流式细胞术 | 抗小鼠CD71抗体 | BD Biosciences | BD-561937 |
| 抗小鼠Ter119抗体 | Thermo Fisher | 17-5921-82 | |
| 动物模型 | JAK2V617FloxP/+小鼠 | The Jackson Laboratory | Stock |
| Stk−/−小鼠 | -- | -- | |
| Western blot裂解液 | NP-40裂解液 | Alfa Aesar | J60902 |
| Pierce蛋白酶和磷酸酶抑制剂片 | Thermo Scientific | A32961 | |
| Western blot封闭 | 含BSA的TBS-T | -- | -- |
| 免疫共沉淀 | Protein A磁珠 | Thermo Fisher | 22810 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体内克唑替尼治疗 | 小鼠模型:JAK2V617FloxP/+;Vav1-Cre小鼠;给药方案:100mg/kg,口服,每周5天,持续3周;对照组:HCl酸化水;开始治疗时年龄:6周龄 阅读提示:材料与方法:In-vivo crizotinib treatment |
| 患者CD34+细胞集落形成实验 | 患者样本来源:MPN患者外周血CD34+细胞;细胞数量:4000个/孔;处理浓度:0.5μM和1μM;培养基:人StemMACS(含EPO);培养时间:10-12天 阅读提示:材料与方法:Methylcellulose Colony Forming Unit Assays |
| 体外细胞活力测定 | 细胞系:HEL和SET2;细胞浓度:2x10^5 cells/mL;克唑替尼浓度:50nM, 100nM, 250nM, 500nM, 1μM, 2.5μM;检测试剂:CellTiter-Glo;孵育时间:未明确说明 阅读提示:材料与方法:Proliferation Assays |
| ruxolitinib耐药细胞组合治疗 | 细胞系:SET2-和HEL-ruxolitinib-persistent;药物:克唑替尼和ruxolitinib联合;ZIP协同分析参数;培养时间:3天 阅读提示:结果:Crizotinib promotes a sustained response to JAK inhibitor treatment;材料与方法:Proliferation Assays |
| RON shRNA敲低 | 细胞系:HEL和SET2;shRNA构建体:MST1R shRNA质粒(Origene Cat# TL320425);转导试剂:polybrene(8μg/mL);筛选浓度:嘌呤霉素2μg/mL;敲低验证:qPCR 阅读提示:材料与方法:Lentiviral Transduction;结果:RON kinase is an important target of crizotinib in MPN |