构建PSC和结肠炎小鼠模型
模拟胆管癌风险因素,研究肠道微生物对肝脏免疫的影响
使用BDL手术或Mdr2−/−小鼠建立PSC样模型,使用DSS或TNBS诱导结肠炎模型。
Gut Microbiome Directs Hepatocytes to Recruit MDSCs and Promote Cholangiocarcinoma
包含小鼠模型(BDL、Mdr2−/−、DSS结肠炎)、细胞系(HepG2、Hep3B)、患者样本及多组学分析,并进行了功能验证(MDSC抑制T细胞增殖)和机制验证(TLR4敲除等)。
C57BL/6小鼠BDL诱导的PSC样模型 Mdr2−/−小鼠自发性PSC样模型 DSS诱导的结肠炎小鼠模型 肝细胞系HepG2和Hep3B
新霉素处理清除革兰氏阴性菌后,肝内PMN-MDSC积累和肿瘤生长受抑 Tlr4−/−小鼠中LPS或DSS诱导的肝内PMN-MDSC积累消失 肝细胞特异性Tlr4敲除(Tlr4LKO)小鼠中DSS诱导的PMN-MDSC积累和肿瘤生长受抑 CXCL1中和抗体或CXCR2抑制剂SB225002处理后,肝内PMN-MDSC减少并抑制肿瘤生长 粪便移植实验:万古霉素处理的小鼠粪便(富含革兰氏阴性菌)移植到无菌小鼠后肝内PMN-MDSC增加
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟胆管癌风险因素,研究肠道微生物对肝脏免疫的影响
使用BDL手术或Mdr2−/−小鼠建立PSC样模型,使用DSS或TNBS诱导结肠炎模型。
验证PSC和结肠炎导致肠道通透性增加和细菌移位到肝脏
通过FITC-dextran实验检测肠道通透性,通过16s rRNA定量和细菌培养检测门静脉血和肝脏中的细菌,通过FISH可视化细菌。
确定PSC和结肠炎是否导致肝内MDSC积累以及其免疫抑制功能
通过流式细胞术分析肝内免疫细胞亚群,特别是CD11b+Gr1+细胞;通过抑制T细胞增殖实验验证MDSC的免疫抑制功能。
确定革兰氏阴性菌是否通过LPS/TLR4通路驱动MDSC积累
使用新霉素(抗革兰氏阴性菌)和万古霉素(抗革兰氏阳性菌)处理小鼠,进行粪便移植实验;检测门静脉血LPS浓度;使用LPS腹腔注射和Tlr4−/−小鼠。
确定CXCL1和CXCR2在MDSC积累中的必要性
检测肝内CXCL1表达,通过肝细胞特异性过表达CXCL1、使用中和抗体或CXCR2抑制剂(SB225002)来验证。
验证肝细胞上的TLR4是否介导LPS诱导的CXCL1表达和MDSC积累
使用肝细胞特异性Tlr4敲除小鼠(Tlr4LKO)和骨髓嵌合体小鼠进行DSS处理。
检测PSC和结肠炎是否促进胆管癌的生长
使用水动力注射AKT+YAP或AKT+NICD1诱导胆管癌,并在BDL、Mdr2−/−或DSS小鼠中进行。
确定MDSC是否通过CXCL1/CXCR2轴促进胆管癌生长
使用抗Ly6G抗体消耗PMN-MDSC,或使用CXCL1中和抗体、SB225002,观察肿瘤生长变化。
确定MDSC是否通过抑制NK细胞功能促进肿瘤生长
使用抗NK抗体消耗NK细胞,观察肿瘤生长变化。
将动物模型发现推广到人类患者
检测肝硬化患者肝组织中的LPS,评估TLR4基因签名与患者生存的相关性,以及人类肝细胞系中LPS诱导的CXCL1/IL-8表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 葡聚糖硫酸钠 | -- | -- |
| 脂多糖 | Sigma | L2880 | |
| 抗Ly6G抗体(克隆1A8) | BioxCell | -- | |
| CXCL1中和抗体(MAB453) | R&D Systems | -- | |
| SB225002 | Tocris Bioscience | -- | |
| FITC-葡聚糖(4KDa) | Sigma | -- | |
| 肠道通透性检测 | ToxinSensor™显色LAL内毒素检测试剂盒 | GenScript | L00250 |
| 细菌检测 | EUB338探针 | -- | -- |
| 细胞培养 | IV型胶原酶 | Sigma | C5138 |
| Optiprep | -- | -- | |
| 分子检测 | RNeasy微型试剂盒 | Qiagen | 74104 |
| iScript™ cDNA合成试剂盒 | BIO-RAD | 170-8891 | |
| TRIzol试剂 | Thermo Fisher | 15596018 | |
| High Capacity cDNA逆转录试剂盒 | Thermo Fisher | 4368814 | |
| iQ SYBR Green Supermix | BIO-RAD | 1708882 | |
| 蛋白质检测 | 哺乳动物蛋白提取试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Halt蛋白酶和磷酸酶抑制剂 | Thermo Scientific | -- | |
| Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| PVDF膜 | BioRad | -- | |
| 抗CK-7抗体(ab181598) | Abcam | -- | |
| 抗CK-19抗体(ab52625) | Abcam | -- | |
| 抗β-Actin抗体(4970S) | Cell Signaling Technology | -- | |
| Clarith/Clarity Max ECL | BioRad | -- | |
| 免疫组化 | 通用动物免疫组化试剂盒 | Innovex | KT4418A |
| 抗HNF-4α抗体(sc-374229) | Santa Cruz | -- | |
| 抗MPO抗体(PP023AA) | Biocare Medical | -- | |
| 抗CD15抗体(M3631) | DAKO | -- | |
| 抗脂多糖核心单抗WN1 222-5(HM6011) | HycultBiotech | -- | |
| ELISA | 人GROα ELISA试剂盒 | Invitrogen | BMS2122 |
| 人IL-8 ELISA试剂盒 | Invitrogen | KHC0081 | |
| 细胞分离 | 髓源性抑制细胞分离试剂盒 | Miltenyi | 130-094-538 |
| 细胞培养 | T细胞激活/扩增试剂盒 | Miltenyi | 130-093-627 |
| 细胞染色 | Foxp3/转录因子染色缓冲液 | eBioscience | -- |
| 流式细胞术 | FACS Aria II | BD Biosciences | -- |
| 测序分析 | Illumina MiSeq平台 | Illumina | -- |
| 细菌鉴定 | MALDI-TOF质谱(BioTyper) | Bruker | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型 | BDL手术的具体步骤、Mdr2−/−小鼠的周龄和性别、DSS的浓度和周期 阅读提示:Methods: Animal studies |
| 肠道通透性和细菌移位检测 | FITC-dextran的剂量和观测时间、门静脉血采集方法、细菌培养条件 阅读提示:Methods: Gut permeability assay, Bacteria translocation |
| MDSC分析 | 流式抗体组合和门控策略、MDSC的绝对计数方法 阅读提示:Methods: Flow cytometry |
| LPS/TLR4通路验证 | LPS的注射剂量和途径、Tlr4−/−小鼠来源、CXCL1中和抗体的剂量和方案、SB225002的剂量和方案 阅读提示:Methods: Animal studies, Figure legends |
| 肿瘤模型 | 水动力注射的质粒比例和体积、肿瘤细胞系LD1和RIL175的注射数量和途径 阅读提示:Methods: Animal studies, Cell lines |
| 患者样本分析 | 患者队列的纳入标准、组织样本处理、TLR4基因签名定义和分组阈值 阅读提示:Methods: Human cohort, Survival analysis |