临床样本相关性分析
验证SLE患者血清Sema5A水平与Th细胞因子(如IL-17A)的相关性。
收集SLE患者和健康对照的血清,通过ELISA检测Sema5A、IFN-γ、IL-4、IL-17A和IL-10水平,并进行相关性分析。
Semaphorin 5A promotes Th17 differentiation via PI3K-Akt-mTOR in systemic lupus erythematosus
包含体外细胞分化实验、siRNA敲低、信号通路抑制剂救援实验,并整合患者样本分析,至少两个独立证据层级,且有功能与机制验证。
SLE患者外周血单个核细胞(PBMCs) 健康对照PBMCs CD4+T细胞体外分化模型
血清Sema5A水平与IL-17A相关性(r=0.5273, P=0.0016) PlexinA1在CD4+T细胞中的表达上调(mRNA和蛋白水平) Sema5A(1 μg/mL)对PBMCs或CD4+T细胞的刺激浓度和时间(48小时或5天) siRNA-PLXNA1序列及转染效率 PI3K/Akt/mTOR抑制剂使用浓度(pictilisib 10μM, MK-2206 5μM, temsirolimus 100nM)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证SLE患者血清Sema5A水平与Th细胞因子(如IL-17A)的相关性。
收集SLE患者和健康对照的血清,通过ELISA检测Sema5A、IFN-γ、IL-4、IL-17A和IL-10水平,并进行相关性分析。
确定Sema5A受体(PlexinA1和PlexinB3)在不同免疫细胞中的表达,并比较SLE患者与健康对照的差异。
从PBMCs中分选CD4+T、CD8+T、CD19+B和CD14+单核细胞,采用qRT-PCR和Western blot检测PlexinA1和PlexinB3表达,并分析GEO数据库(GSE164457和GSE135390)中的表达数据。
评估Sema5A对PBMCs中Th细胞分化和细胞因子产生的影响。
将SLE患者或健康对照的PBMCs用抗CD3/CD28激活,并加入或不加入Sema5A(1μg/mL)刺激48小时,通过流式细胞术检测Th1、Th2、Th17细胞比例,通过ELISA检测细胞因子水平。
验证Sema5A是否直接促进CD4+T细胞向Th17分化。
分选CD4+T细胞,在Th0或Th17极化条件下培养,加入或不加入Sema5A(1μg/mL)5天,检测IL-17A的产生。
验证PlexinA1是否为Sema5A促进Th17分化所必需。
将CD4+T细胞分化为Th0后,用siRNA-PLXNA1或对照siRNA转染,然后在Th17条件下用Sema5A刺激,检测IL-17A产生。
检测Sema5A是否通过PI3K-Akt-mTOR通路促进Th17分化。
用Sema5A刺激CD4+T细胞,Western blot检测AKT和mTOR磷酸化水平;并用PI3K/Akt/mTOR抑制剂处理,检测IL-17A产生。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞分离 | MACS分离缓冲液 | Miltenyi Biotec | 130-091-221 |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Gibco | -- |
| 抗人CD3抗体 | Biolegend | #300302 | |
| 抗人CD28抗体 | Biolegend | #302902 | |
| 药物处理 | 重组人Sema5A | Novoprotein | #C499 |
| 细胞刺激 | PMA | -- | -- |
| 离子霉素 | -- | -- | |
| 流式分析 | BD GolgiStop | BD Biosciences | -- |
| 细胞分选 | CD4磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-045-101 |
| CD8磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-045-201 | |
| CD19磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-050-301 | |
| CD14磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-050-201 | |
| 细胞分化 | IL-1β | MCE | -- |
| IL-6 | MCE | -- | |
| TGF-β | MCE | -- | |
| IL-23 | MCE | -- | |
| 抗IL-4抗体 | Biolegend | -- | |
| 抗IFN-γ抗体 | Biolegend | -- | |
| siRNA转染 | GP Transfected-Mate试剂 | Gene Pharma | -- |
| 信号通路抑制 | Pictilisib | MCE | HY-50094 |
| MK-2206 | MCE | HY-108232 | |
| 坦西莫司 | MCE | HY-50910 | |
| ELISA | Sema5A ELISA试剂盒 | Jiyinmei | -- |
| IFN-γ ELISA试剂盒 | Biolegend | -- | |
| IL-4 ELISA试剂盒 | Biolegend | -- | |
| IL-17 ELISA试剂盒 | Biolegend | -- | |
| IL-10 ELISA试剂盒 | Biolegend | -- | |
| qRT-PCR | PrimeScript RT试剂盒(带gDNA Eraser) | Takara | RR047A |
| TB Green Premix Ex Taq II试剂盒 | Takara | RR820A | |
| 7500 Fast实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 流式分析 | 抗人CD4单克隆抗体 | BioLegend | 317407 |
| 固定缓冲液 | BioLegend | 420801 | |
| 胞内染色透化洗涤缓冲液 | BioLegend | 421002 | |
| 抗人IFN-γ单克隆抗体 | BioLegend | 502531 | |
| 抗人IL-4单克隆抗体 | BioLegend | 500808 | |
| 抗人IL-17A单克隆抗体 | BioLegend | 512333 | |
| Beckman Coulter Fortessa流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- | |
| Western blot | 抗Plexin-A1抗体 | Boster | M06377 |
| 抗Plexin-B3抗体 | R&D Systems | AF4958 | |
| 抗PI3K抗体 | Proteintech | 67071-1-Ig | |
| 抗AKT抗体 | CST | 4691 | |
| 抗p-AKT抗体 | CST | 4060 | |
| 抗mTOR抗体 | CST | 2972 | |
| 抗p-mTOR抗体 | CST | 2971 | |
| 统计分析 | GraphPad Prism v9.00 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本收集 | SLE患者(n=33)和健康对照(n=30)的性别和年龄匹配;诊断标准(ACR 1997);知情同意;伦理批准号;血液采集和处理方式 阅读提示:Materials and methods: Patients and controls |
| PBMCs分离和刺激 | 密度梯度离心法;刺激条件:抗CD3(1μg/mL)包被、抗CD28(1μg/mL)可溶;Sema5A浓度(1μg/mL);刺激时间(48小时);CO2浓度(5%);温度(37°C);PMA/离子霉素/GolgiStop处理时间(最后4小时) 阅读提示:Materials and methods: Peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) separation and stimulation |
| CD4+T细胞分化 | CD4+T细胞纯度;Th17极化条件(IL-1β, IL-6, TGF-β, IL-23, anti-IL-4, anti-IFN-γ的浓度);Sema5A浓度(1μg/mL);培养时间(5天) 阅读提示:Materials and methods: CD4+T cell differentiation |
| siRNA敲低 | siRNA序列;转染试剂;转染时间(48小时);Th17分化条件;Sema5A浓度(1μg/mL);培养时间(5天) 阅读提示:Materials and methods: Small interfering RNA transfection |
| 信号通路抑制 | 抑制剂浓度:pictilisib(10μM)、MK-2206(5μM)、temsirolimus(100nM);预处理时间(4小时);Sema5A刺激时间(24小时);Th17诱导时间(最后1小时) 阅读提示:Materials and methods: Treatment with small-molecule inhibitor |
| ELISA | 检测的细胞因子和试剂盒品牌(Sema5A: Jiyinmei; 其他: Biolegend);样品类型(血清或上清);稀释倍数 阅读提示:Materials and methods: Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) |
| qRT-PCR | RNA提取方法;逆转录试剂盒(PrimeScript RT reagent Kit with gDNA Eraser);qPCR试剂盒(TB Green Premix Ex Taq II);引物序列(表1);内参基因(GAPDH);计算方法(2^-ΔCt × 1000) 阅读提示:Materials and methods: Real-time quantitative PCR |
| 流式细胞术 | 表面染色抗体(anti-CD4);胞内染色抗体(anti-IFN-γ, anti-IL-4, anti-IL-17A);固定/透化试剂盒;流式细胞仪型号 阅读提示:Materials and methods: Flow cytometry |
| Western blot | 抗体列表(anti-Plexin-A1, anti-Plexin-B3, anti-PI3K, anti-AKT, anti-p-AKT, anti-mTOR, anti-p-mTOR);蛋白上样量;封闭条件(5% BSA);一抗稀释比例;二抗 阅读提示:Materials and methods: Western blotting |