验证MSU晶体对MCU表达和线粒体Ca2+的影响
检测MSU晶体是否上调MCU表达并诱导线粒体Ca2+超载。
用MSU晶体和脂肪酸处理BMDMs,通过Western blot和免疫荧光检测MCU表达,使用Rhod-2 AM探针检测线粒体Ca2+水平,并通过MCU敲低或Ru360处理验证其影响。
Mitochondrial calcium uniporter promotes MSU crystal-induced inflammation through inducing mitochondrial Ca2+ overload and ubiquitination of SIRT5 protein
包含体外BMDM实验、MCU敲除/过表达、药物抑制、Co-IP、蛋白组学、CHX追踪和体内MSU晶体诱导的腹膜炎与关节炎模型,并进行功能与机制验证。
骨髓来源巨噬细胞(BMDMs) MCU基因敲除小鼠(MCU⁻/⁻) 野生型小鼠(WT,MCU⁺/⁺) MSU晶体诱导的腹膜炎和关节炎小鼠模型
MSU晶体浓度为100 μg/ml,脂肪酸浓度为50 μM,共刺激12小时 MCU敲低或Ru360(10 μM)处理1小时 MCU过表达或敲低质粒/siRNA转染36小时 CHX追踪实验使用20 μg/ml放线菌酮 蛋白酶体抑制剂MG132(10 μM)处理12小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测MSU晶体是否上调MCU表达并诱导线粒体Ca2+超载。
用MSU晶体和脂肪酸处理BMDMs,通过Western blot和免疫荧光检测MCU表达,使用Rhod-2 AM探针检测线粒体Ca2+水平,并通过MCU敲低或Ru360处理验证其影响。
评估MCU敲低是否保护线粒体形态和功能免受MSU晶体诱导的损伤。
使用MitoTracker Green染色和透射电镜观察线粒体形态,检测线粒体ROS、MMP、MPTP、ATP水平、mtDNA释放和抗氧化酶活性。
探讨MCU缺乏是否抑制MSU晶体诱导的NLRP3炎症小体激活和M1极化。
Western blot检测NLRP3、Caspase-1、IL-1β、COX-2、iNOS表达;ELISA检测IL-1β分泌;免疫荧光检测ASC斑点形成;流式细胞术分析M1/M2巨噬细胞比例。
寻找MCU调控的差异表达蛋白,并验证SIRT5表达变化。
对MCU+/+和MCU-/- BMDMs进行DIA蛋白质组学分析,筛选差异蛋白,通过GO/KEGG/GSEA分析,Western blot验证SIRT5表达。
验证MCU是否通过TRIM21促进SIRT5泛素化和蛋白酶体降解。
通过Co-IP检测SIRT5泛素化水平,CHX追踪实验评估SIRT5稳定性,MG132和HCQ处理确定降解途径,Western blot检测TRIM21和SIRT5表达。
证明MCU、TRIM21和SIRT5之间形成复合物,且MSU晶体促进该相互作用。
通过Co-IP和免疫荧光检测蛋白间相互作用和共定位,包括MCU与TRIM21、MCU与SIRT5、TRIM21与SIRT5,以及三者共表达时的三元复合物形成。
评估MCU敲除是否减轻MSU晶体诱导的腹膜炎和关节炎。
建立MSU晶体诱导的腹膜炎和关节炎小鼠模型,通过流式检测腹腔细胞浸润,ELISA检测IL-1β,H&E染色和免疫荧光检测组织炎症细胞浸润,Western blot检测MCU、TRIM21和SIRT5表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养和分化 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 巨噬细胞集落刺激因子 | -- | -- | |
| 药物处理 | Ru360 | Sigma-Aldrich | 557440 |
| 细胞转染 | Lipo8000转染试剂 | Beyotime Biotechnology | C0533 |
| LipoRNAi™转染试剂 | Beyotime Biotechnology | C0535 | |
| 线粒体Ca2+检测 | Rhod-2 AM探针 | Thermo Fisher | R1245MP |
| 线粒体ROS检测 | MitoSOX探针 | Invitrogen | M36008 |
| 细胞内ROS检测 | DCFH-DA探针 | Beyotime Biotechnology | S0035S |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1探针 | Beyotime Biotechnology | C2006 |
| MPTP检测 | Calcein-AM探针 | Beyotime Biotechnology | C2009S |
| 线粒体形态检测 | MitoTracker Green探针 | Beyotime Biotechnology | C1048 |
| 线粒体呼吸检测 | Seahorse XF24分析仪 | Agilent | -- |
| 抗氧化酶活性检测 | SOD检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | S0101S |
| 过氧化氢酶检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | S0051 | |
| ELISA | IL-1β ELISA试剂盒 | NEOBIOSCIENCE | -- |
| ATP检测 | 增强型ATP检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | S0027 |
| RNA提取 | RNA简易总RNA提取试剂盒 | TIANGEN | DP419 |
| 逆转录 | 逆转录试剂盒 | TIANGEN | KR103 |
| qPCR | SYBR Green预混液 | TIANGEN | FP209 |
| 实时PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| Western blot | 抗TUBULIN抗体 | HUABIO | ET1602-4 |
| 抗VINCULIN抗体 | HUABIO | ET1705-94 | |
| 抗GAPDH抗体 | HUABIO | ET1601-4 | |
| 抗CMPK2抗体 | ImmunoWay | YT6811 | |
| 抗磷酸化AMPK抗体 | CST | T172(40H9) | |
| 抗AMPKα抗体 | HUABIO | ET1608-40 | |
| 抗磷酸化Drp1抗体 | CST | S616 | |
| 抗Drp1抗体 | HUABIO | HA500487 | |
| 抗NF-κB磷酸化P65抗体 | CST | S536 | |
| 抗P65抗体 | HUABIO | ET1603-12 | |
| 抗磷酸化STAT1抗体 | HUABIO | ET1611-20 | |
| 抗STAT1抗体 | HUABIO | ET1606-39 | |
| 抗磷酸化STAT6抗体 | HUABIO | HA722776 | |
| 抗NLRP3抗体 | HUABIO | ER1706-72 | |
| 抗IL-1β抗体 | CST | 3A6 | |
| 抗Caspase-1抗体 | AdipoGen | AG-20B-0042 | |
| 抗COX2抗体 | HUABIO | ET1610-23 | |
| 抗iNOS抗体 | Abcam | AB178945 | |
| 抗CAT抗体 | HUABIO | ER40125 | |
| 抗SIRT5抗体 | HUABIO | ET1701-6 | |
| 抗TRIM21抗体 | HUABIO | HA721832 | |
| 抗MCU抗体 | HUABIO | ER1803-57 | |
| 抗CD86抗体 | HUABIO | ET1606-50 | |
| 抗CD206抗体 | HUABIO | ET1702-04 | |
| 抗泛素抗体 | PTMab | PTM-1106RM | |
| 抗乙酰化SOD2抗体 | Abcam | AB137037 | |
| 免疫沉淀 | 抗Flag抗体 | AlpaVHHs | 016-203-001 |
| 抗HA抗体 | AlpaVHHs | 003-201-001 | |
| 抗Myc抗体 | AlpaVHHs | 002-203-001 | |
| 抗Myc抗体 | proteintech | 60003-2-ig | |
| 抗Flag抗体 | HUABIO | M1403-2 | |
| 流式细胞术 | APC抗小鼠Ly-6G抗体 | BioLegend | 127613 |
| Pacific Blue抗小鼠/人CD11b抗体 | BioLegend | 101263 | |
| PE大鼠抗小鼠F4/80抗体 | BD Biosciences | 565410 | |
| FITC大鼠抗小鼠CD45抗体 | BD Biosciences | 553080 | |
| APC抗小鼠CD86抗体 | Elabscience | E-AB-F0994E | |
| FITC抗小鼠CD206抗体 | Elabscience | E-AB-F1135C | |
| 免疫荧光 | 抗CD68抗体 | Abcam | AB283654 |
| 抗Ly6G抗体 | Abcam | AB238132 | |
| 抗MPO抗体 | Abcam | AB208670 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| BMDM分离和分化 | 骨髓来源巨噬细胞分离方法:文中未明确说明;分化时间5天;培养基DMEM含10% FBS和M-CSF 阅读提示:Methods: Mouse bone marrow-derived macrophages (BMDMs) isolation |
| MSU晶体刺激 | MSU晶体浓度100 μg/ml,脂肪酸浓度50 μM,处理时间12小时 阅读提示:Methods: BMDMs isolation, MSU crystals preparation and treatment |
| MCU抑制 | Ru360浓度10 μM,处理时间1小时 阅读提示:Methods: BMDMs isolation, MSU crystals preparation and treatment |
| siRNA转染 | siRNA序列见表1,转染时间36小时 阅读提示:Methods: Cell transfection, Table 1 |
| 线粒体Ca2+检测 | Rhod-2 AM探针使用步骤:文中未明确说明 阅读提示:Methods: Measurement of mitochondrial Ca2+ levels |
| 线粒体ROS检测 | MitoSOX探针使用步骤:文中未明确说明 阅读提示:Methods: Evaluation of Mitochondrial ROS |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1探针使用步骤:文中未明确说明 阅读提示:Methods: Evaluation of MMP |
| MPTP检测 | Calcein AM探针使用步骤:文中未明确说明 阅读提示:Methods: Evaluation of MPTP |
| 透射电镜 | 固定条件:1.25%戊二醛/0.1 M磷酸盐缓冲液 阅读提示:Methods: The observation of mitochondrial ultra-structure through TEM |
| 线粒体呼吸检测 | Seahorse XF24分析仪使用步骤:文中未明确说明 阅读提示:Methods: Determination of mitochondrial respiration |
| DIA蛋白质组学 | 样本处理:MCU+/+和MCU-/- BMDMs刺激100 μg/ml MSUc和50 μM FAs,每组3个重复 阅读提示:Methods: DIA proteomics and bioinformatics analysis |
| Western blot和IP | 抗体信息见表2 阅读提示:Methods: Western blot analysis and Immunoprecipitation (IP) assay, Table 2 |
| qPCR | 引物序列见表3 阅读提示:Methods: Quantitative PCR (qPCR), Table 3 |
| 体内模型 | MCU敲除小鼠来源:C57BL/6Smoc-Mcuem1Smoc,货号NM-KO-2114415 阅读提示:Methods: Mice and modeling |