构建RHO过表达细胞模型
建立RHO及其突变体过表达的661w细胞模型,用于研究其对细胞能量代谢的影响。
将人RHO cDNA及其突变体(P23H、R135L、G188R)克隆到pcDNA3.1载体中,使用FuGENE HD转染试剂转染661w细胞。
Overexpression of Rhodopsin or Its Mutants Leads to Energy Metabolism Dysfunction in 661w Cells
包含体外细胞模型(661w细胞)过表达实验,并通过OCR/ECAR、线粒体功能、代谢重编程、钙信号及截短突变等多维度验证,涵盖功能与机制验证。
661w小鼠光感受器细胞系 RHO过表达细胞模型 c-tail截短突变模型
细胞系:661w细胞 转染:FuGENE HD Transfection Reagent 处理:NAC (1 mM), Ru265 (10 µM), Compound C (1 µM), 2-APB (10 µM) 检测时间点:转染后24, 36, 48, 60小时 代谢分析:Seahorse XFe24分析仪,OCR和ECAR
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立RHO及其突变体过表达的661w细胞模型,用于研究其对细胞能量代谢的影响。
将人RHO cDNA及其突变体(P23H、R135L、G188R)克隆到pcDNA3.1载体中,使用FuGENE HD转染试剂转染661w细胞。
评估RHO过表达对细胞能量产生和细胞存活的影响。
在转染后不同时间点(24, 36, 48, 60小时)检测ATP水平、ATP/ADP比值、细胞凋亡和坏死。
比较各组OXPHOS和有氧糖酵解的差异,以确定代谢重编程是否发生。
使用Agilent Seahorse XFe24分析仪检测OCR和ECAR,评估线粒体呼吸和糖酵解功能。
确定OXPHOS缺陷是否由线粒体呼吸链抑制或线粒体丢失引起。
检测线粒体呼吸链复合物I-IV活性、Tom20蛋白水平、线粒体质量(MitoTracker Green)和线粒体ROS。
探讨细胞内钙超载是否导致线粒体丢失。
检测线粒体和细胞钙水平,使用Ru265抑制线粒体钙单向转运体,使用2-APB抑制细胞内钙释放,观察线粒体质量、能量状态和凋亡。
确定c-tail在RHO过表达毒性中的作用。
构建c-tail截短突变体(RHOΔC),检测能量状态、细胞凋亡、OCR/ECAR、线粒体质量、钙水平和亚细胞定位。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜尔贝科改良伊格尔培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 药物处理 | N-乙酰半胱氨酸 | Selleck Chemicals | S1623 |
| 2-氨基乙基二苯基硼酸酯 | Selleck Chemicals | S6657 | |
| Ru265 | Sigma-Aldrich | SML2991 | |
| 化合物C | Sigma-Aldrich | P5499 | |
| 质粒构建 | KOD-Plus-诱变试剂盒 | Toyobo | SMK-101 |
| 转染 | FuGENE HD转染试剂 | Promega | PRE2311 |
| 流式分析 | Annexin-V FITC/PI凋亡检测试剂盒 | BD Biosciences | 556547 |
| eBioscience钙传感器染料eFluor 514 | Thermo Fisher Scientific | 65-0859-70 | |
| MitoTracker Green FM | Thermo Fisher Scientific | M7514 | |
| MitoSOX | Thermo Fisher Scientific | M36008 | |
| Rhod-2 AM细胞渗透性 | Thermo Fisher Scientific | R1245MP | |
| 免疫荧光 | 抗视紫红质一抗 | Abcam | ab98887 |
| FITC标记的抗小鼠IgG | Rockland Immunochemicals | 610-102-121 | |
| 抗-Calnexin抗体 | Abcam | ab22595 | |
| 抗兔IgG(H&L)(山羊)罗丹明偶联抗体 | Rockland Immunochemicals | 611-1022 | |
| 共聚焦激光扫描显微镜 | Leica Microsystems | -- | |
| 能量代谢 | 发光ATP检测试剂盒 | Abcam | ab113849 |
| Tecan发光读数仪 | Tecan Group | -- | |
| Pierce BCA蛋白检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23225 | |
| ADP/ATP比值检测试剂盒(生物发光) | Abcam | ab65313 | |
| Agilent XF24细胞培养板 | Agilent | -- | |
| Agilent Seahorse XFe24分析仪 | Agilent | -- | |
| Agilent Seahorse XF基础培养基 | Agilent | 102353-100 | |
| 寡霉素A | Sigma-Aldrich | 75351 | |
| 鱼藤酮 | Sigma-Aldrich | R8875 | |
| Agilent Seahorse XF糖酵解应激测试试剂盒 | Agilent | -- | |
| 葡萄糖 | -- | -- | |
| 2-脱氧葡萄糖 | Sigma-Aldrich | D8375 | |
| 线粒体检测 | 线粒体复合物I活性比色检测试剂盒 | BioVision | -- |
| 琥珀酸脱氢酶活性比色检测试剂盒 | BioVision | -- | |
| 线粒体复合物III活性检测试剂盒 | BioVision | -- | |
| 细胞色素氧化酶活性比色检测试剂盒 | BioVision | -- | |
| 柠檬酸合酶活性比色检测试剂盒 | BioVision | -- | |
| 葡萄糖摄取 | Promega葡萄糖摄取-Glo检测试剂盒 | Promega | J1342 |
| 糖酵解酶活性 | 己糖激酶(HK)活性检测试剂盒 | BioVision | K789-100 |
| 磷酸果糖激酶(PFK)活性检测试剂盒 | BioVision | K776-100 | |
| 乳酸脱氢酶(LDH)活性检测试剂盒 | BioVision | K726-500 | |
| 蛋白提取 | Abcam质膜蛋白提取试剂盒 | Abcam | ab65400 |
| 免疫印迹 | 抗β-肌动蛋白抗体 | Abcam | ab8226 |
| 抗PFKFB2抗体 | Abcam | ab234865 | |
| 抗GRP78抗体 | Abcam | ab21685 | |
| 重组抗葡萄糖转运蛋白GLUT1抗体 | Abcam | ab115730 | |
| Na+/K+ ATP酶抗体 | Cell Signaling Technology | 3010 | |
| 细胞色素c抗体 | Cell Signaling Technology | 4272 | |
| 裂解型caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9661 | |
| Tom20抗体 | Cell Signaling Technology | 42406 | |
| 己糖激酶II抗体 | Cell Signaling Technology | 2867 | |
| 磷酸化PKM2抗体 | Cell Signaling Technology | 3827 | |
| PKM2抗体 | Cell Signaling Technology | 4053 | |
| LDHA抗体 | Cell Signaling Technology | 2012 | |
| AMPKα抗体 | Cell Signaling Technology | 2532 | |
| 磷酸化AMPKα (T172)抗体 | Cell Signaling Technology | 2535 | |
| 辣根过氧化物酶标记的抗兔IgG二抗 | United Chemi-Con | AP132P | |
| 辣根过氧化物酶标记的抗小鼠IgG二抗 | United Chemi-Con | AP308P | |
| 蛋白定量 | Tecan Spark酶标仪 | Tecan Group | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与转染 | 细胞系:661w细胞;培养基:DMEM含10%胎牛血清;转染试剂:FuGENE HD;质粒:pcDNA3.1载体;转染时间:48小时 阅读提示:详见Materials and Methods中'Cell Culture and Chemicals'和'Plasmids and Transfection' |
| 能量代谢检测 | 检测时间:转染后48小时;试剂:Oligomycin A (1 µM), FCCP (1 µM), Rotenone (1 µM) + Antimycin A (1 µM);糖酵解应激:葡萄糖 (1 µM), oligomycin (1 µM), 2-DG (1 µM) 阅读提示:详见Materials and Methods中'Bioenergetic Analyses'和'Seahorse Metabolism Analysis' |
| 线粒体质量与功能 | MitoTracker Green FM (0.1 µM)染色;MitoSOX (0.5 µM);呼吸链复合物活性试剂盒;Tom20蛋白水平 阅读提示:详见Materials and Methods中'Flow Cytometry Analysis'和'Measurements of the Activities of Mitochondrial Respiratory Chain Complex I to IV' |
| 钙信号检测 | Rhod-2 AM (0.5 µM);eFluor 514 (0.5 µM);Ru265 (10 µM);2-APB (10 µM) 阅读提示:详见Materials and Methods中'Flow Cytometry Analysis'和Results中'Mitochondrial Loss in RHO Overexpressed Cells Is Associated With Excessive Intracellular Calcium Release' |
| 糖酵解酶活性检测 | HK (K789-100), PFK (K776-100), PK (K709-100), LDH (K726-500)活性试剂盒;葡萄糖摄取检测试剂盒 (J1342) 阅读提示:详见Materials and Methods中'Glucose Uptake Assay'和'Measurement of the Activities of Rate-Limiting Glycolytic Enzymes' |