建立耐药细胞系模型
建立获得性西妥昔单抗和顺铂耐药的头颈部鳞状细胞癌细胞系模型。
通过逐步增加药物浓度,从 PE/CA-PJ49 和 FaDu 细胞系中筛选出西妥昔单抗耐药克隆;从 PE/CA-PJ49 和 CAL33 细胞系中筛选出顺铂耐药克隆。
PD-L1 is upregulated via BRD2 in head and neck squamous cell carcinoma models of acquired cetuximab resistance
研究包含体外细胞系模型实验,涉及表达检测、药物处理、基因敲低和染色质免疫沉淀,并包含功能验证,但缺少动物模型或患者样本等独立证据层级。
PE/CA-PJ49 西妥昔单抗耐药细胞系 FaDu 西妥昔单抗耐药细胞系 PE/CA-PJ49 顺铂耐药细胞系 CAL33 顺铂耐药细胞系
西妥昔单抗耐药克隆的生成 JQ1 的处理浓度和时间 MZ1 的处理浓度和时间 siRNA 转染的浓度和时间 CD274 启动子 ChIP 富集分析
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立获得性西妥昔单抗和顺铂耐药的头颈部鳞状细胞癌细胞系模型。
通过逐步增加药物浓度,从 PE/CA-PJ49 和 FaDu 细胞系中筛选出西妥昔单抗耐药克隆;从 PE/CA-PJ49 和 CAL33 细胞系中筛选出顺铂耐药克隆。
评估耐药模型与亲本细胞相比 PD-L1 表达水平的变化。
通过免疫印迹、qRT-PCR 和流式细胞术检测 PD-L1 蛋白和 mRNA 水平。
探究 BET 蛋白抑制是否能降低耐药细胞中 PD-L1 的表达。
使用 BET 抑制剂 JQ1 和 BET PROTAC MZ1 处理亲本和耐药细胞,通过免疫印迹检测 PD-L1 表达。
确定调控 PD-L1 表达的具体 BET 家族成员。
使用 siRNA 敲低 BRD2 或 BRD4,通过免疫印迹、流式细胞术和 qRT-PCR 检测 PD-L1 表达;通过染色质免疫沉淀 (ChIP) 检测 BET 蛋白在 CD274 启动子上的富集。
验证 BRD2 是否也调控顺铂耐药细胞中 PD-L1 的表达。
在顺铂耐药细胞中转染 BRD2 或 BRD4 siRNA,通过免疫印迹检测 PD-L1 表达,并用 JQ1 处理验证 BET 抑制效果。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM 培养基 | Fisher | -- |
| 胎牛血清 | Gemini Bio products | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Life Technologies | -- | |
| 药物处理 | JQ1 | -- | -- |
| MZ1 | Tocris Bioscience | -- | |
| 流式分析 | PD-L1/PE-Cy7 抗体 | Biolegend | -- |
| PE-Cy7 同型对照 | Biolegend | -- | |
| Western blot | PD-L1 抗体 | CST | 13684 |
| β-肌动蛋白抗体 | Abcam | ab6276 | |
| BRD4 抗体 | Abcam | 128874 | |
| BRD2 抗体 | CST | 5848 | |
| 蛋白去糖基化 | PNGaseF | New England BioLabs | -- |
| RT-qPCR | RNAeasy 试剂盒 | Qiagen | -- |
| iSCRIPT cDNA 合成试剂盒 | Bio-Rad | -- | |
| SYBR Green 预混液 | Bio-Rad | -- | |
| Bio-Rad CFX96 循环仪 | Bio-Rad | -- | |
| RNA 干扰 | Lipofectamine RNAiMAX | Life Technologies | -- |
| 染色质免疫沉淀 | Active Motif 试剂盒 | Active Motif | 53040 |
| IgG 抗体 | CST | 3900 | |
| BRD2 抗体 | Active Motif | 61797 | |
| BRD3 抗体 | Active Motif | 61489 | |
| BRD4 抗体 | Active Motif | 39909 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 耐药细胞系建立 | 西妥昔单抗耐药克隆的生成方法、顺铂耐药克隆的生成方法、处理浓度和时间 阅读提示:Materials and Methods: Cell Lines and Reagents |
| 药物处理 | JQ1 和 MZ1 的处理浓度、处理时间 阅读提示:Results: BET inhibition suppresses PD-L1 expression |
| RNA 干扰 | siRNA 转染浓度、转染时间、siRNA 序列 阅读提示:Materials and Methods: RNA interference |
| 染色质免疫沉淀 | 细胞固定方法、抗体使用量、CD274 启动子引物序列 阅读提示:Materials and Methods: Chromatin Immunoprecipitation |