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在微生物组学研究中, 通过短读长测序已取得了一定里程碑式的发现，但由于读长的限制，重复的基因组区域或⾼度同源的区域会影响组装和⽐对⼯具的效率，尤其是对于宏基因组学研究[1-2]，样本复杂且样本间可能存在多个密切相关的菌株而不易进行分类，这些基因组间重复序列如果不同时测序其邻近区域，则很难通过计算解决。相比之下，长读长测序技术以其超长的测序读长及测序精度的提高，显著提升了进行高质量基因组组装的能力，例如16S长读长测序可实现更高分辨率的“种“鉴定，并且随着不同应用场景和微生物群落复杂度的增加，在群落结构和系统发育的分辨率上也明显优于短读长测序技术。除了读取的核苷酸序列长以外，长读长还可以同时读出5mC和5hmC6的CpG岛甲基化状态[3]，在表观遗传学研究中也有很好的应用。

法医技术在过去30多年飞速发展，其中NGS技术的引入可以一次性为案件提供更多的遗传学信息，为法医领域开拓了许多新的应用方向。但是随着案发现场生物物证特点的不断变化，比如微量物证越来越多，生物检材DNA的严重降解和混合等特点，限制了现有NGS方案的应用。而面对这些挑战，QIAGEN给出了三套成熟方案——颠覆性的Panel设计、10 pg微量样本直接建库和痕量核酸扩增，帮助研究人员面对不同的应用场景。

转录本异构体变异在真核生物细胞中普遍存在，通过选择性剪接和选择性聚腺苷酸化，可以从单个基因产生多个转录本异构体，并可编码具有不同结构和功能的蛋白质异构体。由于短读长RNA测序读长较短，在解析全长转录本异构体和复杂RNA加工事件的能力上受到很大限制。相比之下，长读长RNA测序技术可以直接读取超过10kb的序列，从而直接对全长转录本进行测序，因此在相关研究及应用领域愈发受到关注。此外，利用特殊的测序接头和信号识别算法，长读长RNA测序可以直接检测RNA表观修饰，如甲基化，探讨转录后水平调控基因表达相关机制[1]。

短串联重复（short tandem repeats, STRs）是人类基因组上广泛存在的一种以相对恒定的短序列为重复单元，串联形成长度可变的重复序列。STR常见的重复单元为2-6bp，约占人类基因组6.7%。目前已知47个基因STR的异常扩增可以导致疾病的发生，其中37个与神经系统疾病有关，10个与发育异常有关[1]。

长读长测序，又称第三代测序或单分子测序技术，以其更长的读长特点，在解析复杂基因组结构变异、甲基化研究、微生物基因组拼接等应用方向具有独特的优势。长读长测序过程中，除了核酸片段的完整性及纯度对文库的成功构建起着关键性作用外，对核酸的起始量也有着较高的要求。

IPA基于文献收录了1,300万条生物学证据和20万个公共数据，是一个全面综合的生物学意义挖掘工具。不仅能够查询基因功能、获取疾病的致病基因、富集信号通路，还可以解析上游调控因子、预测下游疾病和功能、构建调控网络、挖掘公共数据。本月开始，小编将定期解读CNS杂志的文献，跟大家一起学习文献的研究思路和IPA的使用技巧。

FFPE是癌症研究中一类常见的样本，但其样本制备和储存过程会因高温孵育、暴露氧化、核酸及蛋白分子间的交联、染色等导致其中的核酸质量下降，这对于本身就容易发生降解的RNA来说，高质量的RNA获取则更是难上加难。因此，RNA质量的提高，需要从前期组织样本获取、固定到石蜡包埋的每一环节入手。今天我们就带着大家进行逐步的详细分析，期待能够帮助大家从FFPE样本中得到高质量的RNA。

近日，由中国抗癌协会肿瘤标志专业委员会制订的《肿瘤DNA甲基化标志物检测及临床应用专家共识（2024版）》[1]重磅发布。该共识系统性地介绍了DNA甲基化标志物的基本概念、检测技术、临床应用范围及其在肿瘤筛查、辅助诊断、伴随诊断、复发监测和预后评估中的作用，旨在推动DNA甲基化标志物在肿瘤管理中的应用，提高临床医技人员及科研人员对其重要性的认识，同时规范检测流程，确保检测结果的准确性和可靠性。作为一份系统性介绍DNA甲基化标志物检测及临床应用的专家共识，其详细分析了DNA甲基化标志物的临床检测技术与平台、DNA甲基化标志物在肿瘤筛查、肿瘤辅助诊断、肿瘤伴随诊断中的应用。

近年来，长读长测序因其可准确读取复杂区域的序列结构、覆盖传统测序技术无法触及的区域而备受关注，它能够帮助获取更完整的基因组信息，并已在大基因组拼接、甲基化研究、全长转录组、大片段结构变异、突变鉴定以及微生物快速鉴定方面取得了诸多进展。在长读长测序过程中，核酸片段的完整性及纯度对文库的成功构建及结果分析的准确性非常重要。针对长片段DNA的提取，QIAGEN有多款基于磁珠法、阴离子交换树脂技术和盐析法的提取方案，能够通过简便快捷的操作步骤，实现从血液、细胞、组织、拭子、细菌或酵母等多种样本中提取高质量的长片段DNA，广泛应用于诸如人类Y染色体测序[1-2]、人类泛基因组测序[3]等多个重要相关研究项目。想要进一步了解这些试剂盒的独特之处吗？今天，小编就带着大家来一探究竟！

生物制品（Biological Products）已经被广泛应用于疾病预防、诊断和治疗药物的开发，包括家喻户晓的COVID-19疫苗、单克隆抗体和血液制品等。来源于人或动物细胞系的治疗用生物制品的病毒污染是用药安全的重要风险之一，ICH Q5A作为生物制品病毒安全性评估的国际监管指导文件，在2023年11月进行了版本更新，并计划于2024年6月14日开始生效。

针对MISEV2023，我们在前两期为大家解读了“EV的收集和预处理注意事项”以及“EV分离和浓缩”，今天我们就MISEV2023中的EV表征继续带来相关解读。EV内容物丰富，其中RNA是一种经常被研究的EV内容物分子之一。由于EV样本的特殊性，EV RNA的研究面临含量低等诸多挑战，基于此，我们也会在本文中给大家带来相应的解决方案。

人们对于美的追求从未停止，为了自己的“面子”，层出不群的护肤产品和技术让人眼花缭乱，但是依然无法缓解内心的焦虑。护肤的本质是激活表皮和真皮固有的创伤修复过程，从而抵抗皮肤的衰老或恢复老化的皮肤。今天，小编带您了解一下各大护肤品研发公司如何采用Ingenuity Pathway Analysis (IPA)从基因和生物学功能层面解读护肤的分子机理。

抗体偶联药物（ADC）将靶向特异性抗原的单克隆抗体与细胞毒性小分子药物结合，可以选择性杀死目标肿瘤细胞。近年来，国内外ADC药物靶抗原主要集中在HER2、TROP2、EGFR等热门分子。新靶抗原的选择通常需要考虑其表达谱特征（肿瘤细胞vs正常细胞）、亚细胞定位、细胞内吞作用等，从而最大限度的减少肿瘤外毒性。

你知道吗？QIAGEN经典游离核酸提取试剂盒，包括QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit  (#55114)、QIAamp ccfDNA/RNA Kit (#55184) 等方案，均能提取到cfDNA和cfRNA两种核酸。开展cfDNA+cfRNA多组学分析不需要额外的样本与纯化步骤，基因信息已尽在掌握。那么cfRNA的含量有多少呢？

肿瘤基因组的不稳定性，常常会导致基因组突变，从而表达具有特定突变的蛋白或多肽，这些分子被称为肿瘤新抗原。基于肿瘤新抗原开发肿瘤免疫治疗方法（CAR-T和mRNA疫苗）是当前非常热门的应用方向。对于新抗原的鉴定，除了采用NGS技术检测肿瘤患者特有的体细胞突变之外，人类白细胞抗原I类分子（HLA-I）将细胞内免疫肽呈递给T细胞，为新抗原的鉴定提供了理想的来源。

万众期待的第三版细胞外囊泡国际指南《Minimal information for studies of extracellular vesicles(MISEV2023): From basic to advanced approaches》来了！该指南主要作者为国际细胞外囊泡学会（ISEV）专家工作组，是在MISEV2014和MISEV2018版本中制定的标准和指导方针的基础上，加强了研究设计和实验细节，并为新的应用领域提出了建议和指导。

提取土壤RNA是环境或农业分子生物学研究中相当关键却又困难重重的一步，不仅因为RNA提取本身就相对困难，也是因为土壤中RNA的含量也相对更低。与DNA相比，土壤中RNA的含量通常仅有DNA的10-20%，因此为了满足下游检测的需求，就需要更多的土壤样本量。此外，更重要的是，土壤中含有较多代谢产生的腐殖酸或黄腐酸类抑制剂，且不同类型的土壤样本中抑制剂含量也存在差异，如果抑制剂去除不理想，则会进一步对下游PCR反应或NGS文库构建的效果产生影响。

FFPE样本是肿瘤研究常见且宝贵的生物学材料，近年来二代测序的飞速发展也将FFPE样本的信息挖掘提升到了提升到了极高的水平。有经验的研究人员都知道福尔马林固定、石蜡包埋条件、长期储存等因素都会导致核酸的降解，给下游的PCR及高通量测序带来很大挑战。那么还有哪些因素会影响FFPE样本中核酸的降解程度呢？来自美国Mayo Clinic的研究报道或许能给大家带来新的启发[1]。

翻译调控占调控事件的一半以上，是生命体内最重要的调控方式。翻译组测序（Ribo-seq）可以准确获取样本内的翻译状态，搭建从转录组学到蛋白组学之间的桥梁，因此翻译组在蛋白质组学、癌症研究、植物生物学等各研究领域都具有独特的创新能力。

4月23日，QIAGEN将受邀参加诺禾致源主办的“外泌体专题研讨会”，届时将邀请国内外泌体研究大咖为您带来一场外泌体研究学术盛宴，欢迎参加！