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一文读懂微生物基因组分型方法

这类样本，找对方法其实也不难

甲基化路线怎么选？BS与酶法转化新对比数据出炉

让我们一同欢迎Parse Biosciences的加入！

不止信号通路，多个角度解析感染性疾病的致病机理

快速入门基于NGS的感染机制研究

一文讲透病原NGS中的宿主核酸去除方案

解锁多场景科研难题！一份样本搞定多组学分析

在微量样本核酸提取这一基础关键环节中，除此前已详细介绍的微量样本的DNA提取方案外，RNA因其本身更容易被降解以及无处不在的内源性或外源性RNase，使得实验结果的可靠性和可重复性在一些微量样本的RNA提取中面临更多挑战。 RNeasy Micro系列便是可帮助您将这些难点一一击破的利器！该系列利用QIAGEN经典的硅胶膜技术，使用专用裂解和洗涤缓冲液，可保证从微量样本中稳定得到完整、高纯度的RNA，最低仅需10µl的洗脱体积也能够帮助获得浓度更高的RNA，更适合用于下游灵敏度要求更高的应用。

悄悄火起来的植物“外泌体”

血液游离DNA（cfDNA）相关的临床研究与应用已十分成熟，而尿液作为可以大量收集的体液样本，可以实现真正意义的无创采集，其研究数量却远低于血液。那么尿液cfDNA到底有何特殊之处，其研究的难点又是什么呢？

质粒是小型环状DNA分子，广泛存在于细菌等生物体中。质粒容易改造，是基因工程常见的载体，在合成生物学、蛋白工程与药物、细胞与基因治疗、疫苗研发及生产等领域具有广阔的应用前景。但是，质粒的质量控制往往被忽视，一些质粒存在设计或序列的错误，这会对质粒的应用产生负面影响，需要重视。CLC Genomics Workbench（CLC）是一款无需代码经验，具有图形化操作界面的软件，能够在质粒的设计和序列验证等阶段，帮助检测质粒质量，确保实验顺利。

空间转录组技术发展至今，主要用于解决阐明组织细胞类型组成、细胞间相互作用、组织成分间分子相互作用这三大类问题[3]，已被广泛用于神经病学、胚胎发育、炎症性疾病以及肿瘤微环境等多种类型的研究。

miRNA的发现起源于科学家对线虫的研究，随着miRNA研究不断推进，其在个体发育与疾病发生发展过程中的重要作用不断被揭示，具有极高的临床应用价值，因此一直是生命科学领域的研究热点。

近年来，由于液体活检侵入性较小以及可实现频繁或连续采样，从而能够持续跟踪肿瘤进展和治疗反应而备受关注。其中，细胞外囊泡（Extracellular Vesicles, EV）是由细胞释放的一种具有脂质双分子层的膜结构组成，其中含有多种内容物，包括脂质、蛋白质和RNA，因其能够真实反应活体细胞情况，而越来越多的用于生物标志物。有研究表明EV miRNA生物标志物Panel的诊断性能普遍优于单个生物标志物，并且EV miRNA在血浆中的诊断价值略高于血清[1]；也有研究通过对前列腺癌患者尿液miRNA差异表达分析，检测到10种尿液miRNA可以作为前列腺癌早期检测工具[2]。关于EV长链RNA，有研究者发现血液来源的EV中的长链RNA表达谱可以作为胰腺导管腺癌诊断的生物标志物，有效区分健康个体与恶性肿瘤患者[3]。

高效提取重金属污染矿区土壤中的DNA是发现重金属耐受菌属，重金属污染生物修复策略研究，以及揭示潜在重金属氧化还原过程等研究的基础和关键。与其它土壤生态环境相比，重金属污染土壤的pH较为极端、重金属浓度高、腐殖质含量高、且缺乏碳源氮源等营养物质，因此这类土壤样本中生物量较低且含有大量干扰DNA提取的抑制剂，直接使用试剂盒进行提取容易出现产量低且DNA 质量较差的问题。

结核分枝杆菌（Mycobacterium tuberculosis）是重要的全球性致病菌，由其引起的结核病是高致死性疾病。其标准株H37Rv于1998年完成测序，基因组大小约为4.4Mb，包含3,900多个蛋白编码基因，结核分枝杆菌分为7个主要谱系，目前已知的耐药基因包括embB、rpoB、gyrA等[1]。

血液样本由于其易于收集，伤害性小的特点而被广泛用于临床研究。在肿瘤等疾病的早筛研究中，RNA等生物标志物弥补了传统的影像学、生化指标方法的缺陷而备受关注。由于血液样本的特殊性以及RNA分子本身容易降解的不稳定性，更容易受到来自红细胞等多种来源RNase的影响。因此，针对血液样本中RNA的提取，除了需要能够从血液样本中成功对RNA进行分离外，也更加需要保障RNA分子不受降解。另外，血液采集后由于基因诱导、细胞凋亡的发生，使得血液中核酸的组成、数量、质量和完整性在几分钟内发生显著变化。

微量核酸样本通常因为过低的起始样本使用常规的实验方法无法完成核酸纯化，导致无法对珍贵的样本例如循环肿瘤细胞、激光显微切割样本等进行研究。Nature Cancer 曾发表的题为 Personalized circulating tumor DNA analysis as a predictive biomarker in solid tumor patients treated with pembrolizumab 的研究成果，发现肿瘤释放到血液中的微量循环肿瘤 DNA（ctDNA）的水平变化能够预测患者的免疫治疗疗效[1]。这项发现为免疫治疗打开了新的突破口，微量核酸样本的成功提取也为珍稀样本带去新的研究方向。

近日，包括QIAseq FX DNA Library Kit、QIAseq FastSelect rRNA/Globin Kit、QIAseq miRNA Library Kit、QIAseq Panel和CLC LightSpeed等在内的QIAGEN多套NGS成熟方案在真迈生物高通量基因测序平台上完成了测试，双方携手旨在为全球客户提供完整的NGS解决方案来推进基因组学应用，共同加快科学界基因组应用的发现、提高成本效率并缩短实验周期。