如何来设定转录组测序中的生物学重复
1.区分生物学重复与技术重复生物学重复:指样本重复,比如3只小鼠,同时做一种处理,就是三个生物学重复。技术重复:一般是三次实验,比如对一块组织,提了三次RNA,做三次realtime。2.设置生物学重复的意义由于新一代测序技术的优越性以及高成本,曾一度忽略了“生物学重复”的重要性。但生物学重复对于测序实验的设计以及实验数据的解读和分析都非常重要。设置生物学重复:能够消除组内误差:生物学重复可以测量变异程度增强结果的 ...
来源:美吉生物 18894 阅读
【转帖】shRNA序列的设计方法
短发夹RNA (small hairpin RNA,shRNA)可在细胞中被加工成siRNA。设计shRNA时,shRNA中两个反向重复序列的设计原则与siRNA序列的设计相同(可参考Transheep SiRNA序列的设计方法),需要重点考虑的是shRNA 环序列的长度及组成,而且环序列不能与靶基因内的其它序列具有同源性。1 .shRNA环序列的长度一般来讲,设计shRNA时选择3~10 nt长度的发夹环均可。Brummelkamp等& . ...
来源:丁香园论坛 10607 阅读
转录因子,研究新时尚
● 转录因子与2012年诺贝尔奖2012年的诺贝尔生理学或医学奖得主山中伸弥,在小鼠成纤维细胞中表达Oct3/4、Sox2、c-Myc以及Klf4四种转录因子,将成纤维细胞逆转形成多能干细胞(iPS),进一步揭示了转录因子在生物学研究中的重要研究价值。每年的诺贝尔奖都会受到举世瞩目,而其获奖内容亦会引领新一轮新的研究热潮。不想out的科学家们,你们还在等什么?!● & ...
来源:互联网 9185 阅读
转录因子研究——为论文加“分”
什么是转录因子? 0 0); font-family: arial; font-size: 13px; line-height: 18px;"● 转录因子(Transcription factor,TF)是一类能与特异性DNA序列结合并调节基因转录的调控蛋白。 0 0); font-family: arial; font-size: 13px; line-heig ...
来源:互联网 7292 阅读