Hello,300pg/μL-3fg/μL——超灵敏E. coli残留DNA定量试剂盒
大肠杆菌(Escherichia coli,E. coli)是一种革兰氏阴性杆状细菌,是肠道微生物群中的一员,普遍存在于动物和人类肠道中的细菌,其中某些菌株对人体有益,并在肠内协助食物消化、合成维生素等方面发挥作用。大肠杆菌作为重要的模式生物,因具有易于培养、生长快速、基因工程易操作等特点,成为药用领域如重组蛋白药物、基因治疗药物、mRNA/DNA疫苗、合成生物产品的“细胞工厂”,比如多肽类激素、细胞因子、疫苗组分、质粒DNA,小分子药物等的前体或中间体。但E. coli宿主细胞DNA(Host Cell DNA, HCD)是这些生物制品的主要残留,对人体健康存在潜在风险,因此,在大肠杆菌系统生产的产品中,需要对E. coli宿主细胞DNA进行质量研究和严格控制。
科学家利用大肠杆菌进行基因克隆、蛋白质表达,使其成为工业生产上应用最为广泛的菌种之一,尤其是在医疗领域上的应用,用来生产各种诸如多肽类激素、细胞因子、疫苗组分等(部分药品情况见下表中)。
部分国内获批利用大肠杆菌表达的药物/疫苗及其公司
如今,基因疗法药物、mRNA 疫苗以及DNA疫苗均是通过质粒DNA生产,通常情况下,大规模GMP质粒DNA(Plasmid DNA, pDNA)常在工程化大肠杆菌(E. coli)中发酵生产,一般工艺流程为: 载体构建→种子库的建立→发酵→收集菌体→裂解细胞固液分离→澄清与浓缩→分离纯化→产品质量控制→分装(大体流程见下图),整个流程需要优化生产纯化工艺以满足治疗药物生产所需质量要求,特别是控制Host Cell DNA(E. coli)的残留。
质粒DNA的生产过程
近些年,随着生物学、生物信息学、计算机科学、化学等学科新技术和工程手段的涌现,推动合成生物学研究和应用领域大为扩展,这使大肠杆菌发展成为合成生物制造领域非常重要的底盘细胞。针对化学合成或天然提取的小分子药物,通过设计全新的细胞内代谢途径,合成生物学可以使高附加值的小分子药物能够通过大肠杆菌等细胞利用廉价的糖类等原料进行合成,例如:抗肿瘤的紫杉醇前体、抗疟疾前体、西他列汀中间体、度鲁特韦中间体等。
综上,大肠杆菌已成为医药领域重要的“细胞工厂”,在医药领域应用越来越广,对其产品的质量控制也尤为关键。为支持这些大肠杆菌生产的药物/原料的质量研究和控制,ACROBiosystems百普赛斯基于定量PCR法,专门设计开发了针对Host Cell DNA(E. coli)的超灵敏残留DNA定量检测试剂盒resDetect™ E. coli resDNA Quantitative Kit (qPCR)(货号:OPA-O002),定量范围300pg/μL-3fg/μL,能够专一快速的对中控样品或原液成品resDNA进行准确定量。
● 高灵敏度:LLOQ达到3 fg/µL (竞品T的LLOQ为30 fg/µL)
High sensitivity and broad dynamic range using the ACRO resDetectTM E.coli resDNA Quantitative Kit (qPCR) (Cat. No. OPA-O002). Typical analysis results obtained with Standard 1 (300 pg/μL) to 6 (3 fg/μL).
● 高特异性:与无关DNA无交叉反应
Assay specificity. Standard curves generated using 10-fold serial dilution of E. coli genomic DNA (included in the kit).
● 高一致性:在不同DNA片段大小范围内保持一致的性能
Consistent quantitation across a broad range of fragment sizes. Standard curves were generated using a 10-fold serial dilution of gDNA and fragmented DNA. Fragmented DNA was generated by sonicating total E. coli genomic DNA (8min, 13min, 20min). Fragmentation of the DNA was confirmed by agarose gel analysis.
● HEK293 resDNA Quantitation Kit (qPCR)
● HEK293T resDNA Quantitation Kit (qPCR)
● E1A resDNA Quantitation Kit (qPCR)
● E1A & SV40LTA resDNA Quantitation Kit (qPCR)

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