文献信息 Title:Pu C, Liu H, Ding G, et al. Impact of direct application of biogas slurry and residue in fields: in situ analysis of antibiotic resistance genes from pig manure to fields[J]. Journal of Hazardous Materials, 2017. Journal of Hazardous Materials杂志影响因子if=6.0650 研究背景 本文主要研究沼液和沼渣中的抗生素耐药菌(ARB)和抗生素抗性基因(ARGs)对农田的影响。 方法 高通量定量PCR(HT-qPCR) 在Applied Biosystems ViiA TM 7 Real-Time上进行HT-qPCR分析PCR系统(启因生物,上海)。 320个经过验证的引物组,针对7个主要类别的ARGs 和3个转座子基因和一个16S rRNA基因。进行HT-qPCR分析,并且根据准确的实验原始数据做了分析。 研究结果 从猪粪到田间培养的ARB数量 从猪粪到田间培养的细菌总数为1.5×10 6 CFU / g至2.2×10 8 CFU / g。厌氧消化后,对7种抗生素耐药的细菌在沼渣中富集(5.8倍〜270倍)。排出的沼液对ERY,VAN和STR的耐药菌数比猪粪高2.6〜63倍。结果表明,厌氧消化加速了这些培养的抗生素抗性微生物群体的增殖。但厌氧消化后部分细菌的耐药率明显下降。
猪粪(PM),初始沼液(IBS),出水沼液(DBS),沼渣(BR),排出沼液和残渣(DBSRS)和对照处理的土壤中培养的ARB的丰度。 目标抗生素包括磺胺甲氧基哒嗪(SUL),四环素(TET),诺氟沙星(NOR),红霉素(ERY),万古霉素(VAN),头孢噻肟(CTX)和链霉素(STR)。 误差线是标准偏差。 ARG和转座子基因的相对丰度 1.从猪粪到田间ARG总相对丰度为3.02×10-1至9.07×10-1。 48个ARG的相对丰度在10-3以上(ARG和样品).
猪粪中含量最多的ARG(> 10-3)的相对丰度领域。 2.排出的沼液和沼渣处理的土壤中ARG的总相对丰度比对照高21倍
猪粪(PM),初始沼液(IBS),排出沼液(DBS),沼渣(BR),排出沼液和残渣(DBSRS)和对照处理的土壤中检测到的ARG的相对丰度。 ARG,转座子和细菌群落的相关性 为了探索ARG之间的共现模式,构建了一个网络 基于Spearman相关分析(R2> 0.80,P <0.01)。 ARG和转座子基因与(B)ARG和微生物群落之间的相关性的网络分析。 结果总结: 长期施用含有抗生素的沼液和沼渣,可增加田间的ARB和ARG。
本次研究中启因生物利用高通量荧光定量PCR技术服务,承担了抗性基因的检测及数据分析的部分。
启因生物,专业高通量荧光定量PCR服务商,目前是国内唯一一家提供抗性基因检测的公司。抗性基因检测合作的客户包括北京大学环境学院,清华大学环境学院,中科院土壤所,中科院生态所,同济大学环境学院,南京大学环境学院,上海交通大学等重点单位。
|