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        不满足HW平衡的位点处理

        相关实验:细胞凝集反应与细胞膜的渗透性

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        zhouzi肘子

        各位老师,我分析了33个SNP位点,但是有7个不符合HW平衡,意思是我分析的人群不够有代表性吗?请问不满足HW平衡的位点是应该剔除吗?感谢赐教!!

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        3 个回答

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        huarenqiang5

        有帮助

        不足HW平衡的位点建议进行踢出。

        user-title

        zhouzi肘子user-title

        老师您好,请问我写的时候,是第一步写所有位点进行了检测,然后剔除了不符合的位点吗? 33个位点有8个不符合,会显得我人群没有代表性吗?

        user-title

        loveliufudan

        有帮助

        不符合HW平衡的SNP位点可能有以下几种原因:

        抽样误差:由于样本量太小或者抽样方法不恰当,导致基因型频率与理论值不一致。

        选择压力:由于某些基因型具有适应性优势或劣势,导致其频率发生变化。

        突变:由于某些基因发生突变,导致新的等位基因出现或消失。

        迁移:由于某些个体从一个种群迁移到另一个种群,导致两个种群的基因流动。

        非随机交配:由于某些个体倾向于与相同或不同基因型的个体交配,导致杂合子过多或过少。

        在病例-对照研究中,通常会对SNP位点进行HW平衡检验,以减少抽样偏倚。如果发现某个SNP位点在对照组中不符合HW平衡,则可以考虑剔除该位点。但是,在剔除之前,还需要考虑其他可能影响结果的因素,比如实验质量、数据清洗、人口结构等。

        user-title

        土井挞克树

        有帮助

        应该剔除掉的,然后选择有代表性的样本

        user-title

        zhouzi肘子user-title

        老师您好,因为研究的人群已经确定了,我在书写时候应该写8个不符合剔除了,还是先把这些位点删了,说所有位点符合呢?因为担心不符合的占8/33这个比例好高啊

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