对提取出的人的全基因组DNA进行琼脂糖凝胶电泳，胶孔总会很亮，仿佛有DNA的残留，未完全跑下来，为什么？

主要从以下两个方面考虑：1、PCR产物自身原因：往往由于酶量过多或酶的质量差,dNTP浓度过高,Mg2+浓度过高,退火温度过低,循环次数过多,而造成PCR的非特异性产物

因为里面还有一些更大的dna，因为人类基因组约3.1Gb，不仅大，且有的区域核苷酸组成不均匀、，所以有些大的没有跑下来是正常的。

有可能是胶孔不干净；有可能是片段太大，例如基因组DNA，比较容易卡孔；还有可能是DNA上有蛋白结合，有时候用有些扩增长片段的聚合酶，容易卡孔，我觉得就是酶跟DNA结合很紧密，导致最后PCR产物卡孔。

有可能是含有基因组DNA等大片段DNA，或者含有DNA-蛋白复合体，使得DNA无法通过琼脂糖，就卡在上样孔了