• 我要登录|
  • 免费注册
    |
  • 我的丁香通
    • 企业机构:
    • 成为企业机构
    • 个人用户:
    • 个人中心
  • 移动端
    移动端
丁香通 logo丁香实验_LOGO
搜实验

    大家都在搜

      大家都在搜

        0 人通过求购买到了急需的产品
        免费发布求购
        发布求购

        关于ATAC-STARR-seq

        相关实验:传递基因进皮肤的基因枪技术

        user-title

        加勒比海岛盗比比

        请求大佬解答这段文字。ATAC-STARR-seq大致是个什么操作流程?如果看结果?谢谢大佬们!图片描述

        wx-share
        分享

        2 个回答

        user-title

        土井挞克树

        有帮助

        先确定时间位点

        然后根据时间位点进行对比表达情况

        鉴别染色质开放位点

        user-title

        loveliufudan

        有帮助

        ATAC-STARR-seG是一种用于鉴定活性基因调控元件的技术。以下是大致的操作流程:

        ATAC-Seq:使用启动子特异性引物,对某个细胞系进行ATAC-Seq,鉴定出开放染色质区域。

        STARR-seG:使用基因启动子序列(或其他感兴趣的调控元件序列)和高通量测序技术,鉴定出与这些序列相互作用的转录因子。

        ATAC-STARR-seG:将上述两个步骤相结合,将启动子序列和ATAC-Seq鉴定的开放染色质区域相结合,鉴定出与这些区域相互作用的转录因子,并评估它们对基因表达的影响。

        DESeq2-based approach:使用差异分析方法,比较不同实验条件下活性STARR-seG位点的RNA输出,确定哪些位点与特定条件下的基因表达变化相关。

        结果分析:通过对ATAC-STARR-seG的结果进行分析,可以鉴定出与某些调控元件相互作用的转录因子,并评估它们对基因表达的影响。

        如果想要看ATAC-STARR-seG的结果,可以根据研究论文或者技术报告中给出的分析方法和结果进行分析。一般来说,这些结果包括活性STARR-seG位点的位置、与其相互作用的转录因子、RNA输出、差异分析结果等。

        ad image
        提问
        扫一扫
        丁香实验小程序二维码
        实验小助手
        丁香实验公众号二维码
        扫码领资料
        反馈
        TOP
        打开小程序