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        染色质为什么要片段化,片段化长度是多少

        相关实验:免疫沉淀

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        dxy_9rzpgqf2

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        2 个回答

        user-title

        府宅

        有帮助

        一般片段化的大小在200-1000bp,一般300-600bp均能获得较好的ChIP结果。如果小于200bp的话,蛋白的结合位点很有可能被打断,原因是由于每个核小体结合DNA的序列长度为175bp,加上不同核小体间的linker DNA序列,这样每个核小体结合DNA的最小序列大概在200bp左右,如果片段长度大于1000bp,您将会分离获得包含目标序列的DNA,但所要研究的蛋白可能会离您目标序列有700个核苷酸的距离;如果过度片段化可能破坏抗原表位降低PCR效率,片段化不全导致样本丢失,可能会获得假阴性结果。

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        dxy_gwrp7ndq

        有帮助

        染色质片段化的目的是确保高分子量染色质的蛋白质/DNA复合物是可溶的,能被ChIP抗体接近,为确保染色质免疫共沉淀(ChIP)实验有良好精度

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