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求教,我跑的qpcr,同一组引物却有不同的Tm值,可能是什么原因?

相关实验:实时荧光定量 PCR(realtime PCR)

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dxy_ud0dpda4

第一个峰是NTC,后面的全是样本的,跑了好几次,试剂耗材每次都是用新的,但每次都是这个结果,引物的特异性也很好。

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3 个回答

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土井挞克树

有帮助

可能是计算方法不同,Tm值相差太大可以进行Touchdown摸索最佳的反应温度。

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huarenqiang5

有帮助

可能原因

1.引物特异性过差导致非特异性产物扩增。

2.gDNA污染。

3.退火温度太高。

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loveliufudan

有帮助

如果同一组引物有不同的Tm值,可能有以下原因:

1. 引物特异性:虽然你已经检查了引物特异性,但有可能引物在某些条件下与非目标序列发生了结合,产生了意外的扩增产物。这种情况下,可能会看到不同的Tm值。你可以通过设计新的引物或优化你的PCR条件来解决这个问题。

2. PCR产物的异质性:有可能在PCR反应中生成了不同长度或序列的扩增产物,导致Tm值不同。这可能是由于模板DNA的异质性或引物结合位点的变异。

3. 载体污染:在某些情况下,可能有引物自我连接或引物与载体DNA连接形成的背景噪音。

4. 实验条件:不同的PCR缓冲液、dNTPs、引物浓度以及循环条件可能影响扩增效率和特异性,进而影响Tm值。

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