对同一个物质同时使用LC-MS 和GC-MS检测，前处理需要一样吗？
远方_oe7m
做的非靶向代谢组学，对同一个物质同时使用LC-MS 和GC-MS检测，在不同的文献中分别找到了这个物质的LC-MS前处理和GC-MS 前处理，有一个问题就是两篇文献中对代谢物的提取方法除了GC-MS前处理需要衍生化以外，在衍生化之前的代谢物提取步骤也不同。这样的话我可以按照两个方法来做吗，还是说LC-MS和GC-MS的前处理一样，只是对GC-MS的前处理加一个衍生化？
两个方法步骤如下：
1、取样品30mg放入1.5mlEP管→加入两个4mm钢球→加入20μL内标→加入600μL甲醇：水（4:1）→-80℃，放置2min→60HZ超声2min→加入120μL氯仿→剧烈涡旋→环境温度下超声提取10min→4℃放置10min→4℃，13310g离心10min→取上清，冻干→衍生化
2、取样品60mg放入1.5mlEP管→加入200μL水，涡旋2min→加入800μL甲醇：乙腈（1:1，含内标）→涡旋2min→两次低温超声处理（30min）→-20℃放置1h→4℃，14000g离心20min→取上清，冻干
4 个回答
土井挞克树
步骤是一样的，lc和gc分开进行衍生化就可以
麻黄连翘赤小豆
对同一种物质的样品前处理是不同的处理
loveliufudan
对于非靶向代谢组学中的LC-MS和GC-MS前处理方法，一般情况下是可以按照各自的方法进行处理的。LC-MS和GC-MS在仪器类型、检测原理和代谢物特性等方面存在差异，因此其前处理步骤可能会有所不同。
您提到的两个方法的前处理步骤在代谢物提取阶段就存在差异，其中GC-MS前处理还需要进行衍生化步骤。基于这些差异，您可以按照各自的方法进行前处理，即根据LC-MS的方法进行代谢物提取，而对于GC-MS的方法则按照其衍生化和提取步骤进行操作。
需要注意的是，确保在操作时注意相关的实验条件和注意事项，以确保各个步骤的准确性和可重复性。此外，在数据分析时，还需考虑到两种方法的差异，比如校准曲线的构建和质谱数据的处理等。
huarenqiang5
建议前处理一样这样能较好的进行对比分析。
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