关于构建GSMM过程中粗模型的构建

构建GSMM模型时，需要收集的数据信息包括：代谢物质的组成、反应物质的组成、反应物质之间的反应关系、反应物质之间的代谢通路关系、代谢物质之间的代谢通路关系等

在构建基于约束的代谢模型（GSMM）的过程中，您需要在 Excel 表格中收集以下信息：

代谢产物及反应列表：这是构建任何代谢模型的基础。它包括生物体所使用的代谢产物、代谢反应以及它们之间的关系。

反应方程式：每个代谢反应都可以用化学反应方程式来描述。这个方程式应该包括反应的底物、产物、反应条件（如温度和 pH 值）和催化剂。

反应通量：这是指每个反应在模型中的通量或速率。这些通量可以根据生物体的代谢数据或文献报道来估算。

基因注释信息：这是指将基因与反应联系起来的信息。在 GSMM 中，每个反应都需要指定哪些基因参与了该反应，以及这些基因的表达水平。这些信息可以从生物体的基因组数据中获取。

约束条件：这是指在模型中添加的限制条件，以反映真实的代谢环境。例如，代谢反应可能受到生长率、底物浓度、产物浓度等因素的限制。

代谢通路图：这是一个图形化的表示，展示了生物体的代谢通路和反应。这有助于理解模型中不同反应之间的联系和依赖关系。

需要收集基因、反应、代谢物，药物，时间等基本信息