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        怎么找到一个基因的终止子

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        透过骨子里的傲

        已经在NCBI上找到这个基因的3’端和下个基因起始密码子中间的一段,但是怎么确定具体的位置

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        3 个回答

        user-title

        土井挞克树

        有帮助

        可以用引物来找,引物互补可以帮助定位。

        user-title

        huarenqiang5

        有帮助

        第一步 打开NCBI gene,键入搜索词

        打开NCB(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/),选择Gene数据库,输入基因名词检索时,需要键入或者筛选物种信息,在这里选择人源的。

        第二步 查看Genomic regions, transcripts, and products点击链接后,会有总结(Summary)、该基因在基因组上下游的基因位置信息(Genomic context)、各组织器官的表达谱(Expression)和生物学功能(Bibliography)等信息,而我们需要注意的是Genomic regions, transcripts, and products一栏。

        第三步 查看具体序列信息点击在上图中右上的Tools的Sequence Text View里面可以直观的看到基因的序列与结构。图中蓝色代表非翻译区(UTR),粉红代表蛋白质编码区。绿色代表内含子,蓝色和粉红色共同代表了上图中的方框区域(也就是成熟mRNA序列)。

        user-title

        loveliufudan

        有帮助

        确定基因的终止子需要结合基因的基因组序列和转录本注释信息。以下是一些可能的方法:

        在NCBI的基因页面中查找基因的基因组定位信息。在基因页面的“Summary”部分,可以找到基因组定位信息,包括染色体号、基因的起始位点和终止位点。

        利用基因组浏览器查找基因的终止子。通过NCBI的基因组浏览器或其他基因组浏览器,可以在基因组上查找基因的位置并确定基因的终止子。在基因组浏览器中可以选择相应的物种和基因名称,然后浏览对应的基因组区域,最终找到基因的终止子。

        利用转录本注释信息确定基因的终止子。NCBI和其他数据库中提供了丰富的基因和转录本注释信息。在基因页面的“GeneView”部分,可以查找到各个转录本的位置和具体信息。通过查找转录本的终止位点,可以推断出基因的终止子位置。

        需要注意的是,基因的终止子位置可能存在多个不同注释版本,需要仔细查看注释信息和参考文献,确保找到正确的终止子位置。

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